More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2272 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  100 
 
 		 253 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  100 
 
 		 253 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2033  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  99.6 
 
 		 253 aa  509  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  83.94 
 
 		 250 aa  431  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  77.82 
 
 		 250 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  77.2 
 
 		 250 aa  388  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  77.02 
 
 		 250 aa  385  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  77.02 
 
 		 250 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  77.37 
 
 		 247 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  77.42 
 
 		 250 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  77.42 
 
 		 250 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  77.42 
 
 		 250 aa  386  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  77.42 
 
 		 250 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  77.42 
 
 		 250 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  77.42 
 
 		 250 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  77.42 
 
 		 250 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  77.42 
 
 		 250 aa  385  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  76.61 
 
 		 250 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  76.54 
 
 		 247 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  74.69 
 
 		 251 aa  371  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0242  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  74.49 
 
 		 249 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762427  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  73.68 
 
 		 252 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  73.68 
 
 		 252 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  73.88 
 
 		 252 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  73.68 
 
 		 252 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  67.74 
 
 		 253 aa  332  4e-90  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  61.73 
 
 		 243 aa  298  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2910  ABC transporter related  60.16 
 
 		 246 aa  298  6e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  59.11 
 
 		 244 aa  295  5e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  60.98 
 
 		 243 aa  295  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  60.57 
 
 		 243 aa  290  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  60.98 
 
 		 243 aa  289  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  61.38 
 
 		 243 aa  289  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  59.68 
 
 		 256 aa  288  8e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  58.13 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  57.37 
 
 		 256 aa  285  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  58.37 
 
 		 243 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  57.94 
 
 		 255 aa  284  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  58.3 
 
 		 242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  58.68 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  57.6 
 
 		 244 aa  281  9e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.25 
 
 		 245 aa  281  9e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  54.25 
 
 		 245 aa  280  1e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2343  ABC transporter related  56.73 
 
 		 245 aa  280  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185697  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  57.2 
 
 		 252 aa  279  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  54.22 
 
 		 252 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  59.18 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  56.73 
 
 		 240 aa  278  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.22 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  55.16 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  57.2 
 
 		 263 aa  277  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  57.03 
 
 		 246 aa  276  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.37 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  58.37 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  58.37 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.37 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  57.09 
 
 		 256 aa  276  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  55.65 
 
 		 253 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 244 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  58.37 
 
 		 243 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  57.96 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2602  ABC transporter related  53.41 
 
 		 248 aa  276  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 244 aa  276  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  59.18 
 
 		 241 aa  275  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 244 aa  275  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  56.73 
 
 		 240 aa  275  5e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  56.56 
 
 		 248 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  55.24 
 
 		 242 aa  274  8e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.68 
 
 		 244 aa  274  8e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.96 
 
 		 240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  55.51 
 
 		 240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  55.82 
 
 		 242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  55.82 
 
 		 242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  56.56 
 
 		 248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.96 
 
 		 240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  56.22 
 
 		 254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.68 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.55 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.68 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  57.14 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  57.96 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.55 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  56.05 
 
 		 260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  54.29 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13310  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.26 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  54.03 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  56.28 
 
 		 253 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  57.68 
 
 		 244 aa  272  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 240 aa  272  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  57.14 
 
 		 260 aa  272  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  57.14 
 
 		 241 aa  272  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  56.91 
 
 		 263 aa  271  5.000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  55.1 
 
 		 240 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  55.1 
 
 		 240 aa  271  6e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 256 aa  271  7e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0791  ABC transporter related protein  53.66 
 
 		 251 aa  271  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  56.73 
 
 		 240 aa  271  7e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  56.33 
 
 		 240 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>