More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0358 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  100 
 
 
243 aa  484  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  77.78 
 
 
243 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  78.19 
 
 
243 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  73.25 
 
 
243 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  72.43 
 
 
243 aa  360  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  70.78 
 
 
243 aa  355  5e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  69.71 
 
 
244 aa  345  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  70.12 
 
 
253 aa  344  7e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  69.55 
 
 
243 aa  342  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  66.25 
 
 
252 aa  325  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  66.67 
 
 
278 aa  321  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  64.58 
 
 
251 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  65.27 
 
 
248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  64.44 
 
 
248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  62.4 
 
 
267 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4025  ABC transporter related  65 
 
 
251 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4341  ABC transporter related  65 
 
 
251 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  61.25 
 
 
260 aa  296  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2743  ABC transporter related  64.85 
 
 
248 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  62.45 
 
 
255 aa  295  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  62.86 
 
 
267 aa  294  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.25 
 
 
250 aa  293  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  60.42 
 
 
260 aa  293  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  59.76 
 
 
251 aa  293  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  58.33 
 
 
240 aa  291  5e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  58.33 
 
 
240 aa  291  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  57.6 
 
 
256 aa  290  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  60.83 
 
 
250 aa  290  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  58.33 
 
 
244 aa  290  2e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  57.08 
 
 
240 aa  288  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.18 
 
 
250 aa  288  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  58.75 
 
 
242 aa  288  5.0000000000000004e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  58.33 
 
 
240 aa  288  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  58.63 
 
 
253 aa  287  9e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  58.33 
 
 
240 aa  287  9e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  58.33 
 
 
239 aa  287  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  58.75 
 
 
246 aa  287  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  57.96 
 
 
259 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.13 
 
 
253 aa  286  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  61.07 
 
 
252 aa  286  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.13 
 
 
253 aa  286  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  58.33 
 
 
252 aa  286  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  59.48 
 
 
243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  60.25 
 
 
256 aa  285  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  60 
 
 
254 aa  285  7e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.83 
 
 
250 aa  284  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.83 
 
 
250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2033  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.72 
 
 
253 aa  282  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.83 
 
 
250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.83 
 
 
250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 
240 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 
240 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 
240 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  58 
 
 
263 aa  281  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  58.09 
 
 
244 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 
240 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 
240 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.42 
 
 
240 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.42 
 
 
240 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  55.83 
 
 
240 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  56.22 
 
 
254 aa  281  9e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 
240 aa  280  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 
240 aa  280  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  55.42 
 
 
240 aa  280  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  55.42 
 
 
240 aa  280  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 
240 aa  280  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 
240 aa  280  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.42 
 
 
250 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  58.51 
 
 
249 aa  280  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  56.25 
 
 
244 aa  280  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 
240 aa  279  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  58.8 
 
 
267 aa  279  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.02 
 
 
260 aa  280  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  57.92 
 
 
240 aa  279  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  61.25 
 
 
253 aa  279  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  61.02 
 
 
265 aa  279  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 
240 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  58 
 
 
254 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  57.68 
 
 
244 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 
240 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 
240 aa  279  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.37 
 
 
250 aa  279  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 
240 aa  279  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  58 
 
 
250 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  59.26 
 
 
258 aa  279  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  57.5 
 
 
240 aa  278  4e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.37 
 
 
250 aa  279  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.37 
 
 
250 aa  279  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.37 
 
 
250 aa  279  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 
247 aa  278  4e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  58.8 
 
 
260 aa  278  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.37 
 
 
250 aa  278  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  56.67 
 
 
246 aa  278  7e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  54.58 
 
 
240 aa  278  7e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  56.96 
 
 
242 aa  278  7e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  57.6 
 
 
273 aa  278  7e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.96 
 
 
250 aa  277  9e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  54.17 
 
 
246 aa  277  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  58.9 
 
 
261 aa  276  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  56.25 
 
 
240 aa  277  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>