More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0234 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  494  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  71.6 
 
 		 243 aa  358  4e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  71.6 
 
 		 243 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  71.6 
 
 		 243 aa  353  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  69.14 
 
 		 243 aa  347  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  69.55 
 
 		 243 aa  342  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  69.14 
 
 		 243 aa  338  5.9999999999999996e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  68.46 
 
 		 253 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  68.2 
 
 		 244 aa  333  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  67.78 
 
 		 278 aa  325  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  67.78 
 
 		 251 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  66.95 
 
 		 252 aa  322  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4025  ABC transporter related  68.2 
 
 		 251 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4341  ABC transporter related  68.2 
 
 		 251 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  63.93 
 
 		 251 aa  314  6e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  64.83 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  64.85 
 
 		 248 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2743  ABC transporter related  64.83 
 
 		 248 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  62.6 
 
 		 247 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  61.89 
 
 		 247 aa  299  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  61.51 
 
 		 240 aa  299  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  61.32 
 
 		 250 aa  298  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  61.04 
 
 		 267 aa  298  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  61.73 
 
 		 253 aa  298  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  61.73 
 
 		 253 aa  298  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  61.89 
 
 		 252 aa  297  8e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  61.89 
 
 		 252 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  61.89 
 
 		 252 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  64.52 
 
 		 254 aa  296  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  60.67 
 
 		 240 aa  296  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  62.3 
 
 		 267 aa  295  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  60.67 
 
 		 240 aa  295  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 240 aa  295  6e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 240 aa  295  6e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  61.48 
 
 		 252 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 240 aa  295  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2033  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  61.32 
 
 		 253 aa  294  7e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 		 240 aa  294  9e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  60.67 
 
 		 240 aa  294  9e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 240 aa  293  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 		 240 aa  293  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  62.04 
 
 		 255 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 240 aa  293  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.83 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.83 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  58.58 
 
 		 240 aa  292  4e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  56.22 
 
 		 263 aa  291  5e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  59.41 
 
 		 240 aa  291  5e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  61.45 
 
 		 255 aa  290  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  57.2 
 
 		 263 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  56.07 
 
 		 240 aa  289  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  60.73 
 
 		 254 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  59.68 
 
 		 260 aa  288  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  58.06 
 
 		 256 aa  288  4e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  59.92 
 
 		 248 aa  288  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  57.66 
 
 		 259 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  57.83 
 
 		 250 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  61 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  58.09 
 
 		 252 aa  287  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  59.83 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  57.03 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  59.41 
 
 		 240 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0242  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.61 
 
 		 249 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762427  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  58.82 
 
 		 244 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  57.03 
 
 		 250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  58.58 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.67 
 
 		 250 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.67 
 
 		 250 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.67 
 
 		 250 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  60.08 
 
 		 244 aa  285  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  59.84 
 
 		 261 aa  285  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.76 
 
 		 250 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  60.17 
 
 		 244 aa  284  7e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  57.26 
 
 		 253 aa  284  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  62.71 
 
 		 267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  59.04 
 
 		 260 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  58.16 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  56.9 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  59 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  56.9 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.26 
 
 		 250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.26 
 
 		 250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.26 
 
 		 250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  59.17 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  55.65 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.26 
 
 		 250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.85 
 
 		 250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  58.58 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  58.68 
 
 		 245 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  59 
 
 		 242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.85 
 
 		 250 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.26 
 
 		 250 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  60.33 
 
 		 246 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  59.09 
 
 		 244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  58.85 
 
 		 250 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  58.16 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  58.16 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  58.61 
 
 		 252 aa  281  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  55.65 
 
 		 242 aa  281  6.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>