More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5576 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
254 aa  512  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  65.74 
 
 
260 aa  350  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  65.08 
 
 
260 aa  348  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  63.78 
 
 
254 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  67.73 
 
 
267 aa  347  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  64.26 
 
 
250 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  64.26 
 
 
250 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  67.35 
 
 
273 aa  342  4e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  67.34 
 
 
258 aa  341  7e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  66.14 
 
 
263 aa  339  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  62.65 
 
 
256 aa  331  8e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  65.75 
 
 
254 aa  330  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  62.25 
 
 
268 aa  326  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  61.42 
 
 
274 aa  324  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  64.66 
 
 
252 aa  323  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  63.1 
 
 
264 aa  322  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  63.78 
 
 
262 aa  322  5e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  63.49 
 
 
263 aa  319  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  61.81 
 
 
267 aa  318  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  61.81 
 
 
255 aa  318  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  60.87 
 
 
259 aa  315  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  63.31 
 
 
254 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  60.96 
 
 
261 aa  312  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  59.68 
 
 
254 aa  309  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  58.73 
 
 
256 aa  310  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  59.84 
 
 
259 aa  308  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  59.68 
 
 
256 aa  308  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  59.68 
 
 
254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  61.9 
 
 
256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  59.04 
 
 
254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  57.6 
 
 
263 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.11 
 
 
268 aa  301  7.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  60.08 
 
 
254 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  58.1 
 
 
256 aa  299  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.45 
 
 
254 aa  298  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  64.52 
 
 
243 aa  296  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.02 
 
 
592 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  57.83 
 
 
253 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  59.84 
 
 
250 aa  292  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  58.75 
 
 
276 aa  292  4e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  55.42 
 
 
598 aa  291  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  56.86 
 
 
262 aa  291  6e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  59.84 
 
 
244 aa  291  6e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4597  putative ATP-binding component of ABC transporter  61.04 
 
 
265 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.838363  normal  0.0919141 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  57.43 
 
 
240 aa  290  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  58.63 
 
 
263 aa  290  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.6 
 
 
594 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  59.68 
 
 
257 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  57.43 
 
 
264 aa  289  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58 
 
 
597 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.2 
 
 
594 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.4 
 
 
261 aa  288  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  56.8 
 
 
240 aa  288  7e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  56.4 
 
 
261 aa  287  9e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  58.33 
 
 
264 aa  287  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  57.72 
 
 
240 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  57.6 
 
 
619 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  56.22 
 
 
240 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  55.02 
 
 
240 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2606  ABC transporter related  55.42 
 
 
254 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.0103017 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  57.6 
 
 
597 aa  285  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.6 
 
 
597 aa  285  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  55.82 
 
 
240 aa  285  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.33 
 
 
244 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.22 
 
 
595 aa  285  7e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  56.68 
 
 
289 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.03 
 
 
260 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  56.97 
 
 
602 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  57.87 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  55.51 
 
 
267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.8 
 
 
595 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  54.69 
 
 
255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  58.63 
 
 
252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  58.89 
 
 
256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  56.68 
 
 
289 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  56.28 
 
 
288 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  56.18 
 
 
254 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  56.18 
 
 
254 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  52.8 
 
 
240 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  59.92 
 
 
244 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  57.2 
 
 
245 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  54.37 
 
 
257 aa  280  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  54.37 
 
 
257 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  59.84 
 
 
243 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  60.24 
 
 
278 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  58.87 
 
 
248 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  56.97 
 
 
251 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  58.66 
 
 
244 aa  280  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  55.91 
 
 
245 aa  280  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  58.3 
 
 
242 aa  280  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  59.04 
 
 
243 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.05 
 
 
240 aa  279  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  58.87 
 
 
248 aa  279  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.05 
 
 
240 aa  279  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.01 
 
 
240 aa  279  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  56.22 
 
 
279 aa  278  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  54.76 
 
 
259 aa  278  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  56.22 
 
 
242 aa  278  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.61 
 
 
240 aa  278  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.61 
 
 
240 aa  278  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>