More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1983 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  100 
 
 
261 aa  527  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  76.19 
 
 
267 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  75.79 
 
 
255 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  69.2 
 
 
254 aa  364  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  64.26 
 
 
254 aa  343  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  65.2 
 
 
267 aa  343  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  64.29 
 
 
273 aa  335  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  63.05 
 
 
256 aa  335  5.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  64.4 
 
 
263 aa  334  7e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  60.23 
 
 
260 aa  331  8e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  61.51 
 
 
254 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  65.08 
 
 
254 aa  329  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  61.85 
 
 
250 aa  328  4e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  63.45 
 
 
254 aa  328  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  62.25 
 
 
252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  61.85 
 
 
250 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  59.85 
 
 
260 aa  325  5e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  62.7 
 
 
254 aa  325  5e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  62.14 
 
 
253 aa  319  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  59.6 
 
 
256 aa  318  7.999999999999999e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.93 
 
 
254 aa  317  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  59.44 
 
 
259 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  60.96 
 
 
254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  60.08 
 
 
264 aa  311  4.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  60.4 
 
 
258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  57.48 
 
 
259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  58.23 
 
 
256 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  60.08 
 
 
279 aa  304  8.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  59.84 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  58.87 
 
 
256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  56.8 
 
 
263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  58.33 
 
 
263 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.45 
 
 
592 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  58.17 
 
 
256 aa  296  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  58.53 
 
 
276 aa  295  5e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  54.65 
 
 
268 aa  292  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  59.84 
 
 
256 aa  293  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  59.18 
 
 
272 aa  292  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.79 
 
 
595 aa  291  8e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  58.04 
 
 
262 aa  290  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  57.71 
 
 
254 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  59.35 
 
 
602 aa  289  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  55.98 
 
 
274 aa  288  6e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  56.97 
 
 
274 aa  288  6e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  56.56 
 
 
274 aa  288  7e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  58.02 
 
 
272 aa  288  9e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  56.38 
 
 
257 aa  286  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  57.75 
 
 
262 aa  286  2e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  53.17 
 
 
263 aa  286  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  57.61 
 
 
636 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  57.61 
 
 
636 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  57.61 
 
 
636 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  57.61 
 
 
636 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  52.71 
 
 
267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  57.61 
 
 
636 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.61 
 
 
636 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1137  ABC transporter related  56.5 
 
 
254 aa  285  4e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  59.84 
 
 
243 aa  285  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.97 
 
 
594 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.61 
 
 
597 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  56.33 
 
 
598 aa  285  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.2 
 
 
260 aa  285  7e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  58.02 
 
 
619 aa  285  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.61 
 
 
595 aa  285  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.97 
 
 
594 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  55.69 
 
 
289 aa  284  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  56.63 
 
 
240 aa  284  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  57.2 
 
 
636 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  56.38 
 
 
261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  57.03 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  53.82 
 
 
255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.38 
 
 
261 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  56.63 
 
 
240 aa  281  7.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  56.68 
 
 
289 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  57.2 
 
 
597 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.2 
 
 
597 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  56.28 
 
 
288 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2971  ABC transporter related  56.4 
 
 
254 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  54 
 
 
255 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  53.41 
 
 
240 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  53.01 
 
 
240 aa  280  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  55.82 
 
 
239 aa  278  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  58.58 
 
 
244 aa  278  5e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  56 
 
 
244 aa  278  6e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  54.58 
 
 
263 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  54.18 
 
 
263 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  54.25 
 
 
242 aa  276  2e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2649  ABC transporter related  56.45 
 
 
260 aa  276  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0713  ABC transporter related  55.28 
 
 
260 aa  276  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0745  ABC transporter related  55.28 
 
 
260 aa  276  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  54.22 
 
 
240 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.13 
 
 
268 aa  274  8e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  53.85 
 
 
269 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  55.42 
 
 
242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2653  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.75 
 
 
267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  52.61 
 
 
275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  55.56 
 
 
264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  55.28 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  53.66 
 
 
242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1012  ABC transporter-related protein  53.2 
 
 
264 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>