More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3589 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  100 
 
 
243 aa  480  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  91.36 
 
 
243 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  78.19 
 
 
243 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  74.07 
 
 
243 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  72.02 
 
 
243 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  72.84 
 
 
243 aa  361  5.0000000000000005e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  69.14 
 
 
243 aa  347  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  70.54 
 
 
244 aa  345  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  69.71 
 
 
253 aa  333  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  69.58 
 
 
278 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  67.37 
 
 
248 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  65.83 
 
 
252 aa  319  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  66.25 
 
 
251 aa  318  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  66.11 
 
 
248 aa  316  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4025  ABC transporter related  66.67 
 
 
251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4341  ABC transporter related  66.67 
 
 
251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2743  ABC transporter related  67.8 
 
 
248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  60 
 
 
240 aa  296  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.76 
 
 
250 aa  294  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  59.58 
 
 
240 aa  294  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  59.17 
 
 
240 aa  293  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.57 
 
 
252 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.57 
 
 
252 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.57 
 
 
252 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  60.16 
 
 
251 aa  291  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.16 
 
 
252 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.82 
 
 
250 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  59.58 
 
 
243 aa  291  9e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  57.2 
 
 
256 aa  290  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.57 
 
 
253 aa  290  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.57 
 
 
253 aa  290  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  60.87 
 
 
267 aa  290  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  63.93 
 
 
267 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  63.93 
 
 
255 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  61.89 
 
 
247 aa  288  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.41 
 
 
250 aa  288  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.41 
 
 
250 aa  288  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.41 
 
 
250 aa  288  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 
240 aa  288  6e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2033  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.16 
 
 
253 aa  287  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60 
 
 
250 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  58.23 
 
 
253 aa  286  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.59 
 
 
250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  59.59 
 
 
250 aa  285  5e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  57.5 
 
 
240 aa  285  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  57.5 
 
 
240 aa  285  5e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  57.5 
 
 
240 aa  285  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.59 
 
 
250 aa  285  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  62.15 
 
 
254 aa  285  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 
240 aa  285  5e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 
240 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.18 
 
 
250 aa  285  5.999999999999999e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 
240 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  58.75 
 
 
246 aa  285  7e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.18 
 
 
250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 
240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 
240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.18 
 
 
250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.18 
 
 
250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  59.17 
 
 
243 aa  283  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 
240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  59.17 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  59.17 
 
 
244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  58.75 
 
 
240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  58.75 
 
 
240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  62.45 
 
 
267 aa  282  4.0000000000000003e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.18 
 
 
250 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 
247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  58 
 
 
260 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  56.25 
 
 
252 aa  281  5.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  61.22 
 
 
252 aa  281  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  59.43 
 
 
263 aa  281  7.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.84 
 
 
247 aa  281  9e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  58.33 
 
 
242 aa  281  9e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  56.02 
 
 
241 aa  280  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  58 
 
 
260 aa  280  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  58.78 
 
 
259 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  56.8 
 
 
250 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  58.47 
 
 
264 aa  279  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  56.8 
 
 
254 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  56.8 
 
 
250 aa  278  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  56.85 
 
 
241 aa  278  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  58.33 
 
 
250 aa  278  7e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  55.42 
 
 
240 aa  278  7e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  58.68 
 
 
246 aa  277  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  59.75 
 
 
265 aa  277  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.75 
 
 
240 aa  277  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  54.58 
 
 
243 aa  276  2e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  54.17 
 
 
240 aa  276  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  57.92 
 
 
260 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  54.58 
 
 
263 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  57.92 
 
 
260 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  54.58 
 
 
246 aa  275  4e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  54.77 
 
 
242 aa  275  4e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  57.85 
 
 
263 aa  275  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 
241 aa  275  5e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  56.4 
 
 
255 aa  275  7e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  55.42 
 
 
241 aa  274  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  55.42 
 
 
241 aa  274  7e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>