More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1502 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  100 
 
 
248 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  91.13 
 
 
248 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2743  ABC transporter related  91.53 
 
 
248 aa  448  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  75.1 
 
 
252 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  75.1 
 
 
251 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4025  ABC transporter related  75.52 
 
 
251 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4341  ABC transporter related  75.52 
 
 
251 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  68.62 
 
 
253 aa  333  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  69.07 
 
 
278 aa  331  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  64.02 
 
 
243 aa  323  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  63.6 
 
 
244 aa  321  7e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  66.11 
 
 
243 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  66.11 
 
 
243 aa  316  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  62.76 
 
 
243 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  65.27 
 
 
243 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  64.85 
 
 
243 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  62.76 
 
 
243 aa  311  7.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  60.67 
 
 
240 aa  305  6e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  61.09 
 
 
246 aa  305  6e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  60.64 
 
 
267 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  60.25 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  59.41 
 
 
240 aa  301  6.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  61.09 
 
 
244 aa  298  5e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  59.83 
 
 
240 aa  298  7e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  60.16 
 
 
256 aa  293  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  59.41 
 
 
244 aa  293  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  59 
 
 
240 aa  293  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  59.58 
 
 
241 aa  292  3e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  59.11 
 
 
263 aa  291  5e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  59.83 
 
 
249 aa  291  8e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  58.16 
 
 
240 aa  290  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  58.16 
 
 
240 aa  290  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  58.58 
 
 
240 aa  289  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  59.24 
 
 
244 aa  290  2e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  57.74 
 
 
243 aa  289  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  58.92 
 
 
248 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  54.39 
 
 
240 aa  289  3e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  57.32 
 
 
243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.33 
 
 
252 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  57.43 
 
 
250 aa  288  7e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  57.74 
 
 
241 aa  288  7e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.25 
 
 
250 aa  288  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  58.63 
 
 
252 aa  287  9e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  58.16 
 
 
239 aa  287  9e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.33 
 
 
252 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  55.65 
 
 
252 aa  287  1e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.33 
 
 
252 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.33 
 
 
252 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  56.63 
 
 
250 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.56 
 
 
240 aa  286  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  56.63 
 
 
254 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  57.32 
 
 
243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  59.59 
 
 
251 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  61 
 
 
250 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  57.72 
 
 
254 aa  285  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  56.9 
 
 
243 aa  285  4e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  57.83 
 
 
263 aa  285  5e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.84 
 
 
250 aa  285  5e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.84 
 
 
250 aa  285  5e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.84 
 
 
250 aa  285  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  59.04 
 
 
258 aa  285  5e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  59.84 
 
 
250 aa  285  7e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  60.25 
 
 
247 aa  284  7e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  56.9 
 
 
243 aa  284  7e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.84 
 
 
250 aa  284  8e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.84 
 
 
250 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  57.32 
 
 
242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  57.74 
 
 
248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.84 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.84 
 
 
250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.84 
 
 
250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  60.58 
 
 
250 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  54.1 
 
 
248 aa  282  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  57.74 
 
 
251 aa  281  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 
251 aa  281  7.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  55.92 
 
 
253 aa  281  8.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.02 
 
 
247 aa  281  9e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  60.42 
 
 
267 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  56.07 
 
 
246 aa  280  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  59.43 
 
 
250 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.61 
 
 
250 aa  280  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  54.62 
 
 
247 aa  280  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  56.07 
 
 
254 aa  279  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  56.1 
 
 
254 aa  279  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  58.16 
 
 
244 aa  280  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  56.49 
 
 
242 aa  280  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  56.07 
 
 
254 aa  279  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2910  ABC transporter related  58.61 
 
 
246 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  59.58 
 
 
255 aa  279  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  55.23 
 
 
252 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  56.07 
 
 
242 aa  279  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  58.87 
 
 
254 aa  279  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.74 
 
 
257 aa  279  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.46 
 
 
240 aa  278  4e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  57.43 
 
 
254 aa  278  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  55.87 
 
 
247 aa  278  4e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  54.81 
 
 
241 aa  278  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  55.23 
 
 
241 aa  279  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  55.65 
 
 
244 aa  278  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  56.22 
 
 
263 aa  278  5e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>