More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0225 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  100 
 
 		 252 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  99.6 
 
 		 252 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  99.6 
 
 		 252 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  94.84 
 
 		 252 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0242  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  84.08 
 
 		 249 aa  421  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762427  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  81.15 
 
 		 247 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  80.74 
 
 		 247 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  77.64 
 
 		 251 aa  384  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  77.96 
 
 		 250 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  77.14 
 
 		 250 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  77.14 
 
 		 250 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  77.14 
 
 		 250 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  77.14 
 
 		 250 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  77.14 
 
 		 250 aa  377  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  77.14 
 
 		 250 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  75.92 
 
 		 250 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  75.51 
 
 		 250 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  75.51 
 
 		 250 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  75.51 
 
 		 250 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  75.1 
 
 		 250 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  73.47 
 
 		 250 aa  368  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  74.39 
 
 		 250 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  73.68 
 
 		 253 aa  367  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  73.68 
 
 		 253 aa  367  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2033  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  73.28 
 
 		 253 aa  363  1e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  65.99 
 
 		 253 aa  335  2.9999999999999997e-91  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2910  ABC transporter related  62.6 
 
 		 246 aa  303  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.55 
 
 		 244 aa  298  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  61.89 
 
 		 243 aa  297  9e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  61.79 
 
 		 244 aa  297  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.14 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.14 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.14 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.14 
 
 		 244 aa  296  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  61.73 
 
 		 244 aa  296  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.73 
 
 		 244 aa  295  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.73 
 
 		 244 aa  295  5e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  62.14 
 
 		 244 aa  295  5e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  58.23 
 
 		 252 aa  294  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.28 
 
 		 245 aa  293  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  55.28 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.73 
 
 		 244 aa  292  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.73 
 
 		 244 aa  292  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  60.82 
 
 		 248 aa  292  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  60.73 
 
 		 243 aa  292  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  59.35 
 
 		 240 aa  292  4e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  60.41 
 
 		 260 aa  292  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  60.57 
 
 		 243 aa  291  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  59.6 
 
 		 255 aa  291  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  59.68 
 
 		 271 aa  291  6e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  60.16 
 
 		 243 aa  290  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  59.76 
 
 		 243 aa  289  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  57.14 
 
 		 251 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  58.13 
 
 		 240 aa  287  9e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  60.33 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1012  ABC transporter-related protein  57.77 
 
 		 264 aa  286  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  56.4 
 
 		 256 aa  285  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  58.4 
 
 		 263 aa  285  7e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  59.04 
 
 		 246 aa  284  8e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4025  ABC transporter related  57.54 
 
 		 251 aa  284  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4341  ABC transporter related  57.54 
 
 		 251 aa  284  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  56.5 
 
 		 240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  58.54 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  58.13 
 
 		 240 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1456  ABC transporter related protein  57.03 
 
 		 261 aa  282  4.0000000000000003e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  58.78 
 
 		 260 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.72 
 
 		 240 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.72 
 
 		 240 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5324  ABC transporter related  58.78 
 
 		 254 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.836598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  57.83 
 
 		 254 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2743  ABC transporter related  60.82 
 
 		 248 aa  281  9e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0791  ABC transporter related protein  56.91 
 
 		 251 aa  280  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  57.32 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  57.32 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  57.72 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2602  ABC transporter related  54.84 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  57.09 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  56.91 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.5 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.5 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  58.17 
 
 		 267 aa  279  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4943  ABC transporter related  58.37 
 
 		 254 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5031  ABC transporter related  58.37 
 
 		 254 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.91 
 
 		 240 aa  278  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.91 
 
 		 240 aa  278  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  56.33 
 
 		 265 aa  278  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13310  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.45 
 
 		 255 aa  279  4e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  55.69 
 
 		 241 aa  278  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  57.72 
 
 		 278 aa  278  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2343  ABC transporter related  56.33 
 
 		 245 aa  278  6e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185697  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  58.54 
 
 		 244 aa  278  7e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  58.96 
 
 		 258 aa  278  8e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  56.57 
 
 		 256 aa  276  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  59.92 
 
 		 249 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  56.18 
 
 		 256 aa  275  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  56.91 
 
 		 241 aa  275  7e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  55.28 
 
 		 247 aa  275  7e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  56.5 
 
 		 241 aa  274  8e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  56.5 
 
 		 243 aa  274  8e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>