More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2343 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2343  ABC transporter related  100 
 
 
245 aa  491  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185697  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1128  ABC transporter related protein  70.08 
 
 
266 aa  342  2.9999999999999997e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.419113  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  63.45 
 
 
271 aa  315  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0791  ABC transporter related protein  65.04 
 
 
251 aa  312  2.9999999999999996e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142657  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5324  ABC transporter related  62.86 
 
 
254 aa  310  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.836598  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4943  ABC transporter related  62.45 
 
 
254 aa  308  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5031  ABC transporter related  62.45 
 
 
254 aa  308  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5577  ABC transporter-related protein  61.16 
 
 
255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1231  ABC transporter related  60.66 
 
 
252 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.903047  normal  0.0835348 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  58.92 
 
 
244 aa  294  9e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.92 
 
 
244 aa  293  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 
244 aa  293  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 
244 aa  293  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 
244 aa  292  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 
244 aa  292  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 
244 aa  292  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 
244 aa  291  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  59.02 
 
 
251 aa  290  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1152  ABC transporter related  57.85 
 
 
247 aa  288  4e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645905  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  58.09 
 
 
244 aa  288  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  57.5 
 
 
247 aa  288  4e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.09 
 
 
244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.09 
 
 
244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0210  polar amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.02 
 
 
249 aa  286  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  56.73 
 
 
243 aa  284  9e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.44 
 
 
252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.68 
 
 
250 aa  281  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.92 
 
 
250 aa  281  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  58.13 
 
 
252 aa  280  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.73 
 
 
253 aa  280  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.73 
 
 
253 aa  280  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.92 
 
 
250 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  57.14 
 
 
243 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.13 
 
 
245 aa  279  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.92 
 
 
250 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.92 
 
 
250 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  57.14 
 
 
263 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.32 
 
 
247 aa  279  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  59.35 
 
 
258 aa  279  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  56.15 
 
 
253 aa  279  3e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  57.32 
 
 
260 aa  278  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  58.02 
 
 
243 aa  278  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.33 
 
 
252 aa  278  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.73 
 
 
250 aa  278  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  54.13 
 
 
245 aa  278  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.33 
 
 
252 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.33 
 
 
252 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.32 
 
 
247 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0242  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.61 
 
 
249 aa  277  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762427  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  55.51 
 
 
243 aa  277  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.97 
 
 
250 aa  277  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.97 
 
 
250 aa  277  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.97 
 
 
250 aa  277  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  56.97 
 
 
250 aa  276  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.97 
 
 
250 aa  276  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2033  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.33 
 
 
253 aa  276  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.56 
 
 
250 aa  275  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  57.38 
 
 
267 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.97 
 
 
250 aa  275  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  57.38 
 
 
255 aa  275  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  57.44 
 
 
243 aa  274  9e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.2 
 
 
273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.5 
 
 
267 aa  272  3e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5592  ABC transporter related  58.44 
 
 
266 aa  272  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  56.45 
 
 
256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5811  ABC transporter related  53.85 
 
 
268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306389  normal  0.349168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  55.1 
 
 
243 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  53.5 
 
 
242 aa  270  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  54.47 
 
 
260 aa  270  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.1 
 
 
250 aa  270  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  50 
 
 
240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  54.51 
 
 
255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3745  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  54.25 
 
 
266 aa  268  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3476  ABC transporter related  54.25 
 
 
266 aa  268  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  54.29 
 
 
254 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  54.1 
 
 
256 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  53.94 
 
 
265 aa  268  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  53.5 
 
 
266 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  54.13 
 
 
241 aa  267  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  54.13 
 
 
241 aa  267  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  57.2 
 
 
243 aa  267  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  53.09 
 
 
266 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  55.83 
 
 
248 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.17 
 
 
240 aa  267  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  58.2 
 
 
254 aa  267  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  55.56 
 
 
244 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  54.96 
 
 
263 aa  266  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  53.39 
 
 
263 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.48 
 
 
244 aa  266  2e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  54.55 
 
 
242 aa  266  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  56.15 
 
 
257 aa  266  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4158  ABC transporter related  54.32 
 
 
254 aa  266  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  55.97 
 
 
252 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  54.13 
 
 
241 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  56.61 
 
 
243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3973  ABC transporter related  55.28 
 
 
282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  52.23 
 
 
256 aa  265  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  54.77 
 
 
254 aa  265  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  53.72 
 
 
244 aa  265  4e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.2 
 
 
251 aa  265  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>