More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4943 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_5031  ABC transporter related  100 
 
 
254 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4943  ABC transporter related  100 
 
 
254 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5324  ABC transporter related  99.61 
 
 
254 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.836598  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5577  ABC transporter-related protein  79.05 
 
 
255 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1231  ABC transporter related  77.65 
 
 
252 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.903047  normal  0.0835348 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0791  ABC transporter related protein  68.25 
 
 
251 aa  340  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142657  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  66.67 
 
 
271 aa  335  3.9999999999999995e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2343  ABC transporter related  62.45 
 
 
245 aa  315  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185697  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1128  ABC transporter related protein  62.35 
 
 
266 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.419113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 
244 aa  293  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.54 
 
 
247 aa  292  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.17 
 
 
244 aa  292  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 
244 aa  291  6e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  58.75 
 
 
244 aa  291  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 
244 aa  291  8e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 
244 aa  290  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 
244 aa  290  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.47 
 
 
252 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
244 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  58.75 
 
 
244 aa  288  6e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.72 
 
 
247 aa  287  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 
244 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 
244 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.37 
 
 
252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.37 
 
 
252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.37 
 
 
252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1152  ABC transporter related  56.25 
 
 
247 aa  280  2e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645905  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  56.5 
 
 
251 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0242  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.63 
 
 
249 aa  276  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762427  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  58.54 
 
 
246 aa  276  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.2 
 
 
250 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  56.33 
 
 
250 aa  276  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.33 
 
 
250 aa  276  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.33 
 
 
250 aa  276  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.33 
 
 
250 aa  276  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.33 
 
 
250 aa  275  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.33 
 
 
250 aa  275  6e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.79 
 
 
250 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.79 
 
 
250 aa  274  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.92 
 
 
250 aa  274  9e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.79 
 
 
250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.79 
 
 
250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.38 
 
 
244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  56.85 
 
 
243 aa  273  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  56.85 
 
 
243 aa  273  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  54.58 
 
 
247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  54.73 
 
 
245 aa  271  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  54.1 
 
 
242 aa  271  6e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.33 
 
 
250 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.32 
 
 
245 aa  270  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0153  ABC transporter related  55.14 
 
 
262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.51 
 
 
253 aa  267  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.38 
 
 
254 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.51 
 
 
253 aa  267  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  55.2 
 
 
263 aa  267  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0210  polar amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.36 
 
 
249 aa  266  2e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  52.61 
 
 
256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 
243 aa  265  4e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  55.97 
 
 
266 aa  265  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  54.66 
 
 
264 aa  265  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.66 
 
 
250 aa  265  5e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  53.85 
 
 
255 aa  264  8e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2033  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.1 
 
 
253 aa  263  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.32 
 
 
273 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.91 
 
 
260 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  55.28 
 
 
264 aa  262  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  56.22 
 
 
269 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  55.56 
 
 
266 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  54.84 
 
 
258 aa  261  6e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  53.57 
 
 
252 aa  261  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54.32 
 
 
246 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.19 
 
 
244 aa  261  8e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.86 
 
 
597 aa  261  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03640  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.61 
 
 
245 aa  261  8e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  53.01 
 
 
256 aa  260  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  53.63 
 
 
260 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  54.51 
 
 
265 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  54.36 
 
 
240 aa  260  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  54 
 
 
262 aa  260  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  53.47 
 
 
299 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  53.75 
 
 
253 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3745  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  53.66 
 
 
266 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  54.77 
 
 
242 aa  259  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3476  ABC transporter related  53.66 
 
 
266 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2910  ABC transporter related  55.97 
 
 
246 aa  259  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  53.53 
 
 
241 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  54.55 
 
 
253 aa  259  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  52.48 
 
 
241 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  52.48 
 
 
241 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  52.17 
 
 
254 aa  258  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  51.22 
 
 
240 aa  259  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  53.85 
 
 
255 aa  258  5.0000000000000005e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  51.57 
 
 
275 aa  258  6e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  55.47 
 
 
597 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.47 
 
 
597 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.48 
 
 
247 aa  258  7e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  52.48 
 
 
244 aa  258  8e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.12 
 
 
251 aa  258  8e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  51.37 
 
 
261 aa  257  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1061  polar amino acid ABC transporter ATPase  53.25 
 
 
300 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136916  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>