More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5577 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5577  ABC transporter-related protein  100 
 
 
255 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1231  ABC transporter related  85.2 
 
 
252 aa  428  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.903047  normal  0.0835348 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5324  ABC transporter related  79.45 
 
 
254 aa  390  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.836598  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4943  ABC transporter related  79.05 
 
 
254 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5031  ABC transporter related  79.05 
 
 
254 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0791  ABC transporter related protein  67.61 
 
 
251 aa  335  5e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142657  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  65.71 
 
 
271 aa  334  9e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1128  ABC transporter related protein  63.27 
 
 
266 aa  308  6.999999999999999e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.419113  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2343  ABC transporter related  61.16 
 
 
245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185697  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.85 
 
 
247 aa  287  9e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.49 
 
 
244 aa  287  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.49 
 
 
244 aa  287  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.07 
 
 
244 aa  286  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.07 
 
 
244 aa  286  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.07 
 
 
244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.07 
 
 
244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  56.9 
 
 
244 aa  285  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.44 
 
 
247 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 
244 aa  284  9e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.07 
 
 
244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.07 
 
 
244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  55.23 
 
 
244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  58.51 
 
 
251 aa  280  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.73 
 
 
252 aa  278  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1152  ABC transporter related  54.58 
 
 
247 aa  275  6e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645905  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  55.12 
 
 
250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.16 
 
 
252 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.12 
 
 
250 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.12 
 
 
250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.12 
 
 
250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.12 
 
 
250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.16 
 
 
252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.55 
 
 
254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.16 
 
 
252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.72 
 
 
250 aa  272  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0242  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.1 
 
 
249 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762427  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  57.32 
 
 
264 aa  271  7e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.92 
 
 
245 aa  271  7e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  52.92 
 
 
245 aa  271  8.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.72 
 
 
250 aa  271  9e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  54.17 
 
 
247 aa  270  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.07 
 
 
253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.07 
 
 
253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.23 
 
 
250 aa  268  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3476  ABC transporter related  54.92 
 
 
266 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3745  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  54.92 
 
 
266 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  52.53 
 
 
261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2033  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.65 
 
 
253 aa  265  4e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  54.62 
 
 
263 aa  265  5e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.33 
 
 
250 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.32 
 
 
250 aa  265  5.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  55.42 
 
 
273 aa  265  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.33 
 
 
250 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  55.14 
 
 
240 aa  264  8e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.33 
 
 
250 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.33 
 
 
250 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  54.8 
 
 
256 aa  264  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  58.2 
 
 
279 aa  263  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1260  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 
252 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.0306795 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.08 
 
 
244 aa  263  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  54.51 
 
 
246 aa  263  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  52.72 
 
 
265 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0153  ABC transporter related  53.53 
 
 
262 aa  261  6e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  53.64 
 
 
268 aa  261  6.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.94 
 
 
250 aa  261  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  51.68 
 
 
253 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  54.66 
 
 
260 aa  259  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  53.36 
 
 
275 aa  260  2e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  54.62 
 
 
240 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  55.6 
 
 
278 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  54.73 
 
 
243 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  51.68 
 
 
253 aa  258  7e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  52.65 
 
 
246 aa  258  8e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  56.75 
 
 
602 aa  258  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.27 
 
 
260 aa  258  9e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  52.3 
 
 
240 aa  258  9e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.67 
 
 
240 aa  257  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  54.22 
 
 
269 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 
253 aa  257  1e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.67 
 
 
240 aa  256  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  53.31 
 
 
243 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  51.03 
 
 
240 aa  256  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  54.22 
 
 
258 aa  256  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  53.23 
 
 
274 aa  256  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  53.47 
 
 
264 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  52.33 
 
 
265 aa  256  3e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  53.31 
 
 
243 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.55 
 
 
251 aa  256  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  52.71 
 
 
265 aa  256  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  53.56 
 
 
248 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  53.28 
 
 
299 aa  255  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  54.62 
 
 
266 aa  255  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  54.44 
 
 
243 aa  255  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  54.36 
 
 
244 aa  255  6e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.21 
 
 
595 aa  255  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.21 
 
 
594 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.25 
 
 
240 aa  254  7e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.25 
 
 
240 aa  254  7e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.25 
 
 
240 aa  254  7e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  52.92 
 
 
242 aa  254  7e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>