More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0396 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  72.96 
 
 		 594 aa  751    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  69.84 
 
 		 636 aa  795    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.55 
 
 		 592 aa  729    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  69.88 
 
 		 636 aa  795    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  68.81 
 
 		 619 aa  768    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.98 
 
 		 595 aa  733    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  71.01 
 
 		 598 aa  757    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  70.18 
 
 		 595 aa  757    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 602 aa  1196    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  69.8 
 
 		 597 aa  779    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  72.82 
 
 		 594 aa  758    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  69.97 
 
 		 597 aa  781    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  69.8 
 
 		 597 aa  779    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  69.84 
 
 		 636 aa  795    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  69.84 
 
 		 636 aa  795    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  69.84 
 
 		 636 aa  795    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  69.53 
 
 		 636 aa  791    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  70.09 
 
 		 636 aa  797    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.76 
 
 		 581 aa  629  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0599  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  45.38 
 
 		 567 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.106218 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5145  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.62 
 
 		 567 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.900628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  70.63 
 
 		 260 aa  352  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  69.84 
 
 		 274 aa  346  6e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  69.84 
 
 		 257 aa  345  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  67.42 
 
 		 274 aa  343  5e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  69.2 
 
 		 254 aa  337  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  67.86 
 
 		 272 aa  336  5.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  68.22 
 
 		 274 aa  335  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  67.84 
 
 		 268 aa  335  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  68.65 
 
 		 275 aa  334  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  65.22 
 
 		 272 aa  332  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.27 
 
 		 261 aa  329  9e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  66.27 
 
 		 261 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3710  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.96 
 
 		 365 aa  327  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3909  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.57 
 
 		 352 aa  325  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  65.2 
 
 		 264 aa  323  8e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  68.25 
 
 		 279 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02260  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  70.63 
 
 		 299 aa  320  3e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.903253  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.59 
 
 		 500 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal  0.451936 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4453  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.39 
 
 		 500 aa  317  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1640  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.57 
 
 		 559 aa  317  5e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.588143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  62.2 
 
 		 263 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  65.34 
 
 		 256 aa  313  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  61.6 
 
 		 267 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  61.6 
 
 		 253 aa  312  9e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.86 
 
 		 506 aa  311  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  63.2 
 
 		 264 aa  309  9e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  60.31 
 
 		 273 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  61.89 
 
 		 254 aa  306  8.000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.95 
 
 		 543 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.406316  normal  0.927008 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.49 
 
 		 502 aa  302  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  62.04 
 
 		 260 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  60.73 
 
 		 254 aa  300  4e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1185  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.34 
 
 		 295 aa  300  6e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02270  amino acid ABC transporter membrane protein  53.04 
 
 		 369 aa  300  7e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3313  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.21 
 
 		 502 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  60.82 
 
 		 260 aa  299  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  61.38 
 
 		 255 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  60.57 
 
 		 259 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2891  amino acid ABC transporter permease  54.41 
 
 		 329 aa  298  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0444543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3010  amino acid ABC transporter, permease protein  54.78 
 
 		 324 aa  296  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234602  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  61.38 
 
 		 267 aa  296  8e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.64 
 
 		 510 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  59.51 
 
 		 259 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2799  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.11 
 
 		 510 aa  295  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  58.5 
 
 		 256 aa  294  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  60.41 
 
 		 250 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  59.2 
 
 		 256 aa  293  6e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  60 
 
 		 250 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.99 
 
 		 516 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  60 
 
 		 254 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2153  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.37 
 
 		 314 aa  291  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.280897  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2493  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.31 
 
 		 321 aa  291  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.761047  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  57.09 
 
 		 264 aa  290  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4083  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.4 
 
 		 500 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  59.76 
 
 		 254 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  59.35 
 
 		 261 aa  290  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  59.02 
 
 		 258 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  59.18 
 
 		 252 aa  286  7e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  57.14 
 
 		 256 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6505  ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.76 
 
 		 536 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0292  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 		 510 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  56.97 
 
 		 254 aa  284  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1311  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.04 
 
 		 512 aa  284  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00935602 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0522  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.61 
 
 		 306 aa  283  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  56.91 
 
 		 256 aa  283  7.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  56.5 
 
 		 254 aa  280  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  37.29 
 
 		 507 aa  280  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  58.13 
 
 		 256 aa  279  9e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  57.89 
 
 		 250 aa  279  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  59.27 
 
 		 254 aa  279  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.73 
 
 		 254 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1137  ABC transporter related  58.44 
 
 		 254 aa  277  5e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.35 
 
 		 264 aa  276  6e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  58.47 
 
 		 263 aa  276  7e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  55.24 
 
 		 263 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  57.71 
 
 		 262 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  56.68 
 
 		 255 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  55.16 
 
 		 263 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2087  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.04 
 
 		 306 aa  275  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>