More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3516 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  100 
 
 
254 aa  524  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  73.41 
 
 
254 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  68.92 
 
 
267 aa  359  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  68.53 
 
 
255 aa  359  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  64.26 
 
 
261 aa  343  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  64.14 
 
 
254 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  62.65 
 
 
256 aa  335  5e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  64.8 
 
 
267 aa  334  7.999999999999999e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  61.35 
 
 
252 aa  331  8e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  64.8 
 
 
254 aa  330  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  64 
 
 
258 aa  328  6e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  63.2 
 
 
250 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  62.8 
 
 
250 aa  323  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  63.2 
 
 
254 aa  323  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  62.4 
 
 
256 aa  323  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  62.8 
 
 
259 aa  322  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  61.75 
 
 
273 aa  322  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  61.2 
 
 
263 aa  322  5e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  62.3 
 
 
259 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  62.25 
 
 
254 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  61.75 
 
 
256 aa  318  5e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  60.32 
 
 
260 aa  314  8e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  60.8 
 
 
256 aa  313  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  60.32 
 
 
268 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  62.55 
 
 
254 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  60.4 
 
 
260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  59.04 
 
 
254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  57.94 
 
 
263 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  60.4 
 
 
264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 
254 aa  305  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  60.55 
 
 
263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  60.47 
 
 
276 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  58.53 
 
 
274 aa  300  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  57.71 
 
 
274 aa  300  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  57.14 
 
 
274 aa  296  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  58.4 
 
 
263 aa  295  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  56.73 
 
 
253 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  58.61 
 
 
242 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  57.25 
 
 
262 aa  292  4e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.22 
 
 
268 aa  292  4e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  57.43 
 
 
279 aa  291  5e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  58.61 
 
 
272 aa  291  7e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  56.75 
 
 
275 aa  291  9e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  59.76 
 
 
602 aa  290  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  58.8 
 
 
247 aa  290  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.35 
 
 
260 aa  290  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  57.37 
 
 
256 aa  289  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  54.76 
 
 
272 aa  289  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  57.14 
 
 
246 aa  289  3e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  58.78 
 
 
240 aa  289  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  58.1 
 
 
243 aa  288  7e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  58.8 
 
 
247 aa  288  8e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  59.04 
 
 
262 aa  287  9e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  57.96 
 
 
240 aa  287  9e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  57.6 
 
 
262 aa  287  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  57.2 
 
 
239 aa  286  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  57.94 
 
 
246 aa  286  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  55.2 
 
 
264 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  56.92 
 
 
243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  59.84 
 
 
258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  57.72 
 
 
248 aa  285  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  57.79 
 
 
242 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  55.43 
 
 
248 aa  284  8e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  56.8 
 
 
251 aa  284  9e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  54.22 
 
 
257 aa  284  9e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  54.69 
 
 
598 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.17 
 
 
257 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.22 
 
 
592 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  58.2 
 
 
263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  57.79 
 
 
263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  59.18 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  57.14 
 
 
244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  55.2 
 
 
240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.6 
 
 
251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  57.6 
 
 
278 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  54.66 
 
 
250 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.92 
 
 
595 aa  282  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  57.54 
 
 
242 aa  281  6.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  56 
 
 
255 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  57.6 
 
 
246 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 
261 aa  281  9e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  57.94 
 
 
240 aa  280  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  57.14 
 
 
261 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0719  ABC transporter related  56.02 
 
 
256 aa  280  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  56 
 
 
249 aa  280  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  55.47 
 
 
252 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  57.14 
 
 
246 aa  280  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  57.65 
 
 
246 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3694  ABC transporter related  56.47 
 
 
248 aa  279  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.749012  normal  0.245017 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  57.77 
 
 
247 aa  279  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  57.14 
 
 
242 aa  279  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.51 
 
 
594 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  56.8 
 
 
261 aa  279  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  57.79 
 
 
240 aa  279  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  56.8 
 
 
246 aa  279  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  54.8 
 
 
248 aa  278  4e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.92 
 
 
595 aa  278  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  56.33 
 
 
636 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  56.33 
 
 
636 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  56.33 
 
 
636 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>