More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5459 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  100 
 
 		 263 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  65.49 
 
 		 273 aa  339  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  63.75 
 
 		 267 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  61.6 
 
 		 263 aa  323  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  60.38 
 
 		 260 aa  322  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  59.23 
 
 		 260 aa  322  6e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  60.96 
 
 		 254 aa  321  7e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  63.49 
 
 		 254 aa  319  3e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  63.49 
 
 		 254 aa  319  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  60.8 
 
 		 250 aa  318  6e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  60.8 
 
 		 250 aa  318  7e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  59.85 
 
 		 256 aa  315  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  61.69 
 
 		 264 aa  313  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  61.33 
 
 		 256 aa  312  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  58.3 
 
 		 259 aa  310  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  58.3 
 
 		 259 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  60.96 
 
 		 258 aa  309  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  58.96 
 
 		 254 aa  305  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  60.8 
 
 		 252 aa  304  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  57.63 
 
 		 274 aa  302  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  58.69 
 
 		 257 aa  302  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  60.39 
 
 		 262 aa  300  1e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  58.33 
 
 		 261 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  60.41 
 
 		 255 aa  299  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  59.44 
 
 		 253 aa  298  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  55.56 
 
 		 256 aa  298  5e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  59.14 
 
 		 279 aa  298  5e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  60.25 
 
 		 267 aa  298  7e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  60.46 
 
 		 262 aa  297  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  57.94 
 
 		 254 aa  296  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  57.37 
 
 		 256 aa  296  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  58.27 
 
 		 264 aa  295  4e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  58.4 
 
 		 254 aa  295  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  57.2 
 
 		 240 aa  294  9e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  57.71 
 
 		 268 aa  294  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  60.8 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  58.47 
 
 		 254 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 		 254 aa  293  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  58.82 
 
 		 276 aa  292  4e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  56.18 
 
 		 242 aa  291  5e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  56.18 
 
 		 242 aa  291  5e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  55.51 
 
 		 256 aa  291  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  54.4 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.73 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  55.38 
 
 		 268 aa  290  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  56.75 
 
 		 254 aa  289  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  55.2 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.95 
 
 		 244 aa  289  4e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  59.68 
 
 		 256 aa  289  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  54 
 
 		 240 aa  289  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  56.18 
 
 		 241 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54 
 
 		 240 aa  288  7e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.53 
 
 		 268 aa  288  7e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54 
 
 		 240 aa  288  8e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  58.57 
 
 		 244 aa  288  9e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  55.2 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  57.2 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  55.6 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  54.4 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  54.4 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  57.66 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  54.05 
 
 		 252 aa  286  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  57.71 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  54 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  55.78 
 
 		 263 aa  285  4e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  54 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  53.97 
 
 		 244 aa  285  5.999999999999999e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  55.73 
 
 		 263 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  54.8 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  55.6 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  57.6 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5811  ABC transporter related  55 
 
 		 268 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306389  normal  0.349168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  56.4 
 
 		 243 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.08 
 
 		 244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  55.51 
 
 		 257 aa  281  6.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.42 
 
 		 592 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  59.76 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.03 
 
 		 251 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02260  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.68 
 
 		 299 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.903253  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  58.4 
 
 		 246 aa  280  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  53.82 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.43 
 
 		 597 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.27 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  57.2 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2343  ABC transporter related  57.14 
 
 		 245 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185697  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  54.05 
 
 		 267 aa  279  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.42 
 
 		 595 aa  279  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1325  polar amino acid ABC transporter ATPase  55.98 
 
 		 265 aa  279  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  54.4 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  55.6 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  55.6 
 
 		 240 aa  279  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  54.75 
 
 		 274 aa  279  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.6 
 
 		 260 aa  279  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  56.75 
 
 		 243 aa  278  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  55.6 
 
 		 243 aa  278  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  53.78 
 
 		 243 aa  278  6e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  57.2 
 
 		 265 aa  278  6e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  55.51 
 
 		 274 aa  278  7e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  57.03 
 
 		 636 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>