More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4985 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  67.33 
 
 		 267 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  66.53 
 
 		 255 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  63.75 
 
 		 254 aa  337  8e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  62.65 
 
 		 254 aa  335  5e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  63.05 
 
 		 261 aa  335  5.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  62.25 
 
 		 263 aa  332  3e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  64.75 
 
 		 254 aa  330  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  63.71 
 
 		 254 aa  323  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  62.25 
 
 		 267 aa  322  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  61.35 
 
 		 273 aa  318  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  61.85 
 
 		 264 aa  315  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  60.64 
 
 		 252 aa  314  9e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  59.68 
 
 		 254 aa  308  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  59.04 
 
 		 250 aa  308  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  59.04 
 
 		 254 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  59.04 
 
 		 250 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  59.04 
 
 		 254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  59.44 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  60.98 
 
 		 258 aa  306  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  57.83 
 
 		 260 aa  300  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 256 aa  300  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  58.2 
 
 		 253 aa  299  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  59.67 
 
 		 597 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.67 
 
 		 597 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.67 
 
 		 597 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  56.5 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.84 
 
 		 594 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.84 
 
 		 594 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.66 
 
 		 595 aa  296  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  58.59 
 
 		 262 aa  295  5e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  55.82 
 
 		 260 aa  295  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.43 
 
 		 254 aa  294  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  55.51 
 
 		 263 aa  291  5e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  57.03 
 
 		 268 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  56.69 
 
 		 274 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  57.2 
 
 		 598 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  58.5 
 
 		 263 aa  289  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  59.43 
 
 		 619 aa  288  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  56.92 
 
 		 264 aa  288  5.0000000000000004e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  58.94 
 
 		 259 aa  288  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.75 
 
 		 276 aa  288  6e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  56.22 
 
 		 244 aa  288  7e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  56.47 
 
 		 256 aa  287  9e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  54.58 
 
 		 263 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.44 
 
 		 592 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.61 
 
 		 260 aa  285  4e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  58.94 
 
 		 256 aa  285  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  60.25 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  57.03 
 
 		 272 aa  285  5.999999999999999e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  58.02 
 
 		 257 aa  285  5.999999999999999e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  57.14 
 
 		 602 aa  285  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  57.26 
 
 		 279 aa  284  9e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  57.03 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  59.84 
 
 		 272 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4597  putative ATP-binding component of ABC transporter  58.23 
 
 		 265 aa  282  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.838363  normal  0.0919141 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.54 
 
 		 268 aa  281  5.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  57.66 
 
 		 256 aa  281  5.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.56 
 
 		 595 aa  281  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  56.91 
 
 		 259 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  57.61 
 
 		 636 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  57.61 
 
 		 636 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1137  ABC transporter related  56.13 
 
 		 254 aa  280  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  57.61 
 
 		 636 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  58.44 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  57.61 
 
 		 636 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.61 
 
 		 636 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  57.61 
 
 		 636 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  57.61 
 
 		 636 aa  278  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  55.82 
 
 		 274 aa  278  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  55.42 
 
 		 274 aa  278  6e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  56 
 
 		 255 aa  278  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  58.85 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  53.63 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  55.42 
 
 		 299 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  59.67 
 
 		 243 aa  274  8e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  53.57 
 
 		 255 aa  272  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  56.38 
 
 		 252 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  54.62 
 
 		 275 aa  271  8.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  53.82 
 
 		 240 aa  271  9e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  55.02 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  55.06 
 
 		 251 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  55.02 
 
 		 278 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1789  ABC transporter related  56.38 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0719  ABC transporter related  55.33 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  54.22 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  52.38 
 
 		 252 aa  269  4e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1061  polar amino acid ABC transporter ATPase  52.42 
 
 		 300 aa  268  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  55.74 
 
 		 243 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  56 
 
 		 254 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  55.28 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1325  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.05 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  55.69 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  55.97 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1556  ABC transporter related  55.97 
 
 		 263 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  54.77 
 
 		 261 aa  265  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02260  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.98 
 
 		 299 aa  265  5e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.903253  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  54.25 
 
 		 242 aa  265  5e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.83 
 
 		 581 aa  265  7e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0713  ABC transporter related  54.66 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>