More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1137 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1137  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  509  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  58.23 
 
 		 256 aa  310  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  57.83 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  60.57 
 
 		 273 aa  298  6e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  58.94 
 
 		 260 aa  295  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  56.91 
 
 		 260 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  58.54 
 
 		 263 aa  289  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  60.41 
 
 		 264 aa  289  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  57.2 
 
 		 255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  59.59 
 
 		 636 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  59.59 
 
 		 636 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  56.5 
 
 		 261 aa  285  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  59.59 
 
 		 636 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  59.59 
 
 		 636 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  58.3 
 
 		 256 aa  285  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  58.54 
 
 		 258 aa  285  5e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.59 
 
 		 636 aa  285  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  59.59 
 
 		 636 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  58.4 
 
 		 254 aa  285  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  57.2 
 
 		 267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  57.09 
 
 		 240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  56.91 
 
 		 250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  56.8 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  57.49 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  56.91 
 
 		 250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  56.4 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  59.18 
 
 		 636 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.14 
 
 		 594 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  57.72 
 
 		 244 aa  280  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.28 
 
 		 592 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.14 
 
 		 594 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  56.13 
 
 		 256 aa  280  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  57.6 
 
 		 254 aa  279  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.96 
 
 		 595 aa  279  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  55.78 
 
 		 245 aa  278  5e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.55 
 
 		 597 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.69 
 
 		 595 aa  276  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  58.44 
 
 		 602 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  54.66 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  55.28 
 
 		 240 aa  275  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  57.49 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  55.28 
 
 		 263 aa  275  5e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  55.69 
 
 		 259 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  57.14 
 
 		 597 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.14 
 
 		 597 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.13 
 
 		 240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  55.69 
 
 		 240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  55.28 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  55.69 
 
 		 268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  55.47 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  55.69 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  58.54 
 
 		 252 aa  272  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  56 
 
 		 253 aa  272  3e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  56.47 
 
 		 254 aa  271  6e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  55.87 
 
 		 246 aa  270  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  54.07 
 
 		 261 aa  270  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  56.73 
 
 		 619 aa  270  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  57.49 
 
 		 242 aa  271  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  58.3 
 
 		 255 aa  270  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.4 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  56.1 
 
 		 245 aa  270  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  56.1 
 
 		 259 aa  269  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 		 254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.09 
 
 		 284 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.47 
 
 		 260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  57.72 
 
 		 247 aa  268  4e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  53.44 
 
 		 263 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  55.28 
 
 		 254 aa  268  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  54.03 
 
 		 254 aa  268  7e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  54.98 
 
 		 245 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  55.28 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  54.18 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  56.18 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  54.47 
 
 		 252 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  55.28 
 
 		 272 aa  266  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  54.88 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  54.8 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  54.58 
 
 		 244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  53.66 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  55.87 
 
 		 263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  55.47 
 
 		 248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  53.6 
 
 		 267 aa  265  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  55.1 
 
 		 598 aa  265  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  55.69 
 
 		 247 aa  265  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  55.06 
 
 		 248 aa  265  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  53.66 
 
 		 242 aa  265  5e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  55.06 
 
 		 239 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  56.73 
 
 		 279 aa  265  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  56.68 
 
 		 266 aa  264  8e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  55.56 
 
 		 259 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  57.32 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56 
 
 		 251 aa  264  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  55.78 
 
 		 245 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  57.32 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  54.62 
 
 		 265 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  55.6 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  54.07 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  54.07 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0745  ABC transporter related  53.66 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  55.24 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>