More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2882 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  100 
 
 		 261 aa  533  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3562  ABC transporter related  86.51 
 
 		 257 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  64.94 
 
 		 253 aa  296  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  59.07 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  54.39 
 
 		 242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  55.23 
 
 		 242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  57.96 
 
 		 259 aa  285  4e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  57.08 
 
 		 254 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  57.08 
 
 		 254 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  58.33 
 
 		 248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.55 
 
 		 240 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  57.5 
 
 		 251 aa  281  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  57.87 
 
 		 242 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  56.47 
 
 		 257 aa  281  6.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  56.56 
 
 		 246 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  56.25 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 		 245 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  58.7 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  55.83 
 
 		 246 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  58.33 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  55.23 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  57.26 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  57.5 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  56.1 
 
 		 263 aa  278  5e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  57.69 
 
 		 248 aa  278  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  55.92 
 
 		 248 aa  278  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  57.69 
 
 		 248 aa  278  7e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  56.25 
 
 		 247 aa  278  9e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.94 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  56.49 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  55.51 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15420  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.03 
 
 		 274 aa  276  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  58.9 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  54.88 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  59.07 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  56.67 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  56.71 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  57.56 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  58.77 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  59.66 
 
 		 251 aa  275  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  56.49 
 
 		 267 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  54.84 
 
 		 259 aa  275  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  57.2 
 
 		 263 aa  275  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 		 244 aa  275  5e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  57.76 
 
 		 247 aa  275  5e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  56.67 
 
 		 244 aa  275  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  54.69 
 
 		 247 aa  275  7e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 		 270 aa  274  9e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  57.33 
 
 		 257 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  57.66 
 
 		 256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  58.92 
 
 		 255 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  53.75 
 
 		 242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  57.83 
 
 		 257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  53.75 
 
 		 242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  55.36 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4158  ABC transporter related  58.61 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  54.58 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  58.8 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  59.49 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  56.71 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  54.1 
 
 		 246 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  56.85 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  53.72 
 
 		 246 aa  272  3e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  57.33 
 
 		 244 aa  273  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  54.76 
 
 		 267 aa  272  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  53.97 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  58.75 
 
 		 245 aa  272  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  54.55 
 
 		 363 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  55.83 
 
 		 256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  56.17 
 
 		 257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  54.03 
 
 		 250 aa  272  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000378719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  55.7 
 
 		 252 aa  272  5.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  57.45 
 
 		 244 aa  271  5.000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  55.36 
 
 		 242 aa  271  6e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  57.92 
 
 		 252 aa  271  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  55.36 
 
 		 243 aa  271  6e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  57.94 
 
 		 242 aa  271  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1849  ABC transporter related  53.41 
 
 		 251 aa  271  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  55.97 
 
 		 253 aa  271  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  54.58 
 
 		 255 aa  271  8.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  56.07 
 
 		 240 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  54.94 
 
 		 243 aa  271  8.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  55.65 
 
 		 242 aa  271  9e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  54.94 
 
 		 243 aa  271  9e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  53.09 
 
 		 248 aa  270  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0358  ABC transporter related  57.03 
 
 		 252 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  56.6 
 
 		 248 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  55.42 
 
 		 255 aa  270  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  54.66 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  55.06 
 
 		 260 aa  270  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  55.94 
 
 		 266 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.65 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  55.74 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  52.24 
 
 		 249 aa  270  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  52.77 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  56.36 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  56.6 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  55.06 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  56.65 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  62.11 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>