More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3562 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3562  ABC transporter related  100 
 
 
257 aa  528  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  86.51 
 
 
261 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  63.64 
 
 
253 aa  286  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  60.43 
 
 
248 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  59.4 
 
 
240 aa  285  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  56.49 
 
 
246 aa  284  8e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  55.47 
 
 
252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  57.32 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  58.9 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  57.32 
 
 
248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  56.9 
 
 
246 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  59.15 
 
 
248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  60.61 
 
 
244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  55.65 
 
 
250 aa  282  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000378719  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  54.88 
 
 
254 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  54.88 
 
 
254 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  54.39 
 
 
242 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  57.08 
 
 
240 aa  280  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  56.65 
 
 
242 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  58.8 
 
 
259 aa  280  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  57.09 
 
 
267 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  58.73 
 
 
256 aa  280  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  59.74 
 
 
243 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  57.87 
 
 
240 aa  280  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  57.89 
 
 
255 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  58.44 
 
 
240 aa  280  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  57.45 
 
 
240 aa  279  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  55.98 
 
 
242 aa  279  4e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 
240 aa  278  4e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  56.9 
 
 
251 aa  279  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  52.72 
 
 
242 aa  278  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  55.69 
 
 
263 aa  278  8e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  57.68 
 
 
244 aa  278  8e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  53.2 
 
 
252 aa  277  1e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  58.3 
 
 
251 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  57.2 
 
 
240 aa  277  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  55.1 
 
 
261 aa  276  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  56.49 
 
 
244 aa  276  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  56.49 
 
 
243 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  59.49 
 
 
278 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  56.49 
 
 
247 aa  276  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  59.4 
 
 
244 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  58.4 
 
 
266 aa  275  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  59.5 
 
 
252 aa  276  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  55 
 
 
242 aa  275  4e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  52.48 
 
 
246 aa  275  4e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  56.17 
 
 
240 aa  275  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  57.87 
 
 
252 aa  275  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  57.6 
 
 
266 aa  275  6e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  58.44 
 
 
247 aa  275  7e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  55.98 
 
 
270 aa  275  7e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  55.56 
 
 
253 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  57.02 
 
 
244 aa  274  9e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  55.83 
 
 
260 aa  274  9e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  55.93 
 
 
244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  56.33 
 
 
263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  55.13 
 
 
243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  55.13 
 
 
243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.96 
 
 
244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  54.58 
 
 
242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  56.07 
 
 
243 aa  273  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  57.38 
 
 
244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  55.36 
 
 
242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  55.06 
 
 
252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  56.49 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  58.55 
 
 
246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  57.14 
 
 
243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2743  ABC transporter related  60.85 
 
 
248 aa  272  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  56.25 
 
 
258 aa  272  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.92 
 
 
255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  54.1 
 
 
246 aa  271  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  53.97 
 
 
242 aa  271  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  55.56 
 
 
363 aa  271  7e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  53.97 
 
 
242 aa  271  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  57.2 
 
 
252 aa  271  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  54.66 
 
 
241 aa  271  7e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  58.62 
 
 
243 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  54.7 
 
 
243 aa  271  9e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  54.9 
 
 
267 aa  270  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5514  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  55.87 
 
 
261 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.595344  hitchhiker  0.000996868 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  56.25 
 
 
249 aa  270  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  53.06 
 
 
252 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  56.49 
 
 
256 aa  270  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  57.94 
 
 
242 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1690  ABC transporter related  55.6 
 
 
243 aa  270  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.653327 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  55.19 
 
 
256 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  53.44 
 
 
259 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  52.87 
 
 
246 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  60 
 
 
245 aa  270  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  53.33 
 
 
244 aa  270  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1849  ABC transporter related  53.82 
 
 
251 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  58.02 
 
 
253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  57.56 
 
 
250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  56.12 
 
 
254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  55.93 
 
 
257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  55.23 
 
 
244 aa  269  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  56.6 
 
 
257 aa  269  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  57.39 
 
 
257 aa  269  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  55.98 
 
 
244 aa  268  4e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.44 
 
 
252 aa  268  4e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>