More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7665 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 255 aa  527  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  82.19 
 
 		 254 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  80.32 
 
 		 254 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_003296  RS05401  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  73.03 
 
 		 244 aa  360  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  68.88 
 
 		 245 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  69.58 
 
 		 244 aa  345  6e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6371  ABC transporter related  68.38 
 
 		 256 aa  343  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  66.8 
 
 		 249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  65.56 
 
 		 249 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  65.98 
 
 		 249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0894  ABC transporter related  66.53 
 
 		 242 aa  325  6e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213179  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  63.07 
 
 		 247 aa  325  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  65.98 
 
 		 249 aa  324  7e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9237  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  63.07 
 
 		 242 aa  320  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185509  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  60.83 
 
 		 242 aa  306  3e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3478  ABC transporter related  62.24 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  59.17 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  59.67 
 
 		 249 aa  298  5e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  59.92 
 
 		 244 aa  298  5e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  57.5 
 
 		 242 aa  297  9e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  57.92 
 
 		 242 aa  295  3e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  59.17 
 
 		 252 aa  295  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  57.5 
 
 		 242 aa  295  4e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  58.33 
 
 		 246 aa  295  6e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  60.42 
 
 		 262 aa  294  7e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  58.75 
 
 		 255 aa  294  8e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  56.25 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  58.26 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.26 
 
 		 244 aa  292  3e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  57.5 
 
 		 241 aa  291  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  57.5 
 
 		 241 aa  291  5e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4528  ABC transporter related  57.5 
 
 		 250 aa  291  7e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  59.5 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  57.02 
 
 		 254 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  60.42 
 
 		 250 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.58 
 
 		 257 aa  289  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  57.71 
 
 		 252 aa  290  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  57.02 
 
 		 254 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  58.75 
 
 		 242 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  57.02 
 
 		 242 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  58.33 
 
 		 247 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  58.33 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  57.92 
 
 		 248 aa  289  3e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  59.17 
 
 		 261 aa  288  4e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  57.08 
 
 		 241 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  57.92 
 
 		 246 aa  289  4e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  57.85 
 
 		 249 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  57.08 
 
 		 241 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  55.83 
 
 		 240 aa  288  6e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  59.58 
 
 		 248 aa  288  8e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  52.99 
 
 		 248 aa  287  9e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  57.92 
 
 		 253 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1427  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.25 
 
 		 254 aa  286  1e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.798316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  56.28 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  57.44 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  56.67 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  57.08 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  56.67 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  57.26 
 
 		 243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 		 240 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  55.37 
 
 		 247 aa  286  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  57.45 
 
 		 244 aa  285  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  57.85 
 
 		 245 aa  285  2.9999999999999996e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  53.5 
 
 		 246 aa  285  4e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  57.08 
 
 		 246 aa  285  4e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2622  ABC transporter related  58.75 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0834  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  57.03 
 
 		 249 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  55.78 
 
 		 252 aa  285  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  59.17 
 
 		 251 aa  284  8e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 		 270 aa  284  8e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  55.69 
 
 		 253 aa  284  8e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  56.61 
 
 		 249 aa  284  8e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  59.17 
 
 		 258 aa  284  8e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  57.61 
 
 		 245 aa  284  9e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  56.25 
 
 		 246 aa  284  9e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  56.2 
 
 		 273 aa  284  9e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  60 
 
 		 264 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  54.13 
 
 		 242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  59.58 
 
 		 257 aa  283  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  55.83 
 
 		 259 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  55.21 
 
 		 268 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  59.09 
 
 		 252 aa  284  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  59.17 
 
 		 251 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  56.02 
 
 		 239 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.16 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  56.67 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  56.67 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  56.67 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 241 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  55.51 
 
 		 246 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  57.92 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  55.79 
 
 		 249 aa  282  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  54.32 
 
 		 251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  58.33 
 
 		 242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0917  ABC transporter related  60.08 
 
 		 240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.834023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.02 
 
 		 284 aa  281  6.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.55 
 
 		 244 aa  281  6.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  57.5 
 
 		 253 aa  281  7.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  52.71 
 
 		 268 aa  281  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  55.37 
 
 		 258 aa  281  8.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>