More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05401 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05401  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  100 
 
 		 244 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6371  ABC transporter related  82.79 
 
 		 256 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  74.18 
 
 		 245 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  73.86 
 
 		 254 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  73.97 
 
 		 254 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  73.03 
 
 		 255 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  73.86 
 
 		 244 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  70.37 
 
 		 247 aa  358  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  68.31 
 
 		 249 aa  342  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  68.31 
 
 		 249 aa  339  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  68.31 
 
 		 249 aa  338  2.9999999999999998e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  67.49 
 
 		 249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9237  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  61.89 
 
 		 242 aa  325  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185509  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0894  ABC transporter related  64.46 
 
 		 242 aa  324  8.000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213179  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  62.04 
 
 		 243 aa  314  9e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  60.66 
 
 		 252 aa  312  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  60.17 
 
 		 242 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  61 
 
 		 242 aa  311  4.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  60.08 
 
 		 244 aa  311  5.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  59.43 
 
 		 242 aa  310  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  61.22 
 
 		 243 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  58.92 
 
 		 248 aa  308  4e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  58.92 
 
 		 242 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  61.41 
 
 		 249 aa  308  6.999999999999999e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  58.92 
 
 		 242 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  59.43 
 
 		 259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  58.09 
 
 		 246 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  62.3 
 
 		 248 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  59.59 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  58.51 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  61.07 
 
 		 254 aa  301  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  61.07 
 
 		 254 aa  301  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3478  ABC transporter related  62.4 
 
 		 242 aa  301  5.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  61.89 
 
 		 242 aa  301  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  60.17 
 
 		 246 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  61.07 
 
 		 242 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  58.2 
 
 		 253 aa  300  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  61.89 
 
 		 251 aa  301  9e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  59.02 
 
 		 242 aa  301  9e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4070  ABC transporter-related protein  59.11 
 
 		 245 aa  300  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  59.84 
 
 		 241 aa  299  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  60.5 
 
 		 259 aa  299  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  59.17 
 
 		 268 aa  299  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  59.02 
 
 		 242 aa  299  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  60.56 
 
 		 259 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  61.07 
 
 		 244 aa  298  6e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  55.74 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  60.66 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  58.09 
 
 		 255 aa  297  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  59.58 
 
 		 273 aa  296  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  61.09 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.43 
 
 		 251 aa  295  3e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4174  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.76 
 
 		 244 aa  295  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481199  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  59.75 
 
 		 241 aa  295  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  59.43 
 
 		 248 aa  296  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  59.26 
 
 		 262 aa  295  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  59.75 
 
 		 248 aa  296  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4373  ABC transporter related  61.22 
 
 		 264 aa  295  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2622  ABC transporter related  59.75 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.58 
 
 		 240 aa  295  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  55.74 
 
 		 248 aa  295  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  58.44 
 
 		 262 aa  295  5e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  59.34 
 
 		 254 aa  295  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  58.44 
 
 		 262 aa  295  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  61.51 
 
 		 240 aa  295  6e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  58.16 
 
 		 247 aa  295  6e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  59.43 
 
 		 248 aa  295  6e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  60.25 
 
 		 244 aa  295  6e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  57.38 
 
 		 243 aa  294  7e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  58.33 
 
 		 258 aa  294  7e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07290  amino acid ABC transporter, ATP binding component  61.38 
 
 		 244 aa  294  7e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.175528  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  58.61 
 
 		 245 aa  294  9e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0337  ABC transporter related  58.61 
 
 		 272 aa  294  9e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1563  ABC transporter related  60.66 
 
 		 242 aa  293  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0142744  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0306  ABC glutamate/aspartate transporter, inner membrane subunit GltL  58.61 
 
 		 272 aa  294  1e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0460  ABC transporter related  60.16 
 
 		 244 aa  293  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  58.2 
 
 		 262 aa  294  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1367  ABC transporter related  58.7 
 
 		 245 aa  293  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.769758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  57.79 
 
 		 249 aa  294  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  57.79 
 
 		 249 aa  293  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  59.43 
 
 		 244 aa  294  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.2 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  60.17 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  60.66 
 
 		 260 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  59.34 
 
 		 248 aa  293  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0402  ABC transporter-related protein  59.76 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  60.17 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.54 
 
 		 264 aa  292  3e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  59.34 
 
 		 254 aa  292  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  58.94 
 
 		 244 aa  292  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 251 aa  292  4e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  58.09 
 
 		 246 aa  291  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3583  ABC transporter related  59.75 
 
 		 241 aa  291  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161673  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  59.43 
 
 		 259 aa  291  6e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  59.84 
 
 		 258 aa  291  6e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4538  ABC transporter-like  58.13 
 
 		 244 aa  291  8e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247485  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.79 
 
 		 257 aa  291  8e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  58.78 
 
 		 245 aa  291  9e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0591  ABC transporter related  58.3 
 
 		 245 aa  290  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  57.55 
 
 		 256 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>