More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0447 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 248 aa  515  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05950  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  73.97 
 
 		 247 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000214  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71.9 
 
 		 244 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0204  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  68.49 
 
 		 239 aa  348  6e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.701946  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  65.84 
 
 		 259 aa  340  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.79 
 
 		 252 aa  338  4e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.79 
 
 		 252 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.79 
 
 		 252 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  63.79 
 
 		 252 aa  338  7e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  63.79 
 
 		 252 aa  338  7e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  63.79 
 
 		 252 aa  338  7e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.79 
 
 		 252 aa  338  7e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.79 
 
 		 252 aa  338  7e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  63.79 
 
 		 252 aa  338  7e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  62.4 
 
 		 259 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  62.86 
 
 		 252 aa  334  9e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  63.56 
 
 		 249 aa  333  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.89 
 
 		 251 aa  333  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  61.07 
 
 		 253 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  64.46 
 
 		 248 aa  332  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  64.46 
 
 		 248 aa  333  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  60.82 
 
 		 255 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  63.2 
 
 		 251 aa  332  4e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  63.37 
 
 		 253 aa  330  9e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  62.3 
 
 		 251 aa  330  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  63.01 
 
 		 249 aa  330  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.48 
 
 		 251 aa  330  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  60.4 
 
 		 252 aa  330  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  61.48 
 
 		 247 aa  329  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  61.11 
 
 		 253 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  63.01 
 
 		 249 aa  329  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  63.37 
 
 		 253 aa  329  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  60.82 
 
 		 267 aa  329  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  61.92 
 
 		 273 aa  328  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.92 
 
 		 269 aa  328  7e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  60.48 
 
 		 254 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  62.55 
 
 		 268 aa  327  8e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  60.64 
 
 		 256 aa  327  8e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  62.24 
 
 		 254 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.08 
 
 		 254 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  62.24 
 
 		 258 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  63.6 
 
 		 251 aa  326  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  60.08 
 
 		 254 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  63.07 
 
 		 263 aa  326  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  60.08 
 
 		 254 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.85 
 
 		 251 aa  326  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  62 
 
 		 253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.92 
 
 		 249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  64.46 
 
 		 242 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  61.83 
 
 		 254 aa  325  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  62.04 
 
 		 253 aa  325  5e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  63.64 
 
 		 242 aa  325  5e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  61.83 
 
 		 262 aa  324  7e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  60.16 
 
 		 263 aa  324  7e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  61.83 
 
 		 262 aa  324  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  60.82 
 
 		 258 aa  324  8.000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  60.82 
 
 		 258 aa  324  8.000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  60.91 
 
 		 254 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.41 
 
 		 254 aa  323  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  61.51 
 
 		 273 aa  323  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  61.83 
 
 		 262 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  62.81 
 
 		 255 aa  323  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  60.41 
 
 		 257 aa  322  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  62.39 
 
 		 258 aa  322  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  60.41 
 
 		 257 aa  321  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  58.7 
 
 		 269 aa  322  5e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  64.17 
 
 		 265 aa  321  6e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  63.37 
 
 		 248 aa  321  6e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  60.08 
 
 		 250 aa  321  6e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  59.2 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  60.41 
 
 		 266 aa  320  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  60.67 
 
 		 250 aa  318  5e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  59.2 
 
 		 252 aa  318  5e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1702  ABC transporter related  61.11 
 
 		 253 aa  317  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.478201 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  61.22 
 
 		 244 aa  317  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  59.52 
 
 		 261 aa  317  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  60.66 
 
 		 267 aa  315  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  60 
 
 		 245 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  59.58 
 
 		 246 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2412  ABC transporter related  58.47 
 
 		 250 aa  315  6e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  60.25 
 
 		 265 aa  315  6e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  57.96 
 
 		 247 aa  313  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  59.58 
 
 		 246 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  60.08 
 
 		 257 aa  313  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  57.85 
 
 		 261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  57.96 
 
 		 247 aa  312  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  61 
 
 		 241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2068  ABC transporter related  59.18 
 
 		 247 aa  312  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  58.87 
 
 		 254 aa  312  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1599  ABC transporter related  62.3 
 
 		 261 aa  312  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  61.67 
 
 		 267 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  59.09 
 
 		 244 aa  311  4.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  61.83 
 
 		 244 aa  311  5.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  59.67 
 
 		 243 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  58.13 
 
 		 249 aa  311  9e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  60.49 
 
 		 246 aa  310  1e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  59.17 
 
 		 246 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  58.68 
 
 		 242 aa  310  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  58.85 
 
 		 243 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  61.32 
 
 		 246 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>