More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3478 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3478  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  491  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  65 
 
 		 249 aa  310  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  62.5 
 
 		 247 aa  310  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  63.33 
 
 		 249 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  61.98 
 
 		 254 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 270 aa  303  1.0000000000000001e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  62.24 
 
 		 255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  59.83 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  62.24 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  63.75 
 
 		 249 aa  301  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  62.92 
 
 		 249 aa  301  7.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9237  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  61.25 
 
 		 242 aa  299  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185509  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  62.34 
 
 		 250 aa  298  7e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  58.58 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  61.51 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  59.41 
 
 		 242 aa  294  7e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  61.51 
 
 		 244 aa  292  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  61.18 
 
 		 251 aa  292  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  61.92 
 
 		 255 aa  292  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  58.58 
 
 		 249 aa  291  5e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  59.41 
 
 		 249 aa  291  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  61.51 
 
 		 264 aa  291  7e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  59.17 
 
 		 245 aa  291  8e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  60.67 
 
 		 244 aa  291  9e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  61.09 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  60.34 
 
 		 258 aa  290  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.83 
 
 		 257 aa  290  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  60.67 
 
 		 244 aa  289  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  59.41 
 
 		 254 aa  289  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  59.41 
 
 		 254 aa  289  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  60.25 
 
 		 247 aa  289  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  60.25 
 
 		 242 aa  288  4e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  59.41 
 
 		 242 aa  289  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  57.74 
 
 		 242 aa  288  7e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  59.41 
 
 		 248 aa  288  7e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  59.41 
 
 		 256 aa  287  9e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  56.49 
 
 		 246 aa  287  9e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  59.41 
 
 		 239 aa  286  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  60 
 
 		 243 aa  286  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  59.41 
 
 		 242 aa  287  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_003296  RS05401  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  62.4 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  60.42 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.83 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  59.83 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  58.58 
 
 		 252 aa  285  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  59.41 
 
 		 244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  58.58 
 
 		 259 aa  284  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  56.49 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  57.32 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  57.32 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  60.42 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  59 
 
 		 246 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  61.18 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  57.32 
 
 		 255 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  57.32 
 
 		 261 aa  282  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  59 
 
 		 247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  59.83 
 
 		 246 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  59 
 
 		 251 aa  281  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  56.49 
 
 		 242 aa  281  9e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  57.74 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  60.67 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  55.65 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  60.74 
 
 		 249 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  58.58 
 
 		 257 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  58.16 
 
 		 253 aa  279  2e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  59.83 
 
 		 262 aa  279  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.58 
 
 		 253 aa  278  4e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  57.32 
 
 		 246 aa  278  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  59 
 
 		 244 aa  278  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.23 
 
 		 240 aa  278  6e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  55.65 
 
 		 240 aa  278  6e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  58.58 
 
 		 248 aa  278  7e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  58.58 
 
 		 253 aa  278  8e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  59.58 
 
 		 241 aa  278  8e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  58.58 
 
 		 251 aa  278  8e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  57.32 
 
 		 244 aa  277  9e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  59 
 
 		 252 aa  277  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  57.74 
 
 		 251 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  60.25 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59 
 
 		 252 aa  276  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  58.58 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  58.16 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  56.9 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  56.07 
 
 		 248 aa  275  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  57.32 
 
 		 246 aa  275  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0528  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.07 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191469  normal  0.015863 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  58.54 
 
 		 259 aa  275  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  57.14 
 
 		 250 aa  275  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  57.32 
 
 		 241 aa  275  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  57.74 
 
 		 249 aa  275  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  58.58 
 
 		 253 aa  275  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  57.32 
 
 		 249 aa  275  5e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  57.32 
 
 		 251 aa  275  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1936  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.92 
 
 		 245 aa  275  6e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0352158  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  56.9 
 
 		 253 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.58 
 
 		 240 aa  274  7e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0894  ABC transporter related  57.68 
 
 		 242 aa  274  8e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213179  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  55.93 
 
 		 243 aa  274  8e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  57.14 
 
 		 246 aa  274  9e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  57.32 
 
 		 265 aa  274  9e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>