More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9237 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9237  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 242 aa  497  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185509  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  63.64 
 
 		 245 aa  332  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  62.34 
 
 		 244 aa  329  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  62.5 
 
 		 247 aa  329  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  61.16 
 
 		 254 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  61.83 
 
 		 254 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  62.08 
 
 		 249 aa  321  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  63.07 
 
 		 255 aa  320  9.000000000000001e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  63.18 
 
 		 244 aa  318  6e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  61.25 
 
 		 249 aa  317  9e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  61.67 
 
 		 249 aa  315  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0894  ABC transporter related  62.24 
 
 		 242 aa  314  9e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213179  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05401  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  61.89 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6371  ABC transporter related  63.93 
 
 		 256 aa  312  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  60.83 
 
 		 249 aa  311  5.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  58.58 
 
 		 242 aa  310  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  58.58 
 
 		 242 aa  305  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  57.32 
 
 		 242 aa  304  7e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  58.58 
 
 		 242 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  57.61 
 
 		 243 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  57.85 
 
 		 242 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  58.02 
 
 		 243 aa  300  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  61.09 
 
 		 244 aa  300  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  58.58 
 
 		 244 aa  299  3e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3478  ABC transporter related  61.25 
 
 		 242 aa  299  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  57.85 
 
 		 243 aa  298  4e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  54.96 
 
 		 246 aa  296  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  59.58 
 
 		 249 aa  297  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  58.26 
 
 		 242 aa  296  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  58.58 
 
 		 255 aa  295  4e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  59.41 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  59.41 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  57.2 
 
 		 243 aa  294  7e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  57.32 
 
 		 241 aa  294  7e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6962  ABC transporter related  57.32 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  57.32 
 
 		 246 aa  293  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0446  putative polar amino acid transport system ATP-binding protein  58.2 
 
 		 244 aa  291  5e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  59.23 
 
 		 249 aa  289  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  57.68 
 
 		 262 aa  288  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  57.68 
 
 		 262 aa  288  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  56.07 
 
 		 242 aa  288  5.0000000000000004e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  58.44 
 
 		 248 aa  288  6e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  56.49 
 
 		 247 aa  288  6e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1367  ABC transporter related  57.96 
 
 		 245 aa  288  8e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.769758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4070  ABC transporter-related protein  57.14 
 
 		 245 aa  287  8e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  56.85 
 
 		 262 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  57.98 
 
 		 257 aa  287  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  57.74 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  58.58 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  57.74 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  59 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  55.79 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2258  ABC transporter related  58.26 
 
 		 286 aa  286  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.633697 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  56.9 
 
 		 240 aa  286  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  55.37 
 
 		 242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3583  ABC transporter related  58.58 
 
 		 241 aa  285  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161673  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4538  ABC transporter-like  57.38 
 
 		 244 aa  285  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247485  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  58.16 
 
 		 241 aa  285  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  54.96 
 
 		 242 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  56.07 
 
 		 246 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  57.44 
 
 		 243 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0591  ABC transporter related  57.55 
 
 		 245 aa  284  8e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  57.44 
 
 		 241 aa  284  8e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46950  putative ATP-binding component of ABC transporter  56.97 
 
 		 244 aa  284  8e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.832772  hitchhiker  0.00625095 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0612  ABC transporter related  57.55 
 
 		 245 aa  284  8e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4021  ABC transporter-related protein  56.15 
 
 		 244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248641 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0600  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter ATPase  58.16 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.252228  normal  0.258453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0189  ABC transporter related  59 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0639  ABC transporter related  59 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0672  ABC transporter related  59 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  58.23 
 
 		 244 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.07 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  56.61 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  59.09 
 
 		 245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3758  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  59 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2685  ABC transporter-related protein  56.15 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.480561 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1216  ABC transporter related  57.14 
 
 		 245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4046  ABC transporter ATP-binding protein  56.97 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  55.37 
 
 		 249 aa  282  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3142  ABC transporter related protein  58.58 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1189  ABC transporter related  58.58 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703067  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  56.97 
 
 		 244 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1547  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.74 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  58.26 
 
 		 245 aa  281  5.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  55.65 
 
 		 242 aa  281  6.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 240 aa  281  6.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  55.37 
 
 		 242 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0987  ABC transporter related  56.85 
 
 		 244 aa  281  7.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  56.9 
 
 		 240 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  56.2 
 
 		 266 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.74 
 
 		 252 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  56.72 
 
 		 246 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5607  ABC transporter related  57.38 
 
 		 244 aa  281  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  57.74 
 
 		 240 aa  281  9e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2711  ABC transporter related  58.58 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  54.96 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3359  ABC transporter related  57.32 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00170504  hitchhiker  0.00000222316 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6712  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  59 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  57.02 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0719  ABC transporter related  57.38 
 
 		 244 aa  280  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.649778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>