More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6371 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6371  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  77.87 
 
 		 245 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05401  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  82.79 
 
 		 244 aa  407  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  77.18 
 
 		 244 aa  398  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  70.2 
 
 		 254 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  72.2 
 
 		 254 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  68.38 
 
 		 255 aa  364  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  69.14 
 
 		 247 aa  360  9e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  68.72 
 
 		 249 aa  351  5.9999999999999994e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  68.03 
 
 		 249 aa  348  5e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  67.62 
 
 		 249 aa  346  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  68.03 
 
 		 249 aa  341  7e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9237  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  63.93 
 
 		 242 aa  331  6e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185509  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0894  ABC transporter related  62.4 
 
 		 242 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213179  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  58.92 
 
 		 242 aa  316  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  60.82 
 
 		 243 aa  315  5e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4538  ABC transporter-like  62.6 
 
 		 244 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247485  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  60.41 
 
 		 243 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  58.92 
 
 		 242 aa  311  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  60.17 
 
 		 249 aa  311  6.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  60.25 
 
 		 242 aa  311  6.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  59.18 
 
 		 253 aa  310  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  59.34 
 
 		 242 aa  310  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  59.02 
 
 		 242 aa  308  8e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  58.09 
 
 		 242 aa  307  9e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4174  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.38 
 
 		 244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481199  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  55.47 
 
 		 246 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  58.2 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  59.34 
 
 		 248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  60.71 
 
 		 260 aa  305  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  61.89 
 
 		 242 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.84 
 
 		 257 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  61.38 
 
 		 244 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  58.94 
 
 		 247 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  57.14 
 
 		 259 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  59.43 
 
 		 242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  58.78 
 
 		 243 aa  304  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0591  ABC transporter related  59.92 
 
 		 245 aa  304  9.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0612  ABC transporter related  59.92 
 
 		 245 aa  304  9.000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0460  ABC transporter related  60.16 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  58.92 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  59.5 
 
 		 244 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0306  ABC glutamate/aspartate transporter, inner membrane subunit GltL  57.83 
 
 		 272 aa  301  5.000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  58.4 
 
 		 254 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46950  putative ATP-binding component of ABC transporter  60.57 
 
 		 244 aa  301  9e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.832772  hitchhiker  0.00625095 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0337  ABC transporter related  57.83 
 
 		 272 aa  300  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0402  ABC transporter-related protein  60.16 
 
 		 244 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  61.89 
 
 		 266 aa  300  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  58.78 
 
 		 246 aa  300  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  59.43 
 
 		 241 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  56.05 
 
 		 259 aa  299  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1367  ABC transporter related  58.7 
 
 		 245 aa  298  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.769758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  57.6 
 
 		 254 aa  298  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2258  ABC transporter related  60.32 
 
 		 286 aa  298  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.633697 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4046  ABC transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 		 244 aa  297  9e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  60 
 
 		 258 aa  297  9e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  58.1 
 
 		 265 aa  297  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  59.61 
 
 		 258 aa  297  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  58.51 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000214  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.38 
 
 		 244 aa  296  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  56.15 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  58.92 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  57.14 
 
 		 257 aa  296  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4070  ABC transporter-related protein  58.3 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  57.68 
 
 		 255 aa  295  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  59.52 
 
 		 252 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  56.5 
 
 		 249 aa  296  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  59.6 
 
 		 259 aa  295  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  57.32 
 
 		 247 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  58.54 
 
 		 245 aa  295  4e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  56.65 
 
 		 261 aa  295  5e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4021  ABC transporter-related protein  58.94 
 
 		 244 aa  295  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  57.38 
 
 		 262 aa  295  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0446  putative polar amino acid transport system ATP-binding protein  60.98 
 
 		 244 aa  295  6e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.94 
 
 		 264 aa  295  6e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3478  ABC transporter related  60.74 
 
 		 242 aa  295  6e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  56.68 
 
 		 250 aa  295  6e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07290  amino acid ABC transporter, ATP binding component  60.16 
 
 		 244 aa  295  7e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.175528  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  54.94 
 
 		 253 aa  293  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05950  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 		 247 aa  293  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2685  ABC transporter-related protein  58.94 
 
 		 244 aa  294  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.480561 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  58.2 
 
 		 261 aa  294  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  56.5 
 
 		 249 aa  293  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1563  ABC transporter related  59.02 
 
 		 242 aa  293  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0142744  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0679  ABC transporter related  57.83 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  59.43 
 
 		 244 aa  292  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  59.34 
 
 		 248 aa  292  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  56.13 
 
 		 253 aa  292  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  57.08 
 
 		 273 aa  292  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  53.66 
 
 		 248 aa  293  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0987  ABC transporter related  58.37 
 
 		 244 aa  292  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15420  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.96 
 
 		 274 aa  292  4e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  57.68 
 
 		 246 aa  292  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  58.33 
 
 		 244 aa  292  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  55.2 
 
 		 265 aa  292  4e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  56.61 
 
 		 268 aa  292  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 		 240 aa  291  5e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  59.43 
 
 		 243 aa  291  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4373  ABC transporter related  58.37 
 
 		 264 aa  291  5e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  58.92 
 
 		 248 aa  291  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>