More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05950 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05950  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 247 aa  513  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000214  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  89.75 
 
 		 244 aa  464  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  73.97 
 
 		 248 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0204  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  71.43 
 
 		 239 aa  364  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.701946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  65.45 
 
 		 267 aa  341  5.999999999999999e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  64.68 
 
 		 268 aa  340  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  66.94 
 
 		 259 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  65.7 
 
 		 258 aa  338  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  65.7 
 
 		 258 aa  338  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  65.98 
 
 		 257 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  65.27 
 
 		 256 aa  335  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  65.29 
 
 		 269 aa  335  5e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.56 
 
 		 269 aa  334  7.999999999999999e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  64.73 
 
 		 258 aa  334  7.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  65.15 
 
 		 257 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  64.2 
 
 		 262 aa  332  4e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  64.2 
 
 		 262 aa  332  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.15 
 
 		 249 aa  330  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  64.2 
 
 		 262 aa  330  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  63.37 
 
 		 263 aa  329  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.49 
 
 		 251 aa  328  4e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  62.96 
 
 		 258 aa  327  8e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  63.56 
 
 		 249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  62.96 
 
 		 263 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  63.01 
 
 		 273 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  63.64 
 
 		 252 aa  325  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  63.56 
 
 		 249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  63.18 
 
 		 259 aa  325  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  63.07 
 
 		 266 aa  324  9e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  62.6 
 
 		 265 aa  323  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  64.56 
 
 		 253 aa  322  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  62.08 
 
 		 254 aa  322  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  62.6 
 
 		 249 aa  322  5e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.38 
 
 		 252 aa  320  9.000000000000001e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.38 
 
 		 252 aa  320  9.000000000000001e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.38 
 
 		 252 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  62.08 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  61.69 
 
 		 248 aa  320  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  60.98 
 
 		 252 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  60.98 
 
 		 252 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  60.98 
 
 		 252 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  60.98 
 
 		 252 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  62.4 
 
 		 255 aa  319  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.98 
 
 		 252 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  61.69 
 
 		 248 aa  319  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  62.2 
 
 		 273 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.67 
 
 		 254 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  61.67 
 
 		 254 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  61.67 
 
 		 254 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  62.66 
 
 		 257 aa  319  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.98 
 
 		 252 aa  318  5e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  61.29 
 
 		 253 aa  318  5e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  61.69 
 
 		 253 aa  318  7e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1599  ABC transporter related  65.69 
 
 		 261 aa  318  7e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  62.92 
 
 		 253 aa  318  7e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1702  ABC transporter related  58.63 
 
 		 253 aa  317  7.999999999999999e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.478201 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2068  ABC transporter related  61.79 
 
 		 247 aa  317  7.999999999999999e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  61.67 
 
 		 254 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  61.57 
 
 		 252 aa  317  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  61.89 
 
 		 247 aa  316  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  61.73 
 
 		 252 aa  316  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  60.32 
 
 		 251 aa  316  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.25 
 
 		 254 aa  316  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  61.48 
 
 		 267 aa  316  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  59.76 
 
 		 247 aa  315  4e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  61.69 
 
 		 261 aa  314  8e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  61.98 
 
 		 253 aa  313  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  59.02 
 
 		 261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  61 
 
 		 251 aa  312  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  62.14 
 
 		 267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  60.17 
 
 		 255 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 		 251 aa  311  4.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  58.94 
 
 		 253 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3991  ABC transporter related  58.06 
 
 		 261 aa  311  7.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  60 
 
 		 250 aa  310  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  61.67 
 
 		 246 aa  309  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  60 
 
 		 254 aa  309  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  61.92 
 
 		 250 aa  308  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 		 251 aa  308  5e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  61.54 
 
 		 254 aa  308  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  61.73 
 
 		 257 aa  308  6.999999999999999e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4182  ABC transporter related protein  57.66 
 
 		 261 aa  307  9e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  61.25 
 
 		 246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  61.25 
 
 		 246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  60.68 
 
 		 249 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  60.42 
 
 		 255 aa  305  6e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  58.33 
 
 		 242 aa  304  7e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  60 
 
 		 245 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  58.7 
 
 		 251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  57.96 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3584  ABC transporter related  60.74 
 
 		 255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal  0.0302261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  59.84 
 
 		 265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  57.85 
 
 		 242 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  58.68 
 
 		 247 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  58.68 
 
 		 242 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  58.37 
 
 		 254 aa  301  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  57.61 
 
 		 260 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  61.02 
 
 		 249 aa  300  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  60.59 
 
 		 249 aa  300  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  61.44 
 
 		 249 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>