More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1477 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  93.8 
 
 		 242 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  74.38 
 
 		 243 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0550  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  74.79 
 
 		 243 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0606  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  74.38 
 
 		 243 aa  355  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0551  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  74.38 
 
 		 243 aa  355  2.9999999999999997e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0639  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  74.38 
 
 		 243 aa  355  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533598  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0696  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.38 
 
 		 284 aa  355  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0707  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.38 
 
 		 298 aa  355  5e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0675  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.38 
 
 		 242 aa  355  5e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0768  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.97 
 
 		 243 aa  355  5e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4663  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.38 
 
 		 242 aa  354  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.583474  hitchhiker  2.7569099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  69.71 
 
 		 244 aa  351  5.9999999999999994e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  69.14 
 
 		 243 aa  349  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  69.14 
 
 		 243 aa  349  3e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  68.72 
 
 		 243 aa  348  4e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0552  ABC transporter related  73.55 
 
 		 243 aa  348  5e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  63.9 
 
 		 262 aa  345  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  63.9 
 
 		 262 aa  345  5e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  65.42 
 
 		 242 aa  343  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  64.32 
 
 		 262 aa  343  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  65.7 
 
 		 242 aa  342  4e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  64.68 
 
 		 256 aa  340  9e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  64.05 
 
 		 259 aa  339  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  63.98 
 
 		 263 aa  338  5e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  62.66 
 
 		 258 aa  337  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  63.07 
 
 		 253 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  63.64 
 
 		 255 aa  337  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  63.64 
 
 		 244 aa  336  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  62.92 
 
 		 242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  62.92 
 
 		 242 aa  335  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  62.66 
 
 		 263 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0528  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  66.67 
 
 		 258 aa  334  7e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191469  normal  0.015863 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  63.07 
 
 		 266 aa  333  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  62.98 
 
 		 258 aa  333  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  61.67 
 
 		 258 aa  333  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  61.67 
 
 		 258 aa  333  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  63.4 
 
 		 257 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  63.22 
 
 		 248 aa  333  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.7 
 
 		 269 aa  333  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  62.55 
 
 		 267 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  61.7 
 
 		 269 aa  332  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  63.83 
 
 		 257 aa  332  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  63.07 
 
 		 253 aa  333  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  63.07 
 
 		 253 aa  332  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  63.22 
 
 		 246 aa  332  4e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  62.24 
 
 		 254 aa  331  8e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.7 
 
 		 249 aa  330  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  64.58 
 
 		 240 aa  330  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  62.5 
 
 		 250 aa  330  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  62.66 
 
 		 253 aa  330  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  62.71 
 
 		 257 aa  330  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  62.24 
 
 		 254 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  62.4 
 
 		 267 aa  329  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  62.08 
 
 		 242 aa  330  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.83 
 
 		 254 aa  328  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.41 
 
 		 252 aa  329  3e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  61.41 
 
 		 254 aa  328  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  65.56 
 
 		 244 aa  329  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  62.5 
 
 		 273 aa  329  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  63.33 
 
 		 249 aa  329  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  62.92 
 
 		 246 aa  328  4e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  64.58 
 
 		 259 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  62.24 
 
 		 253 aa  328  5.0000000000000004e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.41 
 
 		 252 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.41 
 
 		 252 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  61.41 
 
 		 252 aa  327  8e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  63.07 
 
 		 244 aa  327  8e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61 
 
 		 254 aa  327  9e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  67.08 
 
 		 246 aa  327  9e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  61 
 
 		 254 aa  327  9e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  61 
 
 		 254 aa  327  9e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  61 
 
 		 252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  61 
 
 		 252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  61 
 
 		 252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  61.98 
 
 		 245 aa  327  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61 
 
 		 252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  61 
 
 		 252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  62.71 
 
 		 247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  63.4 
 
 		 268 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.22 
 
 		 257 aa  325  3e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  62.81 
 
 		 242 aa  325  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  62.55 
 
 		 252 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  63.64 
 
 		 248 aa  325  5e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  62.5 
 
 		 251 aa  325  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  64.02 
 
 		 249 aa  325  5e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.58 
 
 		 252 aa  325  5e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  62.4 
 
 		 258 aa  325  5e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  63.6 
 
 		 249 aa  325  6e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  60.74 
 
 		 249 aa  324  6e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  61.18 
 
 		 247 aa  324  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  63.25 
 
 		 246 aa  324  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  59.75 
 
 		 251 aa  324  9e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1000  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  65.56 
 
 		 242 aa  323  1e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  63.22 
 
 		 251 aa  324  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  62.82 
 
 		 245 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0929  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  65.56 
 
 		 242 aa  323  1e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.285427  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  62.34 
 
 		 249 aa  323  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  62.5 
 
 		 240 aa  323  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0892  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  65.56 
 
 		 242 aa  323  1e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.495443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>