More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0306 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0306  ABC glutamate/aspartate transporter, inner membrane subunit GltL  100 
 
 		 272 aa  565  1e-160  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0337  ABC transporter related  95.96 
 
 		 272 aa  547  1e-155  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0679  ABC transporter related  84.96 
 
 		 288 aa  479  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0460  ABC transporter related  73.36 
 
 		 244 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4174  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.36 
 
 		 244 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  73.36 
 
 		 244 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0402  ABC transporter-related protein  72.95 
 
 		 244 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4046  ABC transporter ATP-binding protein  73.77 
 
 		 244 aa  377  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46950  putative ATP-binding component of ABC transporter  73.77 
 
 		 244 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.832772  hitchhiker  0.00625095 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4538  ABC transporter-like  71.31 
 
 		 244 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247485  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5479  ABC transporter related  73.14 
 
 		 242 aa  370  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  72.73 
 
 		 260 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07290  amino acid ABC transporter, ATP binding component  71.72 
 
 		 244 aa  368  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.175528  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0987  ABC transporter related  71.9 
 
 		 244 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1068  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  72.47 
 
 		 256 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  72.2 
 
 		 241 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  71.9 
 
 		 266 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0375  ABC transporter related  74.18 
 
 		 244 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0360  ABC transporter related  74.18 
 
 		 244 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1097  ABC transporter related  72.95 
 
 		 244 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2258  ABC transporter related  71.26 
 
 		 286 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.633697 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  73.03 
 
 		 241 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4344  ABC transporter related  73.36 
 
 		 244 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.379687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4070  ABC transporter-related protein  69.8 
 
 		 245 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  73.03 
 
 		 241 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3583  ABC transporter related  71.37 
 
 		 241 aa  363  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161673  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0484  putative glutamate/aspartate transport ATP-binding ABC transporter protein  73.36 
 
 		 244 aa  362  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1109  ABC transporter related  72.54 
 
 		 244 aa  362  4e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.458635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0719  ABC transporter related  69.67 
 
 		 244 aa  361  6e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.649778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1367  ABC transporter related  69.39 
 
 		 245 aa  361  7.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.769758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0446  putative polar amino acid transport system ATP-binding protein  68.85 
 
 		 244 aa  361  8e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5607  ABC transporter related  69.67 
 
 		 244 aa  360  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4021  ABC transporter-related protein  68.44 
 
 		 244 aa  359  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248641 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2685  ABC transporter-related protein  68.44 
 
 		 244 aa  359  3e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.480561 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0591  ABC transporter related  68.98 
 
 		 245 aa  358  4e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6962  ABC transporter related  70.54 
 
 		 241 aa  358  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0612  ABC transporter related  68.98 
 
 		 245 aa  358  4e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0834  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  70.12 
 
 		 249 aa  358  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  70.54 
 
 		 241 aa  357  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4373  ABC transporter related  69.96 
 
 		 264 aa  354  8.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2090  ABC transporter component  70.66 
 
 		 247 aa  353  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.810567  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2434  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  73.86 
 
 		 241 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.967343  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3758  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  73.44 
 
 		 241 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2619  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  73.86 
 
 		 241 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3428  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  73.86 
 
 		 241 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.901606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3393  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  73.86 
 
 		 241 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0347  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  73.86 
 
 		 241 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.140639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1208  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  73.86 
 
 		 241 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99175  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1228  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  73.44 
 
 		 263 aa  352  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0639  ABC transporter related  73.03 
 
 		 241 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0189  ABC transporter related  73.03 
 
 		 241 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0672  ABC transporter related  73.03 
 
 		 241 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1216  ABC transporter related  67.76 
 
 		 245 aa  351  8.999999999999999e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0673  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  73.03 
 
 		 241 aa  350  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2711  ABC transporter related  73.03 
 
 		 241 aa  350  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0744  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  73.03 
 
 		 241 aa  350  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  67.21 
 
 		 258 aa  350  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2974  ABC transporter related protein  73.03 
 
 		 241 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  67.21 
 
 		 258 aa  350  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0697  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  73.03 
 
 		 241 aa  350  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6712  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  73.03 
 
 		 241 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0680  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  73.03 
 
 		 241 aa  350  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4441  ABC transporter related  68.6 
 
 		 255 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103673 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2993  ABC transporter related  73.03 
 
 		 241 aa  350  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1189  ABC transporter related  72.61 
 
 		 241 aa  349  3e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703067  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3142  ABC transporter related protein  72.61 
 
 		 241 aa  349  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1211  ABC transporter-related protein  71.37 
 
 		 241 aa  348  7e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0600  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter ATPase  71.78 
 
 		 241 aa  348  7e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.252228  normal  0.258453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0831  ABC transporter related  67.61 
 
 		 249 aa  348  8e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0779  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  72.61 
 
 		 241 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0766  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  72.61 
 
 		 241 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0705  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  72.61 
 
 		 241 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0815  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  72.61 
 
 		 241 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1547  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.63 
 
 		 241 aa  346  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4250  ABC transporter related  70.12 
 
 		 257 aa  346  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682054  normal  0.0122802 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4774  ABC transporter related  70.12 
 
 		 241 aa  345  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3359  ABC transporter related  71.37 
 
 		 241 aa  346  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00170504  hitchhiker  0.00000222316 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1563  ABC transporter related  67.77 
 
 		 242 aa  344  8e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0142744  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0597  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  71.78 
 
 		 241 aa  344  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1179  ABC transporter related  71.37 
 
 		 241 aa  343  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0719  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  72.2 
 
 		 241 aa  342  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0655  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  64.75 
 
 		 244 aa  342  5.999999999999999e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205588  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0688  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  64.75 
 
 		 244 aa  342  5.999999999999999e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000562177  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2136  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.22 
 
 		 241 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68203  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  67.22 
 
 		 241 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0775  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  67.22 
 
 		 241 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2609  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  67.22 
 
 		 241 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  67.22 
 
 		 241 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5113  ABC transporter related  69.55 
 
 		 244 aa  339  4e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0263177 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2923  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  70.12 
 
 		 241 aa  338  5.9999999999999996e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.524102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1839  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  70.12 
 
 		 241 aa  338  5.9999999999999996e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3013  ABC transporter related  70.12 
 
 		 241 aa  338  5.9999999999999996e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2956  ABC transporter related  69.71 
 
 		 241 aa  337  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3455  ABC transporter related  66.12 
 
 		 245 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3901  ABC transporter related  66.12 
 
 		 245 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00296946  normal  0.0553921 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3058  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  67.22 
 
 		 241 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  61.79 
 
 		 262 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  61.79 
 
 		 262 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  61.79 
 
 		 262 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6341  ABC transporter related  62.24 
 
 		 233 aa  316  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.879004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>