More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1189 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3142  ABC transporter related protein  100 
 
 		 241 aa  498  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1189  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  498  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703067  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  87.55 
 
 		 241 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  84.65 
 
 		 241 aa  434  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2956  ABC transporter related  89.21 
 
 		 241 aa  431  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  85.06 
 
 		 241 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  85.06 
 
 		 241 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1211  ABC transporter-related protein  89.63 
 
 		 241 aa  428  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2923  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  88.8 
 
 		 241 aa  424  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.524102  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3013  ABC transporter related  88.8 
 
 		 241 aa  424  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1839  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  88.8 
 
 		 241 aa  424  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0779  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  87.97 
 
 		 241 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0766  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  87.97 
 
 		 241 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0673  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  87.55 
 
 		 241 aa  420  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0705  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  87.97 
 
 		 241 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0719  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  88.38 
 
 		 241 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0815  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  87.97 
 
 		 241 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2974  ABC transporter related protein  87.55 
 
 		 241 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0680  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  87.55 
 
 		 241 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0697  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  87.55 
 
 		 241 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2993  ABC transporter related  87.55 
 
 		 241 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0744  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  87.55 
 
 		 241 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1179  ABC transporter related  87.55 
 
 		 241 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0597  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  86.31 
 
 		 241 aa  414  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2711  ABC transporter related  85.89 
 
 		 241 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3758  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  86.72 
 
 		 241 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2434  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  85.48 
 
 		 241 aa  410  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.967343  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3428  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  85.48 
 
 		 241 aa  410  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.901606  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1228  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  85.48 
 
 		 263 aa  410  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2619  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  85.48 
 
 		 241 aa  410  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0639  ABC transporter related  85.89 
 
 		 241 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0600  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter ATPase  85.06 
 
 		 241 aa  411  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.252228  normal  0.258453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0189  ABC transporter related  85.89 
 
 		 241 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0672  ABC transporter related  85.89 
 
 		 241 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3393  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  85.48 
 
 		 241 aa  410  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0347  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  85.48 
 
 		 241 aa  410  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.140639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1208  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  85.48 
 
 		 241 aa  410  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99175  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6712  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  85.48 
 
 		 241 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6962  ABC transporter related  79.67 
 
 		 241 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3359  ABC transporter related  84.65 
 
 		 241 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00170504  hitchhiker  0.00000222316 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4021  ABC transporter-related protein  77.69 
 
 		 244 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248641 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2685  ABC transporter-related protein  77.37 
 
 		 244 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.480561 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1563  ABC transporter related  78.33 
 
 		 242 aa  395  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0142744  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  77.37 
 
 		 244 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2258  ABC transporter related  77.59 
 
 		 286 aa  394  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.633697 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0834  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  77.18 
 
 		 249 aa  394  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5479  ABC transporter related  78.33 
 
 		 242 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3583  ABC transporter related  77.18 
 
 		 241 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161673  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  77.5 
 
 		 266 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4046  ABC transporter ATP-binding protein  77.69 
 
 		 244 aa  390  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  77.08 
 
 		 260 aa  391  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4373  ABC transporter related  78.42 
 
 		 264 aa  391  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0446  putative polar amino acid transport system ATP-binding protein  75.72 
 
 		 244 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0460  ABC transporter related  77.37 
 
 		 244 aa  388  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4538  ABC transporter-like  76.45 
 
 		 244 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247485  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2090  ABC transporter component  77.08 
 
 		 247 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.810567  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0402  ABC transporter-related protein  76.95 
 
 		 244 aa  387  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46950  putative ATP-binding component of ABC transporter  77.27 
 
 		 244 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.832772  hitchhiker  0.00625095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4070  ABC transporter-related protein  76.64 
 
 		 245 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4174  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  75.62 
 
 		 244 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481199  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2136  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  75.52 
 
 		 241 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68203  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1547  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.27 
 
 		 241 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0591  ABC transporter related  76.23 
 
 		 245 aa  384  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  75.52 
 
 		 241 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545359  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  75.52 
 
 		 241 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0612  ABC transporter related  76.23 
 
 		 245 aa  384  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0775  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  75.52 
 
 		 241 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2609  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  75.52 
 
 		 241 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4774  ABC transporter related  77.18 
 
 		 241 aa  380  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1367  ABC transporter related  75.82 
 
 		 245 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.769758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0987  ABC transporter related  74.79 
 
 		 244 aa  378  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4250  ABC transporter related  76.76 
 
 		 257 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682054  normal  0.0122802 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07290  amino acid ABC transporter, ATP binding component  73.97 
 
 		 244 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.175528  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5607  ABC transporter related  72.84 
 
 		 244 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0719  ABC transporter related  72.84 
 
 		 244 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.649778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0831  ABC transporter related  73.77 
 
 		 249 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0484  putative glutamate/aspartate transport ATP-binding ABC transporter protein  78.1 
 
 		 244 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4441  ABC transporter related  72.5 
 
 		 255 aa  371  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  72.08 
 
 		 258 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  72.08 
 
 		 258 aa  371  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0375  ABC transporter related  78.1 
 
 		 244 aa  371  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0360  ABC transporter related  78.1 
 
 		 244 aa  371  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1216  ABC transporter related  73.66 
 
 		 245 aa  371  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3058  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  75.52 
 
 		 241 aa  367  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0679  ABC transporter related  72.92 
 
 		 288 aa  367  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0337  ABC transporter related  72.61 
 
 		 272 aa  369  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0306  ABC glutamate/aspartate transporter, inner membrane subunit GltL  72.61 
 
 		 272 aa  365  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3901  ABC transporter related  73.66 
 
 		 245 aa  362  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00296946  normal  0.0553921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3455  ABC transporter related  72.13 
 
 		 245 aa  358  4e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1109  ABC transporter related  74.9 
 
 		 244 aa  357  8e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.458635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1097  ABC transporter related  74.07 
 
 		 244 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1068  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  74.07 
 
 		 256 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4344  ABC transporter related  74.38 
 
 		 244 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.379687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0655  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  67.77 
 
 		 244 aa  353  1e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205588  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0688  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  67.77 
 
 		 244 aa  353  1e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000562177  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5113  ABC transporter related  69.83 
 
 		 244 aa  350  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0263177 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6341  ABC transporter related  65.98 
 
 		 233 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.879004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  63.07 
 
 		 249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  63.75 
 
 		 262 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  62.66 
 
 		 253 aa  323  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>