More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0894 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0894  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  501  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213179  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  65.83 
 
 		 244 aa  338  4e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  66.26 
 
 		 254 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  65.15 
 
 		 247 aa  331  5e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  67.63 
 
 		 249 aa  329  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  65.29 
 
 		 254 aa  329  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  68.05 
 
 		 249 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  66.53 
 
 		 255 aa  325  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  66.39 
 
 		 249 aa  322  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  66.8 
 
 		 249 aa  321  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  62.66 
 
 		 245 aa  319  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9237  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  62.24 
 
 		 242 aa  314  9e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185509  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05401  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  64.46 
 
 		 244 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  60.42 
 
 		 249 aa  300  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6371  ABC transporter related  62.4 
 
 		 256 aa  299  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  60.42 
 
 		 242 aa  298  6e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  59 
 
 		 259 aa  295  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  59.58 
 
 		 254 aa  292  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  58.68 
 
 		 260 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.68 
 
 		 260 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  58.75 
 
 		 262 aa  291  6e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  59.5 
 
 		 241 aa  291  7e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  58.68 
 
 		 260 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  59.17 
 
 		 254 aa  291  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  57.08 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  57.5 
 
 		 242 aa  290  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2258  ABC transporter related  58.33 
 
 		 286 aa  288  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.633697 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  57.85 
 
 		 242 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2622  ABC transporter related  57.92 
 
 		 241 aa  288  6e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  55.83 
 
 		 246 aa  288  8e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  57.5 
 
 		 242 aa  287  9e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2812  ABC transporter related  57.44 
 
 		 260 aa  286  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.844738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0834  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  59.09 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  58.26 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  58.26 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  57.5 
 
 		 242 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  58.26 
 
 		 242 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  57.5 
 
 		 242 aa  286  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  58.33 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  56.97 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.61 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  60 
 
 		 255 aa  285  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  60 
 
 		 257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  57.02 
 
 		 244 aa  285  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  58.33 
 
 		 242 aa  285  4e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  59.58 
 
 		 251 aa  285  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  58.75 
 
 		 248 aa  285  5.999999999999999e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3583  ABC transporter related  57.89 
 
 		 241 aa  285  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161673  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1547  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.11 
 
 		 241 aa  284  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  55.83 
 
 		 241 aa  284  9e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  58.33 
 
 		 256 aa  283  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  56.85 
 
 		 273 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  57.5 
 
 		 242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  57.5 
 
 		 265 aa  283  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  57.08 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  56.25 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6962  ABC transporter related  56.97 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  58.75 
 
 		 251 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000214  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.42 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2609  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.3 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2136  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.3 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68203  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  55.79 
 
 		 249 aa  281  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0775  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.3 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.3 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545359  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.3 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  58.75 
 
 		 247 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  56.54 
 
 		 243 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  56.2 
 
 		 253 aa  281  7.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0987  ABC transporter related  57.44 
 
 		 244 aa  281  8.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 		 251 aa  281  9e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  55.37 
 
 		 249 aa  281  9e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  59.5 
 
 		 258 aa  281  9e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  57.92 
 
 		 260 aa  280  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  57.02 
 
 		 244 aa  280  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  55.79 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1367  ABC transporter related  58.02 
 
 		 245 aa  280  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.769758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  59.5 
 
 		 258 aa  280  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  57.5 
 
 		 251 aa  280  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  54.96 
 
 		 267 aa  280  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  55.19 
 
 		 252 aa  280  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4250  ABC transporter related  59.09 
 
 		 257 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682054  normal  0.0122802 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4774  ABC transporter related  59.09 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  57.32 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  55.79 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.19 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.09 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  55.79 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4091  ABC transporter related  53.75 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.231596 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  55.83 
 
 		 252 aa  279  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2090  ABC transporter component  57.5 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.810567  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  55.42 
 
 		 251 aa  279  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05950  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.84 
 
 		 247 aa  278  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  55.37 
 
 		 253 aa  278  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0402  ABC transporter-related protein  56.56 
 
 		 244 aa  278  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  55.79 
 
 		 253 aa  278  5e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4070  ABC transporter-related protein  56.79 
 
 		 245 aa  278  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4528  ABC transporter related  56.25 
 
 		 250 aa  278  7e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  55.6 
 
 		 267 aa  278  7e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0337  ABC transporter related  56.67 
 
 		 272 aa  277  8e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>