More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0239 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  497  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  71.07 
 
 		 242 aa  359  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  66.67 
 
 		 243 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  67.08 
 
 		 243 aa  337  8e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  66.26 
 
 		 243 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  65.29 
 
 		 242 aa  335  5e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  63.49 
 
 		 263 aa  327  8e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  63.49 
 
 		 263 aa  327  9e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  62.4 
 
 		 259 aa  323  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  62.92 
 
 		 244 aa  322  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  64.05 
 
 		 242 aa  323  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  62.24 
 
 		 258 aa  322  3e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  61.57 
 
 		 249 aa  322  4e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  61.98 
 
 		 267 aa  320  9.000000000000001e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  62.81 
 
 		 262 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  63.22 
 
 		 242 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.25 
 
 		 251 aa  318  3e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  62.24 
 
 		 262 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  64.05 
 
 		 242 aa  318  5e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  63.52 
 
 		 259 aa  318  6e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  64.17 
 
 		 265 aa  318  6e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  60.58 
 
 		 253 aa  317  7.999999999999999e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  62.66 
 
 		 245 aa  317  9e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  61.41 
 
 		 262 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  60.64 
 
 		 259 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  61.41 
 
 		 262 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  61.16 
 
 		 253 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  60.83 
 
 		 273 aa  316  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.58 
 
 		 252 aa  316  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  62.5 
 
 		 242 aa  316  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  60.33 
 
 		 249 aa  317  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  60.58 
 
 		 253 aa  316  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  62.92 
 
 		 250 aa  315  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  60.49 
 
 		 252 aa  316  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  63.9 
 
 		 244 aa  315  3e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.58 
 
 		 252 aa  315  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.58 
 
 		 252 aa  315  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.83 
 
 		 251 aa  315  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.58 
 
 		 252 aa  316  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  60.58 
 
 		 252 aa  315  5e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  60.58 
 
 		 252 aa  315  5e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.58 
 
 		 252 aa  315  5e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  60.33 
 
 		 249 aa  315  5e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  60.58 
 
 		 252 aa  315  5e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  60.58 
 
 		 252 aa  315  5e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  60.17 
 
 		 253 aa  315  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  61.25 
 
 		 273 aa  314  8e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  60.58 
 
 		 253 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  63.64 
 
 		 261 aa  313  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  60.17 
 
 		 253 aa  313  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  61.67 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.25 
 
 		 269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  60 
 
 		 258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  61.54 
 
 		 249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  61.67 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  62.13 
 
 		 246 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  61 
 
 		 248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  59.75 
 
 		 252 aa  312  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1702  ABC transporter related  60.68 
 
 		 253 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.478201 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  59.51 
 
 		 251 aa  311  5.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  61.25 
 
 		 258 aa  311  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  61.25 
 
 		 258 aa  311  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  60.33 
 
 		 255 aa  311  6.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  63.49 
 
 		 267 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  59.04 
 
 		 252 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  61 
 
 		 246 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  61.57 
 
 		 248 aa  310  9e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  60.17 
 
 		 245 aa  310  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  60.74 
 
 		 247 aa  310  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  61.7 
 
 		 245 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  61.7 
 
 		 267 aa  310  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  62.81 
 
 		 242 aa  310  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.25 
 
 		 249 aa  310  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  59.92 
 
 		 244 aa  310  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  62.24 
 
 		 244 aa  309  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  63.64 
 
 		 251 aa  309  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  61.16 
 
 		 256 aa  310  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.5 
 
 		 251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  59.5 
 
 		 252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  61.98 
 
 		 244 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  60.5 
 
 		 244 aa  309  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  60.58 
 
 		 257 aa  308  4e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  61.16 
 
 		 251 aa  308  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  60.17 
 
 		 254 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  60.42 
 
 		 256 aa  308  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  60.85 
 
 		 246 aa  308  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  61.18 
 
 		 247 aa  307  8e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  60 
 
 		 246 aa  307  9e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  61.98 
 
 		 254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.75 
 
 		 254 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  60.83 
 
 		 242 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  61.98 
 
 		 254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  59.75 
 
 		 254 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  59.75 
 
 		 254 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  61.98 
 
 		 242 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  62.08 
 
 		 246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  60 
 
 		 269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  61.28 
 
 		 257 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  59.09 
 
 		 248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  60.85 
 
 		 246 aa  305  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>