More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4950 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  100 
 
 		 259 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  70.8 
 
 		 252 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2101  ABC transporter related  72.8 
 
 		 252 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.250257 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  65.86 
 
 		 248 aa  337  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  63.18 
 
 		 256 aa  331  6e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  62.85 
 
 		 249 aa  329  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  63.86 
 
 		 244 aa  329  3e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  62.16 
 
 		 253 aa  324  9e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  62.3 
 
 		 245 aa  322  3e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  61.9 
 
 		 245 aa  318  7e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  60.64 
 
 		 241 aa  317  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  61.81 
 
 		 252 aa  314  7e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  60.8 
 
 		 273 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  60.4 
 
 		 246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  60.8 
 
 		 273 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  61.57 
 
 		 260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  59.36 
 
 		 252 aa  308  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.36 
 
 		 252 aa  308  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  56.63 
 
 		 259 aa  308  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.36 
 
 		 252 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.36 
 
 		 252 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  58.66 
 
 		 255 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  57.43 
 
 		 242 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  58.17 
 
 		 247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.57 
 
 		 252 aa  306  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  59.51 
 
 		 246 aa  306  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  57.83 
 
 		 246 aa  305  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  59.04 
 
 		 249 aa  305  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  58.96 
 
 		 252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  58.96 
 
 		 252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.96 
 
 		 252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  58.66 
 
 		 258 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  58.96 
 
 		 252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  59.04 
 
 		 249 aa  305  5.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  58.96 
 
 		 252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  58.66 
 
 		 258 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  58.57 
 
 		 248 aa  305  6e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  58.2 
 
 		 253 aa  305  7e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  58.14 
 
 		 252 aa  304  8.000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  57.83 
 
 		 242 aa  304  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  58.63 
 
 		 246 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.87 
 
 		 269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  58.43 
 
 		 255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  56.69 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  58.23 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  59.26 
 
 		 263 aa  302  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  60 
 
 		 266 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  57.43 
 
 		 242 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.87 
 
 		 249 aa  301  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  58.4 
 
 		 265 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  58.06 
 
 		 263 aa  301  6.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  59.68 
 
 		 254 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  57.49 
 
 		 240 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  58.17 
 
 		 258 aa  301  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  54.05 
 
 		 248 aa  301  7.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  56.92 
 
 		 252 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  58.43 
 
 		 259 aa  301  7.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.29 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.6 
 
 		 251 aa  300  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  59.29 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  57.2 
 
 		 266 aa  300  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  59.29 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  57.03 
 
 		 245 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  57.2 
 
 		 243 aa  300  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  57.66 
 
 		 262 aa  300  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  58.3 
 
 		 244 aa  300  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  56.85 
 
 		 262 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  59.68 
 
 		 251 aa  299  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  56.85 
 
 		 262 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  57.66 
 
 		 258 aa  299  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  59.68 
 
 		 244 aa  300  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  58.54 
 
 		 257 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  57.2 
 
 		 253 aa  300  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  57.71 
 
 		 253 aa  299  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  60.4 
 
 		 258 aa  299  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  59.92 
 
 		 251 aa  299  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  59.68 
 
 		 265 aa  299  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.43 
 
 		 251 aa  299  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  56.8 
 
 		 261 aa  299  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  60.4 
 
 		 258 aa  299  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  58.17 
 
 		 242 aa  298  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  59.51 
 
 		 254 aa  298  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  57.31 
 
 		 251 aa  298  5e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  57.09 
 
 		 269 aa  298  5e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  56.63 
 
 		 246 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  58.13 
 
 		 257 aa  298  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  58.3 
 
 		 253 aa  298  6e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  58.06 
 
 		 257 aa  298  6e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  58.47 
 
 		 247 aa  298  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  59.11 
 
 		 253 aa  298  8e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  59.11 
 
 		 253 aa  298  8e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  58.96 
 
 		 243 aa  297  9e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  57.6 
 
 		 268 aa  297  9e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.2 
 
 		 251 aa  297  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  60.24 
 
 		 254 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  58.47 
 
 		 247 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2258  ABC transporter related  57.25 
 
 		 286 aa  297  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.633697 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  55.04 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  57.83 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  58.2 
 
 		 250 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>