More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2101 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2101  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.250257 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  86.11 
 
 		 252 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  72.8 
 
 		 259 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  69.05 
 
 		 248 aa  357  8e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  65.59 
 
 		 249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  63.05 
 
 		 242 aa  328  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  61.6 
 
 		 245 aa  325  6e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  62.25 
 
 		 244 aa  324  9e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  62 
 
 		 256 aa  322  5e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  62.25 
 
 		 245 aa  321  9.000000000000001e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  60.24 
 
 		 241 aa  317  9e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  59.84 
 
 		 255 aa  315  3e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  61.9 
 
 		 251 aa  315  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  60.73 
 
 		 265 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  59.2 
 
 		 259 aa  312  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  58.96 
 
 		 249 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  58.63 
 
 		 262 aa  310  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  57.77 
 
 		 270 aa  310  2e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  59.2 
 
 		 257 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  61.54 
 
 		 252 aa  309  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  59.44 
 
 		 244 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  58.63 
 
 		 242 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  58.63 
 
 		 249 aa  308  4e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  58.06 
 
 		 258 aa  308  5e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  57.37 
 
 		 247 aa  308  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  60.4 
 
 		 248 aa  308  8e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  58.17 
 
 		 247 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  59.04 
 
 		 246 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  59.27 
 
 		 254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  59.52 
 
 		 255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  58.02 
 
 		 259 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  59.11 
 
 		 253 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  59.51 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  59.51 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  58.23 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  58.4 
 
 		 244 aa  306  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  59.68 
 
 		 254 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  56.97 
 
 		 267 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  58.94 
 
 		 273 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 		 269 aa  305  6e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  56.85 
 
 		 263 aa  305  6e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  57.89 
 
 		 253 aa  305  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  60.08 
 
 		 244 aa  304  8.000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.83 
 
 		 252 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.27 
 
 		 254 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  58.7 
 
 		 253 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  59.27 
 
 		 254 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  59.27 
 
 		 254 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.83 
 
 		 252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  58.54 
 
 		 273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  57.83 
 
 		 245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  56.5 
 
 		 258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  58.23 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.83 
 
 		 252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.83 
 
 		 252 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.03 
 
 		 251 aa  302  4.0000000000000003e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  58.63 
 
 		 244 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  58.63 
 
 		 252 aa  302  4.0000000000000003e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  56.8 
 
 		 248 aa  302  4.0000000000000003e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 		 249 aa  301  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  56.63 
 
 		 252 aa  301  5.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  57.83 
 
 		 242 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  59.2 
 
 		 243 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.4 
 
 		 257 aa  301  6.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  56.05 
 
 		 263 aa  301  9e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  57.43 
 
 		 252 aa  300  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  57.43 
 
 		 252 aa  300  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.43 
 
 		 252 aa  300  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  57.2 
 
 		 249 aa  300  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  57.43 
 
 		 252 aa  300  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  58.23 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  57.43 
 
 		 252 aa  300  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  58.23 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  59.6 
 
 		 243 aa  300  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  58.3 
 
 		 246 aa  300  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  57.43 
 
 		 252 aa  300  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  58.7 
 
 		 241 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  56.63 
 
 		 261 aa  300  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  58.23 
 
 		 247 aa  300  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  55.24 
 
 		 262 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  56.5 
 
 		 258 aa  299  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  56.5 
 
 		 258 aa  299  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  59.04 
 
 		 244 aa  300  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  55.65 
 
 		 262 aa  299  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  55.24 
 
 		 262 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.83 
 
 		 251 aa  299  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  58.7 
 
 		 241 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  58.23 
 
 		 242 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  56.4 
 
 		 248 aa  300  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  56.18 
 
 		 249 aa  299  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  56.1 
 
 		 269 aa  299  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  58.23 
 
 		 266 aa  299  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  58.96 
 
 		 258 aa  299  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  57.03 
 
 		 246 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  57.03 
 
 		 247 aa  299  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  56.1 
 
 		 257 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  58.96 
 
 		 258 aa  299  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  58.8 
 
 		 242 aa  298  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2068  ABC transporter related  58.57 
 
 		 247 aa  298  4e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  57.43 
 
 		 256 aa  299  4e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>