More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36880 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 257 aa  520  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  84.36 
 
 		 251 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  83.54 
 
 		 258 aa  417  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  81.07 
 
 		 249 aa  408  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  78.93 
 
 		 259 aa  403  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  80.17 
 
 		 261 aa  402  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  78.54 
 
 		 264 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  76.26 
 
 		 257 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  80.17 
 
 		 247 aa  398  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  76.31 
 
 		 251 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  78.14 
 
 		 262 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  75.4 
 
 		 255 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  76.45 
 
 		 270 aa  390  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3286  ABC transporter related protein  75.19 
 
 		 280 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00174942  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  74.32 
 
 		 251 aa  385  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  74.79 
 
 		 254 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  77.27 
 
 		 248 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  74.79 
 
 		 254 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  74.79 
 
 		 242 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  76.86 
 
 		 256 aa  384  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  75.62 
 
 		 251 aa  380  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  76.45 
 
 		 247 aa  381  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  75.21 
 
 		 244 aa  381  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  73.36 
 
 		 256 aa  383  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  78.51 
 
 		 250 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15420  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  72.83 
 
 		 274 aa  378  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  73.97 
 
 		 251 aa  378  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  75.21 
 
 		 242 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  70.83 
 
 		 264 aa  375  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  72.73 
 
 		 252 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  74.79 
 
 		 264 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  72.31 
 
 		 242 aa  361  8e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  71.49 
 
 		 244 aa  355  5e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  69.83 
 
 		 244 aa  345  3e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  64.05 
 
 		 251 aa  329  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  67.9 
 
 		 252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  64.05 
 
 		 252 aa  325  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  63.22 
 
 		 242 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  63.64 
 
 		 242 aa  324  7e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  63.11 
 
 		 253 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  63.01 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  62.3 
 
 		 253 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  63.33 
 
 		 250 aa  319  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  62.96 
 
 		 259 aa  319  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  60.24 
 
 		 258 aa  319  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  63.27 
 
 		 248 aa  318  6e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  60.56 
 
 		 253 aa  317  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  62.24 
 
 		 263 aa  315  4e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  63.75 
 
 		 246 aa  315  5e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  63.9 
 
 		 244 aa  314  8e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  60.16 
 
 		 253 aa  314  9e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  62.14 
 
 		 254 aa  314  9e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  62.06 
 
 		 273 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.73 
 
 		 254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  61.57 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  60.71 
 
 		 258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.18 
 
 		 269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  59.14 
 
 		 255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  62.76 
 
 		 257 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  60.71 
 
 		 258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  60.16 
 
 		 249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  61.73 
 
 		 254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  60.23 
 
 		 268 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  61.73 
 
 		 254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  59.22 
 
 		 254 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  62.4 
 
 		 267 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  61.16 
 
 		 249 aa  312  3.9999999999999997e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  63.37 
 
 		 243 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  59.36 
 
 		 253 aa  311  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  61.57 
 
 		 253 aa  311  4.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  61.26 
 
 		 261 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  60.74 
 
 		 249 aa  311  4.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  62.76 
 
 		 257 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  60.63 
 
 		 257 aa  311  5.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.18 
 
 		 249 aa  310  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  63.68 
 
 		 246 aa  310  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  61 
 
 		 242 aa  310  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  59.36 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  61.26 
 
 		 273 aa  310  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  60.82 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  63.03 
 
 		 244 aa  310  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  59.5 
 
 		 260 aa  309  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  61.41 
 
 		 263 aa  310  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  61.32 
 
 		 247 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  60.08 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  60 
 
 		 260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  60.58 
 
 		 262 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  58.57 
 
 		 253 aa  308  4e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  62.34 
 
 		 256 aa  308  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  59.76 
 
 		 266 aa  308  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  60.17 
 
 		 262 aa  308  5e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  60.17 
 
 		 262 aa  308  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  59.22 
 
 		 269 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.17 
 
 		 252 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  61 
 
 		 242 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.5 
 
 		 251 aa  308  6.999999999999999e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  61.87 
 
 		 257 aa  308  6.999999999999999e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.17 
 
 		 252 aa  307  9e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  59.67 
 
 		 248 aa  307  9e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>