More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2805 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  100 
 
 
242 aa  498  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  93.8 
 
 
242 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  72.31 
 
 
243 aa  367  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  69.55 
 
 
243 aa  350  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0550  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  74.38 
 
 
243 aa  350  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0606  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  73.97 
 
 
243 aa  348  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0551  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  73.97 
 
 
243 aa  348  4e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0639  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  73.97 
 
 
243 aa  348  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533598  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0696  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.97 
 
 
284 aa  348  4e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0675  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.38 
 
 
242 aa  348  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0707  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.97 
 
 
298 aa  348  6e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0768  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.55 
 
 
243 aa  347  7e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4663  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.97 
 
 
242 aa  344  8e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.583474  hitchhiker  2.7569099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  69.29 
 
 
244 aa  343  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  68.72 
 
 
243 aa  343  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  67.9 
 
 
243 aa  340  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0552  ABC transporter related  73.14 
 
 
243 aa  339  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  65.7 
 
 
242 aa  338  2.9999999999999998e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  64.73 
 
 
266 aa  338  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0528  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  67.22 
 
 
258 aa  338  5e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191469  normal  0.015863 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  63.49 
 
 
262 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  63.49 
 
 
262 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  63.9 
 
 
262 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  64.32 
 
 
253 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.53 
 
 
251 aa  334  7e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  63.64 
 
 
259 aa  334  9e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  64.17 
 
 
242 aa  333  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  64.68 
 
 
256 aa  333  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  63.9 
 
 
253 aa  333  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  66.8 
 
 
244 aa  333  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  63.33 
 
 
242 aa  333  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.4 
 
 
269 aa  332  3e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  64.05 
 
 
246 aa  332  3e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  63.9 
 
 
253 aa  332  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  63.49 
 
 
252 aa  331  5e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  63.98 
 
 
263 aa  332  5e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  63.49 
 
 
253 aa  331  7.000000000000001e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  62.92 
 
 
250 aa  331  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.11 
 
 
251 aa  331  7.000000000000001e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  62.08 
 
 
258 aa  330  9e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  62.08 
 
 
258 aa  330  9e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  62.24 
 
 
253 aa  330  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  63.22 
 
 
248 aa  330  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  62.81 
 
 
244 aa  330  1e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.4 
 
 
249 aa  330  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  61.41 
 
 
251 aa  329  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  62.66 
 
 
263 aa  329  3e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  62.98 
 
 
258 aa  328  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.07 
 
 
252 aa  328  4e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  64.26 
 
 
268 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  61.98 
 
 
255 aa  328  5.0000000000000004e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  63.4 
 
 
257 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  63.83 
 
 
257 aa  328  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  62.92 
 
 
273 aa  328  6e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.07 
 
 
252 aa  327  7e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.07 
 
 
252 aa  327  7e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  62.66 
 
 
252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  62.66 
 
 
252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.66 
 
 
252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  62.66 
 
 
252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  62.55 
 
 
267 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  62.66 
 
 
252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1165  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  65.02 
 
 
242 aa  327  1.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.19439  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  61.67 
 
 
273 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  63.75 
 
 
249 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  64.17 
 
 
240 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  61.67 
 
 
242 aa  326  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  64.46 
 
 
248 aa  325  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  61.83 
 
 
258 aa  325  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  63.49 
 
 
244 aa  325  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  61.7 
 
 
269 aa  325  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  61 
 
 
254 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.24 
 
 
252 aa  325  6e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  62.81 
 
 
245 aa  324  7e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  61.41 
 
 
254 aa  324  7e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.64 
 
 
257 aa  324  7e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  61.83 
 
 
254 aa  323  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  64.58 
 
 
240 aa  323  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  62.24 
 
 
244 aa  323  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.58 
 
 
254 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  63.45 
 
 
259 aa  323  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.41 
 
 
254 aa  322  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  60.58 
 
 
254 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  63.33 
 
 
265 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  61.57 
 
 
249 aa  323  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  64.02 
 
 
249 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  60.58 
 
 
254 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  62.4 
 
 
245 aa  322  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  60.33 
 
 
260 aa  322  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  66.12 
 
 
257 aa  322  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  61.98 
 
 
267 aa  322  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  61.16 
 
 
249 aa  322  4e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  62.34 
 
 
247 aa  322  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  63.22 
 
 
257 aa  322  5e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  63.22 
 
 
251 aa  322  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  64.1 
 
 
246 aa  320  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1702  ABC transporter related  62.39 
 
 
253 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.478201 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  61.16 
 
 
249 aa  320  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  60.33 
 
 
266 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  62.5 
 
 
246 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>