More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4528 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008243  Meso_4528  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  508  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  57.02 
 
 		 244 aa  304  9.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  55.28 
 
 		 245 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  57.55 
 
 		 249 aa  299  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.5 
 
 		 255 aa  291  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  56.9 
 
 		 247 aa  289  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  57.32 
 
 		 249 aa  288  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  56.49 
 
 		 249 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  56.9 
 
 		 249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  55.83 
 
 		 254 aa  284  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  56.43 
 
 		 254 aa  284  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  53.75 
 
 		 247 aa  278  5e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0894  ABC transporter related  56.25 
 
 		 242 aa  278  7e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213179  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  53.53 
 
 		 246 aa  275  4e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  51.25 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9237  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.44 
 
 		 242 aa  272  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185509  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  51.04 
 
 		 246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  52.92 
 
 		 248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  51.87 
 
 		 246 aa  270  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  50.41 
 
 		 246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  52.23 
 
 		 261 aa  268  5.9999999999999995e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3478  ABC transporter related  52.89 
 
 		 242 aa  268  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_003296  RS05401  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  54.69 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  52.5 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  50.63 
 
 		 242 aa  265  5e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  51.67 
 
 		 244 aa  264  8.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  49.37 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 242 aa  262  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.67 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  51.46 
 
 		 244 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  48.54 
 
 		 242 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  50.82 
 
 		 265 aa  260  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  51.44 
 
 		 245 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  51.46 
 
 		 249 aa  259  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  51.23 
 
 		 260 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  50 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  51.23 
 
 		 266 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  50.21 
 
 		 242 aa  256  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  50.62 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  51.46 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  50.42 
 
 		 243 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  48.33 
 
 		 243 aa  256  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  50.62 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  50.42 
 
 		 243 aa  256  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4091  ABC transporter related  51.05 
 
 		 247 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.231596 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0917  ABC transporter related  52.52 
 
 		 240 aa  256  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.834023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  50.21 
 
 		 255 aa  255  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  49.18 
 
 		 244 aa  255  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  49.17 
 
 		 251 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  50.44 
 
 		 244 aa  255  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  50.83 
 
 		 243 aa  255  6e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  48.97 
 
 		 253 aa  254  7e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  50.44 
 
 		 244 aa  254  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0719  ABC transporter related  51.03 
 
 		 244 aa  254  8e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.649778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3991  ABC transporter related  50.21 
 
 		 261 aa  254  9e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5607  ABC transporter related  51.03 
 
 		 244 aa  254  9e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2258  ABC transporter related  49.79 
 
 		 286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.633697 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  49.38 
 
 		 247 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  47.93 
 
 		 244 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  48.97 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  48.54 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3583  ABC transporter related  50.21 
 
 		 241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161673  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  50 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  47.08 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.38 
 
 		 284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  50.21 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  48.54 
 
 		 253 aa  252  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  49.37 
 
 		 253 aa  252  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  48.15 
 
 		 243 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  50.4 
 
 		 251 aa  252  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  49.56 
 
 		 244 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  49.79 
 
 		 253 aa  253  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  48.35 
 
 		 246 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  48.77 
 
 		 251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6371  ABC transporter related  53.47 
 
 		 256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  48.75 
 
 		 247 aa  251  5.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 		 257 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  49.58 
 
 		 259 aa  251  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  49.37 
 
 		 253 aa  251  6e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.97 
 
 		 253 aa  251  8.000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.33 
 
 		 260 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1563  ABC transporter related  50.21 
 
 		 242 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0142744  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  48.33 
 
 		 260 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  47.92 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  47.92 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  49.79 
 
 		 257 aa  250  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  48.76 
 
 		 246 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  47.76 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  47.93 
 
 		 246 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  49.79 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4373  ABC transporter related  50.82 
 
 		 264 aa  250  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  48.33 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  47.11 
 
 		 244 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  47.74 
 
 		 243 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  45.87 
 
 		 242 aa  250  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0446  putative polar amino acid transport system ATP-binding protein  50.41 
 
 		 244 aa  250  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641631  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>