More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2913 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 245 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  76.03 
 
 		 244 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6371  ABC transporter related  77.87 
 
 		 256 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05401  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  74.18 
 
 		 244 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  68.05 
 
 		 249 aa  358  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  68.6 
 
 		 254 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  68.05 
 
 		 254 aa  354  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  68.05 
 
 		 249 aa  353  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  67.63 
 
 		 249 aa  352  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  68.88 
 
 		 255 aa  351  5.9999999999999994e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  66.39 
 
 		 247 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  66.8 
 
 		 249 aa  345  5e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9237  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  63.64 
 
 		 242 aa  332  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185509  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  61.09 
 
 		 242 aa  322  3e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  61.09 
 
 		 242 aa  322  5e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0894  ABC transporter related  62.66 
 
 		 242 aa  319  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213179  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  59.92 
 
 		 242 aa  318  3.9999999999999996e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  60.25 
 
 		 242 aa  318  5e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  60.49 
 
 		 243 aa  318  6e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  60.91 
 
 		 243 aa  318  7e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  59.41 
 
 		 242 aa  317  9e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  59.92 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  61.51 
 
 		 249 aa  315  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  60.42 
 
 		 247 aa  315  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  59.58 
 
 		 246 aa  315  5e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  60.42 
 
 		 246 aa  311  4.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  60.42 
 
 		 259 aa  311  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  58.85 
 
 		 243 aa  308  4e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  59.5 
 
 		 242 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  58.09 
 
 		 244 aa  308  6.999999999999999e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  60.91 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  58.26 
 
 		 242 aa  305  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  61.32 
 
 		 266 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4441  ABC transporter related  61.32 
 
 		 255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103673 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  59.02 
 
 		 244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  61.57 
 
 		 258 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  61.57 
 
 		 258 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  59.17 
 
 		 246 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  56.38 
 
 		 252 aa  301  4.0000000000000003e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  59.17 
 
 		 246 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  56.85 
 
 		 246 aa  301  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0679  ABC transporter related  60.74 
 
 		 288 aa  301  6.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  59 
 
 		 241 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  57.92 
 
 		 250 aa  301  8.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0460  ABC transporter related  59.84 
 
 		 244 aa  300  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  59.67 
 
 		 257 aa  300  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4528  ABC transporter related  55.28 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4174  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.43 
 
 		 244 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481199  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.09 
 
 		 257 aa  300  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  57.92 
 
 		 255 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  60.42 
 
 		 252 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 240 aa  299  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0306  ABC glutamate/aspartate transporter, inner membrane subunit GltL  58.68 
 
 		 272 aa  299  3e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0591  ABC transporter related  58.78 
 
 		 245 aa  299  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0612  ABC transporter related  58.78 
 
 		 245 aa  299  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1367  ABC transporter related  59.18 
 
 		 245 aa  298  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.769758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  58.68 
 
 		 247 aa  298  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  60.17 
 
 		 255 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  57.92 
 
 		 246 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0402  ABC transporter-related protein  59.43 
 
 		 244 aa  298  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  57.02 
 
 		 243 aa  298  7e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4373  ABC transporter related  59.26 
 
 		 264 aa  298  7e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  59.92 
 
 		 240 aa  297  8e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2258  ABC transporter related  60.33 
 
 		 286 aa  297  8e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.633697 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0337  ABC transporter related  58.26 
 
 		 272 aa  298  8e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  59.26 
 
 		 253 aa  297  9e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4538  ABC transporter-like  59.35 
 
 		 244 aa  297  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247485  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  56.2 
 
 		 253 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  57.79 
 
 		 262 aa  297  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  55.79 
 
 		 259 aa  296  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  58.68 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4021  ABC transporter-related protein  58.61 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248641 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1806  ABC transporter related  59.75 
 
 		 248 aa  296  2e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3583  ABC transporter related  58.58 
 
 		 241 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161673  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  57.56 
 
 		 273 aa  296  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  57.32 
 
 		 253 aa  295  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  57.32 
 
 		 253 aa  295  5e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  57.79 
 
 		 259 aa  295  5e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5607  ABC transporter related  60.25 
 
 		 244 aa  295  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2685  ABC transporter-related protein  58.2 
 
 		 244 aa  295  7e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.480561 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  57.2 
 
 		 261 aa  294  7e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  59 
 
 		 241 aa  294  8e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  58.51 
 
 		 244 aa  294  8e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  57.79 
 
 		 248 aa  294  9e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  59 
 
 		 241 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  52.89 
 
 		 246 aa  294  1e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  56.9 
 
 		 253 aa  293  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  59 
 
 		 241 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4070  ABC transporter-related protein  56.73 
 
 		 245 aa  293  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  56.85 
 
 		 265 aa  293  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0719  ABC transporter related  59.84 
 
 		 244 aa  294  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.649778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  56.2 
 
 		 249 aa  293  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  59.67 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  56.67 
 
 		 253 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  57.51 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  56.79 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  58.26 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  57.32 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.74 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  56.61 
 
 		 249 aa  293  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>