More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1806 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1806  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  494  1e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0123  ABC transporter related protein  64.37 
 
 		 265 aa  318  3.9999999999999996e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1690  ABC transporter related  69.62 
 
 		 243 aa  318  3.9999999999999996e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.653327 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  57.63 
 
 		 242 aa  299  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  59.75 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  56.78 
 
 		 242 aa  296  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  55.19 
 
 		 242 aa  290  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  54.73 
 
 		 244 aa  289  4e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  56.85 
 
 		 243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  55.79 
 
 		 245 aa  285  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  58.55 
 
 		 242 aa  285  4e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  55.23 
 
 		 246 aa  285  5e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  58.47 
 
 		 246 aa  284  8e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  55.97 
 
 		 249 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  55.33 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  56.38 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  56.1 
 
 		 256 aa  282  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  58.16 
 
 		 252 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  54.96 
 
 		 255 aa  281  7.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  56.25 
 
 		 250 aa  280  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000378719  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  53.25 
 
 		 251 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  54.66 
 
 		 257 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  54.66 
 
 		 257 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  58.97 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  54.66 
 
 		 252 aa  279  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  55.6 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  57.08 
 
 		 246 aa  279  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  57.69 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.2 
 
 		 269 aa  279  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  57.08 
 
 		 246 aa  279  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  53.31 
 
 		 245 aa  278  4e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  56.49 
 
 		 240 aa  279  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  51.82 
 
 		 247 aa  278  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  54.81 
 
 		 246 aa  278  7e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  55.79 
 
 		 256 aa  278  7e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  56.84 
 
 		 242 aa  278  7e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  54.39 
 
 		 265 aa  278  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  53.09 
 
 		 269 aa  278  8e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  54.69 
 
 		 248 aa  278  8e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  55.88 
 
 		 240 aa  277  9e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  53.94 
 
 		 266 aa  277  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  54.03 
 
 		 263 aa  277  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.2 
 
 		 249 aa  276  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 252 aa  276  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  57.56 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  54.2 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  53.59 
 
 		 243 aa  276  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  52.87 
 
 		 249 aa  275  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  53.56 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  55 
 
 		 249 aa  275  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  55.37 
 
 		 262 aa  276  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  52.05 
 
 		 249 aa  275  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  52.67 
 
 		 246 aa  276  3e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  55 
 
 		 242 aa  276  3e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  55.83 
 
 		 255 aa  275  4e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  54.27 
 
 		 259 aa  275  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3584  ABC transporter related  54.47 
 
 		 255 aa  275  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal  0.0302261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  54.69 
 
 		 246 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  55.65 
 
 		 244 aa  275  5e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1658  ABC transporter related  55.1 
 
 		 254 aa  275  5e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  51.87 
 
 		 242 aa  275  6e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  56.25 
 
 		 246 aa  275  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  55.6 
 
 		 253 aa  274  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  54.47 
 
 		 253 aa  273  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.41 
 
 		 273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  56.07 
 
 		 250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  54.17 
 
 		 247 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.61 
 
 		 251 aa  273  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  56.67 
 
 		 245 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  56.54 
 
 		 248 aa  273  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  54.94 
 
 		 268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  57.45 
 
 		 246 aa  274  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  52.26 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  57.87 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  53.97 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  53.04 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  55.1 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  52.46 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  54.96 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  53.5 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  56.72 
 
 		 269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  54.96 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  52.26 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  53.97 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  54.96 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.36 
 
 		 251 aa  272  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  53.59 
 
 		 259 aa  272  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  53.53 
 
 		 254 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  54.1 
 
 		 258 aa  272  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  52.67 
 
 		 247 aa  272  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  55.51 
 
 		 244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.08 
 
 		 251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.11 
 
 		 254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  56.33 
 
 		 259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  52.67 
 
 		 254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  54.51 
 
 		 251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  54.17 
 
 		 244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  56.05 
 
 		 266 aa  271  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  54.29 
 
 		 246 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  55.79 
 
 		 273 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>