More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1658 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1658  ABC transporter related  100 
 
 
254 aa  523  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1365  ABC transporter-related protein  65.7 
 
 
251 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.886307  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0029  ABC transporter related  64.61 
 
 
250 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957294  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1436  hypothetical protein  64.23 
 
 
247 aa  334  7e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  56.91 
 
 
255 aa  293  2e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0184  ATPase  57.85 
 
 
255 aa  285  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1569  ABC transporter related  57.44 
 
 
261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  56.38 
 
 
250 aa  280  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000378719  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3901  ABC transporter related  53.63 
 
 
255 aa  275  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.292154  normal  0.145575 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1806  ABC transporter related  55.1 
 
 
248 aa  275  5e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.5 
 
 
244 aa  274  9e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2546  ABC transporter related  57.02 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587605  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.88 
 
 
240 aa  271  8.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  53.5 
 
 
245 aa  270  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  51.88 
 
 
240 aa  270  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.14 
 
 
240 aa  268  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  53.39 
 
 
242 aa  268  5.9999999999999995e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  54.81 
 
 
242 aa  267  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  53.56 
 
 
240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0123  ABC transporter related protein  53.31 
 
 
265 aa  265  7e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  54.81 
 
 
242 aa  264  8e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  52.72 
 
 
240 aa  264  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  52.48 
 
 
242 aa  263  2e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  52.72 
 
 
363 aa  263  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  52.3 
 
 
241 aa  262  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  52.3 
 
 
241 aa  262  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  53.14 
 
 
256 aa  262  4e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  53.5 
 
 
246 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  52.92 
 
 
250 aa  261  6.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  53.91 
 
 
244 aa  261  6.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.67 
 
 
244 aa  260  1e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  51.88 
 
 
241 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 
240 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 
240 aa  260  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 
240 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 
240 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  49.59 
 
 
242 aa  259  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  53.97 
 
 
242 aa  259  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  52.3 
 
 
363 aa  259  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  52.3 
 
 
241 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.63 
 
 
240 aa  259  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  50.63 
 
 
242 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  50.63 
 
 
242 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  53.19 
 
 
240 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 
244 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1690  ABC transporter related  53.14 
 
 
243 aa  259  4e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.653327 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 
240 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 
240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0807  ABC transporter related  53.47 
 
 
257 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 
244 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  52.7 
 
 
252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  51.95 
 
 
262 aa  258  6e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  50.42 
 
 
247 aa  258  6e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  51.05 
 
 
240 aa  258  8e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  52 
 
 
265 aa  257  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 
244 aa  257  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  53.97 
 
 
249 aa  257  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  51.42 
 
 
245 aa  257  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  51.46 
 
 
241 aa  257  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  50.63 
 
 
240 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 
240 aa  257  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  49.79 
 
 
241 aa  257  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  50.42 
 
 
244 aa  257  1e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  53.78 
 
 
249 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  49.79 
 
 
241 aa  257  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  52.94 
 
 
286 aa  257  1e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  52.72 
 
 
247 aa  257  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1760  ABC transporter related  52.26 
 
 
252 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 
241 aa  256  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 
244 aa  256  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  52.3 
 
 
255 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  50.21 
 
 
240 aa  256  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  50.21 
 
 
244 aa  256  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  54.39 
 
 
240 aa  257  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 
244 aa  256  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  52.3 
 
 
253 aa  256  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 
244 aa  256  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 
240 aa  256  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 
244 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  48.95 
 
 
240 aa  255  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  51.05 
 
 
246 aa  255  5e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  49.37 
 
 
241 aa  255  5e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 
243 aa  255  5e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.56 
 
 
240 aa  255  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  50.83 
 
 
244 aa  255  6e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  50.2 
 
 
273 aa  255  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  50.21 
 
 
360 aa  254  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  53.56 
 
 
242 aa  254  7e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.85 
 
 
251 aa  254  8e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  50.6 
 
 
268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.2 
 
 
268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  51.46 
 
 
244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  50 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  49.59 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  50.6 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  50.62 
 
 
244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 
244 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 
244 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  50.6 
 
 
260 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>