More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0431 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  100 
 
 		 286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  66.53 
 
 		 256 aa  325  4.0000000000000003e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2303  ABC transporter related protein  60.33 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  58.85 
 
 		 246 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  58.85 
 
 		 246 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  58.44 
 
 		 246 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.68 
 
 		 240 aa  289  4e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  61.48 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.26 
 
 		 244 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.96 
 
 		 244 aa  285  7e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  58.02 
 
 		 257 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  57.14 
 
 		 247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 		 244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 		 244 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  57.96 
 
 		 249 aa  281  9e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 		 244 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  60.66 
 
 		 250 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  59.17 
 
 		 257 aa  280  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.2 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  61.37 
 
 		 267 aa  279  3e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 244 aa  280  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 244 aa  279  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 		 244 aa  279  4e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  56.3 
 
 		 246 aa  279  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  55.79 
 
 		 241 aa  278  9e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  55.56 
 
 		 242 aa  278  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.68 
 
 		 244 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  55.56 
 
 		 242 aa  278  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  55.79 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0750  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.46 
 
 		 248 aa  278  1e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  57.02 
 
 		 240 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.09 
 
 		 244 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.02 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  58.02 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  57.68 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.09 
 
 		 244 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  55.95 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  55.79 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  56.2 
 
 		 249 aa  276  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.9 
 
 		 273 aa  275  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  56.49 
 
 		 242 aa  275  7e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  54.55 
 
 		 241 aa  275  7e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  53.94 
 
 		 249 aa  275  8e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  53.11 
 
 		 363 aa  275  9e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  55.6 
 
 		 246 aa  275  9e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  57.85 
 
 		 245 aa  274  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  56.61 
 
 		 241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  56.61 
 
 		 241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  52.4 
 
 		 256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  53.94 
 
 		 363 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  53.94 
 
 		 363 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  56.75 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1533  ABC transporter related  57.14 
 
 		 246 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534266  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  54.1 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  55.79 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.38 
 
 		 258 aa  273  3e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  53.31 
 
 		 242 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  56.61 
 
 		 241 aa  273  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  55.74 
 
 		 252 aa  272  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  57.61 
 
 		 247 aa  272  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  56 
 
 		 261 aa  271  6e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  54.13 
 
 		 247 aa  271  7e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  56.5 
 
 		 246 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  56.3 
 
 		 242 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  54.9 
 
 		 255 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  52.7 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  55.88 
 
 		 240 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  57.61 
 
 		 245 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  55.06 
 
 		 260 aa  271  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  56.2 
 
 		 241 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0085  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.88 
 
 		 254 aa  271  1e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000203236  normal  0.523772 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  54.96 
 
 		 249 aa  271  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  54.36 
 
 		 360 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.14 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  55.79 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.96 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  57.02 
 
 		 245 aa  270  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  55.37 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  54.96 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  54.96 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  54.96 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1059  hypothetical protein  55.14 
 
 		 245 aa  270  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  53.97 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  54.96 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  54.32 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  53.91 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  55.69 
 
 		 246 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.76 
 
 		 284 aa  269  4e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.69 
 
 		 244 aa  269  4e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  54.77 
 
 		 247 aa  269  4e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  54.32 
 
 		 243 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.55 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.55 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  53.31 
 
 		 253 aa  268  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1234  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.55 
 
 		 240 aa  269  5e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  56.02 
 
 		 244 aa  269  5e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  52.8 
 
 		 255 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>