More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1234 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1234  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  100 
 
 
240 aa  487  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  60.25 
 
 
249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  60.83 
 
 
240 aa  301  4.0000000000000003e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.83 
 
 
244 aa  301  5.000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  61.25 
 
 
242 aa  301  8.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  61.25 
 
 
242 aa  301  8.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 
240 aa  299  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  59.17 
 
 
242 aa  298  6e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  60.83 
 
 
240 aa  296  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  61.67 
 
 
244 aa  296  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  61.25 
 
 
240 aa  295  6e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  57.92 
 
 
244 aa  294  1e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  57.92 
 
 
243 aa  292  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  59 
 
 
247 aa  291  6e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  59 
 
 
247 aa  291  6e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 
240 aa  291  8e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  57.5 
 
 
252 aa  290  9e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  59 
 
 
249 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  58.33 
 
 
240 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  58.75 
 
 
244 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  57.08 
 
 
240 aa  289  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  57.32 
 
 
244 aa  289  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  59.58 
 
 
239 aa  288  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  57.92 
 
 
242 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.92 
 
 
244 aa  287  8e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59 
 
 
246 aa  287  9e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  57.5 
 
 
240 aa  287  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  56.25 
 
 
252 aa  286  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  59.17 
 
 
242 aa  286  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  58.09 
 
 
243 aa  286  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  57.5 
 
 
242 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.92 
 
 
240 aa  285  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  59.58 
 
 
240 aa  285  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  57.92 
 
 
241 aa  285  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  56.9 
 
 
249 aa  285  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  57.92 
 
 
243 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  56.67 
 
 
252 aa  284  1.0000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  57.5 
 
 
242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  57.5 
 
 
241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  56.43 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  57.26 
 
 
243 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  56.25 
 
 
240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  58.75 
 
 
241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  56.25 
 
 
248 aa  281  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  57.5 
 
 
240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  57.5 
 
 
243 aa  281  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  58.33 
 
 
241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  56.25 
 
 
246 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  56 
 
 
260 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  55.42 
 
 
244 aa  281  7.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  56.67 
 
 
240 aa  281  7.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  57.5 
 
 
241 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  57.5 
 
 
241 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 
241 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  56.25 
 
 
246 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  57.92 
 
 
241 aa  281  9e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  57.92 
 
 
241 aa  281  9e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  58.58 
 
 
246 aa  280  1e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  57.5 
 
 
242 aa  280  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  56.67 
 
 
244 aa  280  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  56.67 
 
 
241 aa  280  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  57.08 
 
 
247 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  58.51 
 
 
241 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  55.83 
 
 
254 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  55.83 
 
 
242 aa  280  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  57.08 
 
 
243 aa  280  2e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  57.92 
 
 
241 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 
251 aa  279  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  55.83 
 
 
254 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  55.83 
 
 
244 aa  280  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  57.08 
 
 
241 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  55.83 
 
 
242 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 
270 aa  279  3e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  55 
 
 
252 aa  279  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  55 
 
 
246 aa  279  3e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.55 
 
 
273 aa  278  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
240 aa  278  5e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  56.79 
 
 
243 aa  278  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  55.83 
 
 
255 aa  278  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  55.42 
 
 
251 aa  278  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  55.6 
 
 
260 aa  278  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 
240 aa  278  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 
240 aa  278  6e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  60 
 
 
248 aa  278  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  55.83 
 
 
243 aa  278  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  57.74 
 
 
257 aa  278  7e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  57.08 
 
 
244 aa  278  8e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  55.2 
 
 
250 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.85 
 
 
244 aa  278  8e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  54.4 
 
 
273 aa  277  9e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 
240 aa  277  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  53.97 
 
 
247 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  54.17 
 
 
242 aa  277  1e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  56.25 
 
 
240 aa  277  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 
240 aa  277  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  54.8 
 
 
250 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  54.8 
 
 
254 aa  276  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 
240 aa  276  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  57.08 
 
 
240 aa  276  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 
240 aa  276  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>