More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4318 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  100 
 
 		 263 aa  535  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  78.49 
 
 		 267 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  72.8 
 
 		 273 aa  384  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  71.31 
 
 		 254 aa  371  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  69.2 
 
 		 254 aa  359  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  68.75 
 
 		 260 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  66.92 
 
 		 260 aa  353  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  68.98 
 
 		 264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  66.93 
 
 		 254 aa  351  5e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  68.27 
 
 		 258 aa  350  8.999999999999999e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  66.8 
 
 		 250 aa  348  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  65.2 
 
 		 256 aa  348  5e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  66.4 
 
 		 250 aa  348  6e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  65.62 
 
 		 259 aa  345  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  66.14 
 
 		 254 aa  339  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  66.4 
 
 		 252 aa  338  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  66 
 
 		 255 aa  338  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  64.59 
 
 		 259 aa  338  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  65.6 
 
 		 267 aa  338  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  61.69 
 
 		 268 aa  338  5.9999999999999996e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  65.89 
 
 		 276 aa  337  9.999999999999999e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  63.35 
 
 		 256 aa  335  3.9999999999999995e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  64.4 
 
 		 261 aa  334  7e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  62.25 
 
 		 256 aa  332  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  63.45 
 
 		 254 aa  330  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.34 
 
 		 254 aa  328  7e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  59.85 
 
 		 274 aa  325  3e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  62.7 
 
 		 595 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.48 
 
 		 592 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  62.02 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  61.6 
 
 		 263 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  64.08 
 
 		 253 aa  322  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  61.2 
 
 		 254 aa  322  5e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  60.16 
 
 		 263 aa  321  8e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  60.8 
 
 		 254 aa  319  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  63.6 
 
 		 262 aa  318  7.999999999999999e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.7 
 
 		 260 aa  317  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  61.07 
 
 		 262 aa  315  4e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  60.89 
 
 		 254 aa  315  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  62.2 
 
 		 602 aa  314  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  61.07 
 
 		 264 aa  311  9e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  60.96 
 
 		 256 aa  311  9e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.84 
 
 		 594 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.48 
 
 		 261 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.84 
 
 		 594 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  60.66 
 
 		 261 aa  309  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  58.63 
 
 		 636 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  58.63 
 
 		 636 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  58.63 
 
 		 636 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  58.63 
 
 		 636 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.63 
 
 		 636 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  58.61 
 
 		 598 aa  308  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  58.63 
 
 		 636 aa  308  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  59.84 
 
 		 619 aa  308  8e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  56.49 
 
 		 274 aa  307  9e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  60.66 
 
 		 279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  58.23 
 
 		 636 aa  305  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  61.18 
 
 		 256 aa  305  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  56.32 
 
 		 274 aa  304  8.000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.42 
 
 		 268 aa  304  9.000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.83 
 
 		 597 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.83 
 
 		 595 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  58.61 
 
 		 257 aa  301  8.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4597  putative ATP-binding component of ABC transporter  60.78 
 
 		 265 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.838363  normal  0.0919141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  55.3 
 
 		 275 aa  298  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  57.43 
 
 		 597 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.43 
 
 		 597 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  56.4 
 
 		 263 aa  296  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  59.18 
 
 		 272 aa  296  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02260  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.04 
 
 		 299 aa  295  5e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.903253  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  56 
 
 		 272 aa  295  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  56.68 
 
 		 255 aa  295  5e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  57.37 
 
 		 267 aa  293  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  61.38 
 
 		 256 aa  292  4e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  60.48 
 
 		 246 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  56 
 
 		 239 aa  290  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1137  ABC transporter related  58.54 
 
 		 254 aa  289  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  57.2 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  56.8 
 
 		 240 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  56.4 
 
 		 240 aa  288  6e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  55.2 
 
 		 252 aa  288  7e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  58.8 
 
 		 244 aa  288  8e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.4 
 
 		 250 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  55.43 
 
 		 256 aa  287  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  61.13 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  56.4 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.56 
 
 		 581 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4597  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP- binding protein  53.23 
 
 		 271 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  56 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.76 
 
 		 273 aa  285  5.999999999999999e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5964  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.73 
 
 		 263 aa  284  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6799  ABC transporter related  55.98 
 
 		 265 aa  284  9e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.557054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  54.76 
 
 		 288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4287  ABC transporter related  55.98 
 
 		 265 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  51.91 
 
 		 289 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.73 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  51.91 
 
 		 289 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  57.09 
 
 		 249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  59.02 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2355  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  61.45 
 
 		 242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>