More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5964 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_5964  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 
263 aa  540  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6448  ABC transporter related  79.77 
 
 
263 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0465386 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4634  ABC transporter related  78.63 
 
 
263 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  58.98 
 
 
289 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  58.98 
 
 
288 aa  305  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  58.98 
 
 
289 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0719  ABC transporter related  55.6 
 
 
256 aa  294  9e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  55.73 
 
 
263 aa  284  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  53.6 
 
 
263 aa  278  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1298  ABC transporter component  54.69 
 
 
263 aa  276  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.943578  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  54.47 
 
 
273 aa  275  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  55.78 
 
 
254 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  55.29 
 
 
254 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  54.37 
 
 
259 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  55.16 
 
 
267 aa  271  9e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2653  polar amino acid ABC transporter ATPase  51.98 
 
 
267 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  54 
 
 
256 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  53.73 
 
 
244 aa  268  8e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.69 
 
 
268 aa  267  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  53.17 
 
 
259 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  54.18 
 
 
254 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  53.57 
 
 
255 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  52.38 
 
 
256 aa  266  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  58.16 
 
 
258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  53.6 
 
 
243 aa  266  4e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  53.54 
 
 
246 aa  265  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  54.03 
 
 
249 aa  265  7e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  52.57 
 
 
263 aa  264  8.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  53.6 
 
 
239 aa  264  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  52.94 
 
 
254 aa  263  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  53.33 
 
 
244 aa  263  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  51.76 
 
 
254 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  53.2 
 
 
243 aa  262  3e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0985  ABC transporter related protein  51.2 
 
 
259 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  52.17 
 
 
263 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  52.17 
 
 
263 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  53.11 
 
 
256 aa  261  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  53.63 
 
 
254 aa  261  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  55.25 
 
 
276 aa  261  6.999999999999999e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6087  ABC transporter related  50.38 
 
 
280 aa  261  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3275  ABC transporter related  50.8 
 
 
259 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  52.36 
 
 
262 aa  261  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0153  ABC transporter related  50.79 
 
 
262 aa  260  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  53.2 
 
 
240 aa  260  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  52.8 
 
 
240 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  53.17 
 
 
248 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  51.59 
 
 
256 aa  260  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  52.94 
 
 
268 aa  260  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  53.17 
 
 
247 aa  259  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  52.21 
 
 
261 aa  259  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3973  ABC transporter related  52.78 
 
 
282 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.95 
 
 
254 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2452  ABC transporter related  54.22 
 
 
259 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0182129  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1789  ABC transporter related  53.78 
 
 
263 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2317  ABC transporter related  54.22 
 
 
259 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.687012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  52.78 
 
 
260 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3107  ABC transporter related  53.52 
 
 
245 aa  258  6e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1325  polar amino acid ABC transporter ATPase  50.61 
 
 
265 aa  258  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0887  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.62 
 
 
255 aa  258  8e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  52.65 
 
 
250 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  53.17 
 
 
254 aa  256  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  52.4 
 
 
243 aa  256  2e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3869  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  53.41 
 
 
295 aa  256  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5734  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  53.82 
 
 
259 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.791565  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1959  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 
242 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131421  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  53.57 
 
 
260 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  51.81 
 
 
263 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  51.59 
 
 
256 aa  256  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 
240 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  51.84 
 
 
250 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 
240 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 
240 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1245  histidine transport ATP-binding protein  54.22 
 
 
255 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1773  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 
264 aa  256  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1087  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  54.22 
 
 
255 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251068  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 
240 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1092  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  54.22 
 
 
255 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195395  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  52.82 
 
 
244 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 
240 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0744  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.22 
 
 
255 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130821  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  53.2 
 
 
244 aa  255  4e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3015  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.22 
 
 
255 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0526452  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1582  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.22 
 
 
255 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0189341  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3633  ABC transporter related  55.56 
 
 
263 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1795  ABC transporter related  54.22 
 
 
259 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  53.75 
 
 
264 aa  255  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2407  ABC transporter related  54.22 
 
 
259 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0859619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0985  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.22 
 
 
255 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78834  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7509  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nopaline)  52.4 
 
 
258 aa  255  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  54.03 
 
 
244 aa  255  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  50.58 
 
 
262 aa  255  5e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  52.34 
 
 
251 aa  255  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3439  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 
242 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4282  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 
242 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4084  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 
242 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  53.39 
 
 
253 aa  254  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2862  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 
264 aa  254  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0589  arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.51 
 
 
264 aa  254  7e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2851  histidine transport ATP-binding protein  54.51 
 
 
264 aa  254  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1739  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 
264 aa  254  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>