More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4597 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4597  putative ATP-binding component of ABC transporter  100 
 
 		 265 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.838363  normal  0.0919141 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  64.37 
 
 		 258 aa  305  4.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  64.8 
 
 		 267 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  62.8 
 
 		 273 aa  299  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  60.78 
 
 		 263 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  62 
 
 		 250 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  62 
 
 		 254 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  60.8 
 
 		 250 aa  294  8e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  61.2 
 
 		 252 aa  290  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  61.04 
 
 		 254 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  59.22 
 
 		 260 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  60.8 
 
 		 260 aa  289  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  59.27 
 
 		 264 aa  288  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  56.03 
 
 		 263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  58.23 
 
 		 256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  58.63 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  57.2 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  55.47 
 
 		 256 aa  278  9e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  54 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  53.52 
 
 		 268 aa  273  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  53.67 
 
 		 259 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.42 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  57.61 
 
 		 254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  56.25 
 
 		 257 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  53.91 
 
 		 256 aa  268  8e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  58.13 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  57.2 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  54.4 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  58.09 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.16 
 
 		 257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  59.13 
 
 		 243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  55.77 
 
 		 257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  57.2 
 
 		 255 aa  265  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  54.55 
 
 		 263 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  59.92 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  56.35 
 
 		 244 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  54.4 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  58.2 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  53.12 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  53.97 
 
 		 243 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  54.98 
 
 		 243 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  57.72 
 
 		 243 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.92 
 
 		 276 aa  263  3e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2606  ABC transporter related  53.36 
 
 		 254 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.0103017 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.52 
 
 		 268 aa  262  4.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  52.92 
 
 		 248 aa  261  6.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  53.52 
 
 		 244 aa  261  8e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  59.75 
 
 		 253 aa  259  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.13 
 
 		 254 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  53.08 
 
 		 253 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  51.75 
 
 		 274 aa  259  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  53.17 
 
 		 260 aa  260  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  55.95 
 
 		 261 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  53.57 
 
 		 243 aa  259  2e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  53.6 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.79 
 
 		 273 aa  259  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  55.83 
 
 		 239 aa  259  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  55.38 
 
 		 243 aa  259  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  54.58 
 
 		 244 aa  259  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  54.8 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  53.15 
 
 		 245 aa  257  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  54.37 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  53.2 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  53.57 
 
 		 246 aa  257  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  52.38 
 
 		 243 aa  256  2e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  53.2 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  54 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  53.54 
 
 		 245 aa  256  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  52.76 
 
 		 270 aa  256  3e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2001  ABC transporter related  54.44 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.73 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  54.94 
 
 		 244 aa  256  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54.4 
 
 		 246 aa  255  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  52.24 
 
 		 242 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  54.37 
 
 		 243 aa  255  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  52.73 
 
 		 247 aa  255  5e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  53.6 
 
 		 257 aa  255  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  51.78 
 
 		 262 aa  255  6e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  52.61 
 
 		 254 aa  254  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  51.95 
 
 		 246 aa  254  9e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  53.17 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  51.59 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  53.15 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1849  ABC transporter related  49.8 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  54.22 
 
 		 279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0791  ABC transporter related protein  53.94 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142657  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  52.8 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  52.94 
 
 		 259 aa  253  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  54.15 
 
 		 245 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  51 
 
 		 240 aa  253  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  53.44 
 
 		 261 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  55 
 
 		 257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  50.8 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  53.54 
 
 		 247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  52.19 
 
 		 247 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.6 
 
 		 260 aa  251  6e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  51.17 
 
 		 246 aa  251  8.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  53.2 
 
 		 242 aa  251  8.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.6 
 
 		 269 aa  251  8.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  54.15 
 
 		 250 aa  251  9.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>