More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1066 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 262 aa  536  9.999999999999999e-153  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  74.32 
 
 		 276 aa  394  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  61.07 
 
 		 263 aa  315  4e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  62.26 
 
 		 262 aa  315  5e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  61.18 
 
 		 267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  59.61 
 
 		 254 aa  306  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  60.87 
 
 		 256 aa  301  6.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  60.24 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  60.39 
 
 		 263 aa  300  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  59.3 
 
 		 256 aa  300  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  58.08 
 
 		 264 aa  298  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  58.14 
 
 		 254 aa  296  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  59.61 
 
 		 259 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  56.32 
 
 		 273 aa  294  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.38 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  58.23 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  56.86 
 
 		 254 aa  291  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  57.43 
 
 		 255 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  58.17 
 
 		 259 aa  289  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  56.18 
 
 		 254 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  57.75 
 
 		 256 aa  288  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  58.2 
 
 		 254 aa  288  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  58.43 
 
 		 256 aa  288  6e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  58.89 
 
 		 268 aa  288  9e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  59.06 
 
 		 253 aa  287  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  59.04 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  55.73 
 
 		 263 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  56.92 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  57.75 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.52 
 
 		 254 aa  285  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  58.4 
 
 		 263 aa  284  8e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  54.41 
 
 		 264 aa  284  8e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  58.14 
 
 		 274 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  57.65 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  58.87 
 
 		 250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  56.85 
 
 		 252 aa  282  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  54.65 
 
 		 264 aa  281  6.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  58.47 
 
 		 250 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.92 
 
 		 592 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  57.25 
 
 		 260 aa  280  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  55.56 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  55.51 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.37 
 
 		 260 aa  279  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  56.37 
 
 		 247 aa  279  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  57.48 
 
 		 256 aa  279  4e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  56.37 
 
 		 270 aa  279  4e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  56.32 
 
 		 274 aa  278  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  56.52 
 
 		 243 aa  278  8e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  55.34 
 
 		 252 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  53.63 
 
 		 256 aa  276  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  54.94 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  54.55 
 
 		 253 aa  275  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  56.32 
 
 		 274 aa  275  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  56.69 
 
 		 253 aa  275  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  57.31 
 
 		 243 aa  275  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  53.99 
 
 		 257 aa  275  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  56.3 
 
 		 272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  55.04 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  55.29 
 
 		 260 aa  272  5.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  56.69 
 
 		 279 aa  271  7e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  54.55 
 
 		 278 aa  271  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  54.3 
 
 		 256 aa  271  9e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  55.02 
 
 		 246 aa  271  9e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1325  polar amino acid ABC transporter ATPase  55.2 
 
 		 265 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  53.73 
 
 		 268 aa  270  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  52.12 
 
 		 246 aa  271  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  54.55 
 
 		 251 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  54.51 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  55.34 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  56.52 
 
 		 598 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.38 
 
 		 595 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  55.82 
 
 		 248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  54.9 
 
 		 262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02260  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 299 aa  269  4e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.903253  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  55.51 
 
 		 275 aa  268  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0118  ABC transporter related  54.76 
 
 		 250 aa  268  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  52.96 
 
 		 242 aa  268  5e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5145  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.1 
 
 		 567 aa  268  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.900628 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  55.64 
 
 		 256 aa  268  8e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0985  ABC transporter related protein  50.58 
 
 		 259 aa  268  8e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  51.78 
 
 		 242 aa  268  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  54.9 
 
 		 262 aa  267  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3275  ABC transporter related  50.58 
 
 		 259 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1849  ABC transporter related  50.39 
 
 		 251 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  54.55 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4287  ABC transporter related  53.46 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  55.12 
 
 		 272 aa  267  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  52.33 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  51.78 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2653  polar amino acid ABC transporter ATPase  52.31 
 
 		 267 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  53.1 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.57 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  53.36 
 
 		 240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  54.94 
 
 		 243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4842  ABC transporter related  53.08 
 
 		 265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463147  normal  0.18459 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0599  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  54.72 
 
 		 567 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.106218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  54.69 
 
 		 246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  53.1 
 
 		 247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  53.46 
 
 		 261 aa  265  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>