More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1375 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  100 
 
 
263 aa  533  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  64.14 
 
 
256 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  61.35 
 
 
267 aa  322  5e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  60.16 
 
 
260 aa  321  7e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  60.16 
 
 
263 aa  321  8e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  60.96 
 
 
250 aa  318  5e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  60.96 
 
 
254 aa  318  7e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  60.96 
 
 
250 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  64.45 
 
 
263 aa  316  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  59.36 
 
 
260 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  59.6 
 
 
254 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  59.76 
 
 
254 aa  311  6.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  59.36 
 
 
252 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  57.77 
 
 
273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  60.16 
 
 
239 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  58.04 
 
 
262 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  57.66 
 
 
259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  61.75 
 
 
244 aa  305  3e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  57.94 
 
 
254 aa  306  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  61.35 
 
 
240 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  57.25 
 
 
258 aa  305  4.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  56.97 
 
 
267 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  57.14 
 
 
259 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.17 
 
 
254 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  59.36 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  56.8 
 
 
261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  57.6 
 
 
254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  55.38 
 
 
256 aa  302  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  56.57 
 
 
255 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  61.35 
 
 
240 aa  300  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0985  ABC transporter related protein  57.94 
 
 
259 aa  300  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  59.13 
 
 
244 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3275  ABC transporter related  57.54 
 
 
259 aa  299  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.16 
 
 
240 aa  299  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  59.76 
 
 
240 aa  298  7e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.1 
 
 
268 aa  298  8e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.16 
 
 
240 aa  297  9e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  56.57 
 
 
254 aa  297  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  56.75 
 
 
268 aa  297  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  58.96 
 
 
240 aa  296  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  57.43 
 
 
264 aa  296  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.2 
 
 
592 aa  295  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 
253 aa  296  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  60 
 
 
249 aa  296  3e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  58.17 
 
 
261 aa  296  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  55.24 
 
 
256 aa  296  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  56.05 
 
 
256 aa  295  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  59.51 
 
 
248 aa  295  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  59.36 
 
 
243 aa  295  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  60.48 
 
 
254 aa  295  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  55.78 
 
 
244 aa  295  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  57.77 
 
 
242 aa  294  8e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  57.77 
 
 
246 aa  293  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.36 
 
 
240 aa  294  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.36 
 
 
240 aa  293  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  59.36 
 
 
240 aa  294  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  59.36 
 
 
240 aa  294  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.36 
 
 
240 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.36 
 
 
240 aa  293  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  57.77 
 
 
245 aa  293  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  55.42 
 
 
254 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  59.36 
 
 
278 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.36 
 
 
240 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.92 
 
 
244 aa  293  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  58.1 
 
 
276 aa  293  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.37 
 
 
595 aa  292  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  57.77 
 
 
255 aa  292  4e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  60.32 
 
 
252 aa  292  4e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  60.96 
 
 
266 aa  292  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.51 
 
 
244 aa  292  5e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  59.11 
 
 
248 aa  291  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.51 
 
 
244 aa  291  7e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  59.36 
 
 
242 aa  291  8e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  56.35 
 
 
244 aa  291  8e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  58.17 
 
 
240 aa  291  8e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.57 
 
 
244 aa  291  8e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.51 
 
 
244 aa  291  8e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  59.11 
 
 
244 aa  291  9e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  59.36 
 
 
243 aa  291  9e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  58 
 
 
246 aa  290  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  57.71 
 
 
240 aa  290  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  56.57 
 
 
242 aa  290  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  56.75 
 
 
256 aa  290  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  57.77 
 
 
243 aa  290  1e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  57.14 
 
 
244 aa  290  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  58.96 
 
 
242 aa  290  1e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  59.2 
 
 
240 aa  290  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  57.37 
 
 
243 aa  290  1e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.51 
 
 
244 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.51 
 
 
244 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  57.2 
 
 
243 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  55.81 
 
 
252 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  60.16 
 
 
266 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  58.57 
 
 
240 aa  290  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  57.37 
 
 
243 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  56.97 
 
 
240 aa  290  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.11 
 
 
244 aa  289  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.11 
 
 
244 aa  289  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  57.77 
 
 
244 aa  289  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.11 
 
 
244 aa  289  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>