More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4548 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  100 
 
 
254 aa  518  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  72.29 
 
 
255 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  70.28 
 
 
267 aa  356  1.9999999999999998e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  67.74 
 
 
269 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2971  ABC transporter related  69.88 
 
 
254 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1012  ABC transporter-related protein  67.47 
 
 
264 aa  341  8e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0713  ABC transporter related  65.6 
 
 
260 aa  338  4e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0745  ABC transporter related  65.6 
 
 
260 aa  338  4e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  63.05 
 
 
255 aa  315  4e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0887  ABC transporter related  63.1 
 
 
253 aa  309  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000314613  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  57.09 
 
 
259 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  61.13 
 
 
263 aa  296  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  60.48 
 
 
263 aa  295  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  56.8 
 
 
256 aa  291  6e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  57.6 
 
 
260 aa  291  6e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  57.83 
 
 
240 aa  290  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  58.3 
 
 
250 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  58.3 
 
 
250 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  57.83 
 
 
256 aa  290  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  58.3 
 
 
254 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  55.87 
 
 
256 aa  288  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0210  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.04 
 
 
248 aa  287  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.770881  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0257  ATP-binding protein  59.04 
 
 
248 aa  287  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000197314 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  56.5 
 
 
259 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  55.82 
 
 
258 aa  286  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  58.4 
 
 
240 aa  286  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  58 
 
 
240 aa  286  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.87 
 
 
250 aa  285  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  56.5 
 
 
257 aa  285  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  58.7 
 
 
239 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  56.28 
 
 
260 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  57.09 
 
 
240 aa  285  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.47 
 
 
250 aa  284  9e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.47 
 
 
250 aa  284  9e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.47 
 
 
250 aa  284  9e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  58.47 
 
 
250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.09 
 
 
250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.47 
 
 
250 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  58.4 
 
 
254 aa  282  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  57.89 
 
 
251 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  56.91 
 
 
240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  58.06 
 
 
250 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  56.68 
 
 
240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  58.3 
 
 
244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.83 
 
 
252 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  55.87 
 
 
273 aa  280  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.43 
 
 
252 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.3 
 
 
250 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  55.28 
 
 
254 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.57 
 
 
247 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  56.28 
 
 
267 aa  280  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  55.42 
 
 
240 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.78 
 
 
247 aa  279  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.02 
 
 
240 aa  279  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.43 
 
 
252 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  55.42 
 
 
252 aa  279  3e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.43 
 
 
252 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.91 
 
 
250 aa  278  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.91 
 
 
250 aa  278  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.91 
 
 
250 aa  278  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  57.09 
 
 
242 aa  278  5e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  57.49 
 
 
240 aa  278  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  54.25 
 
 
264 aa  278  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  56.97 
 
 
246 aa  278  6e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  59.11 
 
 
241 aa  278  7e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  58.13 
 
 
249 aa  278  7e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0242  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.03 
 
 
249 aa  278  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762427  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  55.51 
 
 
260 aa  277  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  58.33 
 
 
243 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2606  ABC transporter related  56.1 
 
 
254 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.0103017 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.91 
 
 
250 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  57.03 
 
 
254 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  57.43 
 
 
240 aa  276  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 
240 aa  276  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  58.63 
 
 
240 aa  276  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  57.32 
 
 
243 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  55.82 
 
 
255 aa  276  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  56.91 
 
 
243 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 
240 aa  275  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.72 
 
 
240 aa  275  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  57.83 
 
 
240 aa  275  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  54.8 
 
 
242 aa  275  4e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  57.83 
 
 
254 aa  275  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  57.32 
 
 
243 aa  275  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 
240 aa  275  5e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 
240 aa  275  5e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 
240 aa  275  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 
240 aa  275  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.22 
 
 
240 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.22 
 
 
240 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 
240 aa  275  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  55.06 
 
 
242 aa  275  6e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.43 
 
 
244 aa  275  7e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3307  ABC transporter related  56.2 
 
 
256 aa  275  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  56.22 
 
 
240 aa  274  8e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  56.22 
 
 
240 aa  274  8e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.22 
 
 
240 aa  274  8e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  57.48 
 
 
244 aa  274  8e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.22 
 
 
250 aa  274  9e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.22 
 
 
240 aa  274  9e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>