More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2971 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2971  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  75.98 
 
 		 267 aa  395  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  71.54 
 
 		 255 aa  368  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1012  ABC transporter-related protein  72.11 
 
 		 264 aa  368  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0713  ABC transporter related  71.83 
 
 		 260 aa  363  2e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0745  ABC transporter related  71.83 
 
 		 260 aa  363  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  70.24 
 
 		 269 aa  359  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  69.88 
 
 		 254 aa  352  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  61.6 
 
 		 255 aa  307  9e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  58.17 
 
 		 267 aa  295  5e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  56.97 
 
 		 259 aa  294  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  57.48 
 
 		 254 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.6 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  55.73 
 
 		 260 aa  290  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  56.69 
 
 		 259 aa  289  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  57.6 
 
 		 241 aa  289  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  57.6 
 
 		 241 aa  289  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  58.82 
 
 		 263 aa  289  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  57.2 
 
 		 241 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  57.6 
 
 		 250 aa  288  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  57.2 
 
 		 241 aa  288  7e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  57.2 
 
 		 241 aa  288  8e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  57.2 
 
 		 241 aa  288  8e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  56.75 
 
 		 260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  57.2 
 
 		 250 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  55.38 
 
 		 256 aa  285  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  56.8 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  56.35 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  58.4 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  56.4 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  59.39 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  55.2 
 
 		 242 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 		 240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56 
 
 		 240 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 		 240 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56 
 
 		 240 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 		 240 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  56.8 
 
 		 240 aa  281  6.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 		 240 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  56.4 
 
 		 261 aa  281  7.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0210  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 		 248 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.770881  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0257  ATP-binding protein  56 
 
 		 248 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000197314 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  56 
 
 		 240 aa  281  8.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  56.8 
 
 		 240 aa  281  9e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  55.56 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  55.6 
 
 		 240 aa  279  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  57.6 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  57.03 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  56.75 
 
 		 241 aa  278  6e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  58.4 
 
 		 251 aa  278  8e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  56.92 
 
 		 263 aa  277  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  58.8 
 
 		 252 aa  276  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  55.6 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  56.8 
 
 		 273 aa  276  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  56.4 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  57.89 
 
 		 254 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0887  ABC transporter related  56.91 
 
 		 253 aa  275  6e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000314613  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  54.8 
 
 		 242 aa  275  7e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  58.27 
 
 		 244 aa  275  7e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  57.83 
 
 		 240 aa  274  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  54.8 
 
 		 252 aa  274  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  55.16 
 
 		 255 aa  274  9e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  56.13 
 
 		 246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  56 
 
 		 240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  56.28 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  55.91 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  54.8 
 
 		 242 aa  273  3e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  54.4 
 
 		 240 aa  273  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  55.51 
 
 		 255 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  56 
 
 		 242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  59.2 
 
 		 253 aa  271  5.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  54.4 
 
 		 240 aa  271  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  54.55 
 
 		 254 aa  271  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  54.58 
 
 		 258 aa  271  6e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  55.56 
 
 		 263 aa  271  6e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  54 
 
 		 241 aa  271  6e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  54.8 
 
 		 243 aa  271  7e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  56.13 
 
 		 243 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.2 
 
 		 252 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  58.8 
 
 		 251 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  54.4 
 
 		 240 aa  271  9e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  54.98 
 
 		 257 aa  270  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.2 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  54.94 
 
 		 289 aa  270  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.2 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  57.09 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.94 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  54.47 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  56 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.16 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  54.94 
 
 		 288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  55.64 
 
 		 249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  55.2 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  54.12 
 
 		 276 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  54 
 
 		 252 aa  269  4e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>