More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0887 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0887  ABC transporter related  100 
 
 		 253 aa  518  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000314613  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  63.1 
 
 		 254 aa  328  5.0000000000000004e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13310  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 		 255 aa  311  5.999999999999999e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  57.83 
 
 		 255 aa  309  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06900  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.75 
 
 		 257 aa  302  3.0000000000000004e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  0.262543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  58.3 
 
 		 255 aa  298  5e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  56.28 
 
 		 241 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  57.32 
 
 		 267 aa  295  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  55.42 
 
 		 256 aa  295  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  59.11 
 
 		 240 aa  295  5e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  56.28 
 
 		 241 aa  295  6e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  56.28 
 
 		 241 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  56.28 
 
 		 241 aa  294  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  57.89 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  57.32 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2971  ABC transporter related  56.91 
 
 		 254 aa  292  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  55.87 
 
 		 241 aa  292  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.87 
 
 		 241 aa  292  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  55.87 
 
 		 241 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  55.87 
 
 		 241 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  58.54 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  58.7 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0663  ABC transporter related  61.83 
 
 		 258 aa  289  3e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0260553  hitchhiker  0.00587802 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  55.28 
 
 		 254 aa  289  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  56.45 
 
 		 263 aa  288  6e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  58.3 
 
 		 243 aa  287  9e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  55.87 
 
 		 269 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  55.06 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  57.89 
 
 		 243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  57.49 
 
 		 242 aa  285  4e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  55.87 
 
 		 241 aa  285  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  57.89 
 
 		 243 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.68 
 
 		 244 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0713  ABC transporter related  54.25 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  56.45 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.18 
 
 		 250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.18 
 
 		 250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0745  ABC transporter related  54.25 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1012  ABC transporter-related protein  53.66 
 
 		 264 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.18 
 
 		 250 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.18 
 
 		 250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.18 
 
 		 250 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.18 
 
 		 250 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.78 
 
 		 250 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  56.68 
 
 		 240 aa  281  7.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.78 
 
 		 250 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.78 
 
 		 250 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  56.91 
 
 		 265 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  55.78 
 
 		 250 aa  281  9e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  53.01 
 
 		 259 aa  281  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  53.25 
 
 		 240 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  54.25 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.78 
 
 		 250 aa  280  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.78 
 
 		 250 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  52.23 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.87 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  55.06 
 
 		 273 aa  279  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  53.23 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.38 
 
 		 250 aa  279  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  53.85 
 
 		 241 aa  278  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  55.87 
 
 		 240 aa  279  4e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  54.84 
 
 		 263 aa  278  7e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.06 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.47 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  54.84 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  52.61 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  54.03 
 
 		 268 aa  277  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  54.66 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.25 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  55.47 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0210  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.62 
 
 		 248 aa  276  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.770881  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0257  ATP-binding protein  54.62 
 
 		 248 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000197314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  54.03 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.58 
 
 		 250 aa  275  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.82 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  55.24 
 
 		 243 aa  275  5e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.88 
 
 		 247 aa  275  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  54.03 
 
 		 260 aa  275  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  53.82 
 
 		 259 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  53.01 
 
 		 242 aa  275  7e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  53.85 
 
 		 248 aa  274  9e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  55.1 
 
 		 257 aa  274  9e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  53.04 
 
 		 265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  53.04 
 
 		 265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  51.61 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  53.82 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  53.44 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  54.84 
 
 		 246 aa  273  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  54.66 
 
 		 240 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  54.47 
 
 		 240 aa  272  3e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  52.63 
 
 		 264 aa  272  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  52.23 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  53.75 
 
 		 274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.44 
 
 		 244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  53.63 
 
 		 263 aa  272  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.66 
 
 		 247 aa  271  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  55.06 
 
 		 240 aa  271  6e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  53.23 
 
 		 254 aa  271  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  51.21 
 
 		 242 aa  271  7e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  51.42 
 
 		 360 aa  271  7e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>