More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2098 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 254 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  64.54 
 
 		 254 aa  348  7e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  69.42 
 
 		 267 aa  345  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  69.01 
 
 		 255 aa  345  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  64.14 
 
 		 254 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  63.45 
 
 		 261 aa  328  4e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  63.31 
 
 		 267 aa  328  7e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  66 
 
 		 258 aa  325  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  63.71 
 
 		 256 aa  323  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  65.04 
 
 		 264 aa  318  5e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  59.68 
 
 		 256 aa  318  6e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  62.35 
 
 		 273 aa  317  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  62.1 
 
 		 254 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  63.9 
 
 		 252 aa  315  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  63.07 
 
 		 250 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  60.89 
 
 		 263 aa  315  5e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  61.94 
 
 		 250 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  63.31 
 
 		 254 aa  312  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  61.13 
 
 		 256 aa  312  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  60.24 
 
 		 260 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.35 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  60.24 
 
 		 260 aa  308  5e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  61.45 
 
 		 264 aa  308  5.9999999999999995e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  61.69 
 
 		 254 aa  307  9e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  60.89 
 
 		 256 aa  305  4.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  59.44 
 
 		 259 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  60.71 
 
 		 262 aa  304  9.000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  59.84 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  61.6 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  60.89 
 
 		 263 aa  302  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  60.98 
 
 		 597 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  58.8 
 
 		 259 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.98 
 
 		 597 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.98 
 
 		 597 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.98 
 
 		 594 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.98 
 
 		 594 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  60.16 
 
 		 636 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  60.16 
 
 		 636 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  60.16 
 
 		 636 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  60.16 
 
 		 636 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  60.16 
 
 		 636 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  60.16 
 
 		 636 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.57 
 
 		 595 aa  295  7e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.89 
 
 		 260 aa  294  9e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  58.06 
 
 		 274 aa  294  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  55.42 
 
 		 263 aa  294  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  58.23 
 
 		 268 aa  293  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  58.47 
 
 		 263 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  58.57 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  61.38 
 
 		 278 aa  292  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  57.43 
 
 		 274 aa  292  4e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  59.76 
 
 		 636 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  60.73 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  58.47 
 
 		 272 aa  289  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  56.18 
 
 		 262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  55.06 
 
 		 242 aa  288  8e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  59.76 
 
 		 251 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  56.69 
 
 		 274 aa  287  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  60.16 
 
 		 619 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  56.1 
 
 		 598 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  55.78 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  61.13 
 
 		 253 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  58.06 
 
 		 254 aa  285  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.91 
 
 		 595 aa  284  9e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  58.54 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  58.13 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  56.5 
 
 		 257 aa  282  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  56.5 
 
 		 252 aa  283  3.0000000000000004e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  58.13 
 
 		 279 aa  281  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  57.49 
 
 		 241 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.89 
 
 		 268 aa  281  8.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  56.8 
 
 		 244 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  57.14 
 
 		 272 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.06 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  59.27 
 
 		 602 aa  279  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  54.25 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  58.26 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1137  ABC transporter related  57.6 
 
 		 254 aa  279  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.69 
 
 		 261 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.88 
 
 		 244 aa  279  4e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  57.32 
 
 		 248 aa  278  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  58.13 
 
 		 264 aa  279  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.69 
 
 		 592 aa  278  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  56.28 
 
 		 288 aa  278  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  57.32 
 
 		 240 aa  278  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  56.68 
 
 		 289 aa  278  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  55.16 
 
 		 246 aa  278  7e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.47 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.47 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  55.06 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  56.28 
 
 		 289 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.47 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  60 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.47 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  55.28 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.47 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  54.47 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  58.37 
 
 		 246 aa  276  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.47 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>