More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1531 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.66 
 
 
592 aa  734    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  73.2 
 
 
636 aa  825    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  73.2 
 
 
636 aa  825    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  87 
 
 
595 aa  977    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  73.82 
 
 
636 aa  826    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 
619 aa  1219    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  73.51 
 
 
636 aa  828    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.67 
 
 
595 aa  743    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.73 
 
 
581 aa  636    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  68.81 
 
 
602 aa  759    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  92.63 
 
 
597 aa  1062    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  91.28 
 
 
594 aa  1009    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  91.61 
 
 
594 aa  1011    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  92.63 
 
 
597 aa  1062    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  92.46 
 
 
597 aa  1061    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  73.2 
 
 
636 aa  825    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  68.1 
 
 
598 aa  738    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  73.2 
 
 
636 aa  825    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  73.35 
 
 
636 aa  824    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  71.31 
 
 
257 aa  359  6e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  69.5 
 
 
272 aa  350  6e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  66.28 
 
 
268 aa  348  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  67.05 
 
 
274 aa  347  5e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  68.53 
 
 
260 aa  343  4e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  65.9 
 
 
274 aa  342  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5145  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.18 
 
 
567 aa  340  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.900628 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.49 
 
 
261 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3710  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.32 
 
 
365 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  64.62 
 
 
261 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0599  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.36 
 
 
567 aa  336  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.106218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.47 
 
 
254 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  64.29 
 
 
274 aa  333  5e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1640  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.02 
 
 
559 aa  333  5e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.588143  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  66.54 
 
 
272 aa  333  6e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  66.4 
 
 
275 aa  332  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.22 
 
 
506 aa  330  5.0000000000000004e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3909  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.03 
 
 
352 aa  329  9e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02260  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  70.52 
 
 
299 aa  327  5e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.903253  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  65.46 
 
 
264 aa  325  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  68.27 
 
 
279 aa  326  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3313  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.77 
 
 
502 aa  320  5e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571004  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  64.4 
 
 
256 aa  317  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4453  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.75 
 
 
500 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177151  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  61.45 
 
 
253 aa  313  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3010  amino acid ABC transporter, permease protein  58.84 
 
 
324 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234602  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.53 
 
 
500 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal  0.451936 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  61.73 
 
 
254 aa  313  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2493  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.1 
 
 
321 aa  312  9e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.761047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2891  amino acid ABC transporter permease  57.4 
 
 
329 aa  309  9e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0444543  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2153  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.76 
 
 
314 aa  309  9e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.280897  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  59.84 
 
 
263 aa  307  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02270  amino acid ABC transporter membrane protein  54.14 
 
 
369 aa  307  4.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  61.48 
 
 
260 aa  306  7e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  60.64 
 
 
264 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  61.04 
 
 
254 aa  305  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.79 
 
 
543 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.406316  normal  0.927008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  60.64 
 
 
267 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0292  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.35 
 
 
510 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429579  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1185  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.84 
 
 
295 aa  303  8.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  58.02 
 
 
273 aa  303  8.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.56 
 
 
502 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1311  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.36 
 
 
512 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00935602 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.15 
 
 
510 aa  301  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4083  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.09 
 
 
500 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.52 
 
 
516 aa  299  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  60.66 
 
 
250 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  60.25 
 
 
254 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  59.84 
 
 
260 aa  298  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  60.25 
 
 
250 aa  298  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  38.42 
 
 
507 aa  296  7e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2087  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.61 
 
 
306 aa  296  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  57.83 
 
 
259 aa  294  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2799  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.66 
 
 
510 aa  294  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  60.66 
 
 
255 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  57.25 
 
 
264 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  60.25 
 
 
267 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  56.15 
 
 
263 aa  290  7e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  59.43 
 
 
256 aa  289  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0522  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.25 
 
 
306 aa  287  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  57.03 
 
 
256 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 
254 aa  286  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  57.6 
 
 
254 aa  286  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  59.18 
 
 
252 aa  286  7e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  55.97 
 
 
254 aa  286  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  57.66 
 
 
258 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  56.63 
 
 
259 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  58.02 
 
 
261 aa  285  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  59.06 
 
 
262 aa  283  9e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.79 
 
 
254 aa  281  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  56.15 
 
 
256 aa  280  5e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34670  amino acid ABC transporter membrane protein  50.29 
 
 
374 aa  280  6e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220072  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  58.5 
 
 
256 aa  279  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  54.58 
 
 
263 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6505  ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.56 
 
 
536 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.05 
 
 
276 aa  278  2e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  57.32 
 
 
255 aa  277  5e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  57.43 
 
 
250 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0868  amino acid ABC transporter permease  38.9 
 
 
532 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0885  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.9 
 
 
533 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.9 
 
 
533 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.429641  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>